; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Bhi08G001051 (gene) of Wax gourd (B227) v1 genome

Gene IDBhi08G001051
OrganismBenincasa hispida cv. B227 (Wax gourd (B227) v1)
DescriptionRibosomal protein S24/S35, mitochondrial
Genome locationchr8:38764891..38766893
RNA-Seq ExpressionBhi08G001051
SyntenyBhi08G001051
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137486.1 uncharacterized protein LOC101216147 [Cucumis sativus]3.6e-5074.85Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL
        MKRAL GAVF+VYS TLSVSPPLRTFRS  LLSPFS  +LR YSSGNDKYN LNSTKNKDSL++DDVSTEELKRKIDKFYE GD +SLP IFEAILKRKL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL

Query:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTG-EEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSS-DSEDEDRRV
        SGKHED D E+MKEIRQ++PG+VED  G EEYDSDL +        +D SD+S DSE+EDRR+
Subjt:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTG-EEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSS-DSEDEDRRV

XP_008461340.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499929 [Cucumis melo]5.0e-5274.53Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL
        MKRAL GAVFNV SRTLSVSPPLRTFRS  LLSPFS F+LR YSSGNDKYN LNSTKNKDSL++DDVSTEELKRKIDKFYE GD +SLP IFEAILKRKL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL

Query:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
        SGKHED D E+MKEIRQRMPG++ED  GEEYDS+L++             +SDSE+ED+R+
Subjt:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV

XP_022924024.1 uncharacterized protein LOC111431572 [Cucurbita moschata]5.3e-4670.48Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL
        MKRA+ GAVF   SR +S+SP L+T RSG LL  FS       R YSSGNDKYNGLNST  +NKDSL++DDVS EELKRKID+FYEGDVESLPTIFEAIL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL

Query:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
        KRKLSGKH D D E+MKEIRQR+PG+VED   EEYDSDLS ELNE+ EEM++ S    SE+EDRRV
Subjt:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV

XP_023519890.1 uncharacterized protein LOC111783221 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-4872.29Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL
        MKRA+ GAVF V SR +S+SP L+T RSG LL PFS       R YS+GNDKYNGLNST  +NKDSL++DDVS EELKRKID+FYEGDVESLPTIFEAIL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL

Query:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
        KRKLSGKH D D E+MKEIRQRMPG+VED   EEYDSDLS ELNET EEME+      SE+EDRRV
Subjt:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV

XP_038894045.1 uncharacterized protein LOC120082798 [Benincasa hispida]2.4e-78100Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAILKRKLS
        MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAILKRKLS
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAILKRKLS

Query:  GKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
        GKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
Subjt:  GKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT17 Uncharacterized protein1.7e-5074.85Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL
        MKRAL GAVF+VYS TLSVSPPLRTFRS  LLSPFS  +LR YSSGNDKYN LNSTKNKDSL++DDVSTEELKRKIDKFYE GD +SLP IFEAILKRKL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL

Query:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTG-EEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSS-DSEDEDRRV
        SGKHED D E+MKEIRQ++PG+VED  G EEYDSDL +        +D SD+S DSE+EDRR+
Subjt:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTG-EEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSS-DSEDEDRRV

A0A1S3CEX3 uncharacterized protein LOC1034999292.4e-5274.53Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL
        MKRAL GAVFNV SRTLSVSPPLRTFRS  LLSPFS F+LR YSSGNDKYN LNSTKNKDSL++DDVSTEELKRKIDKFYE GD +SLP IFEAILKRKL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL

Query:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
        SGKHED D E+MKEIRQRMPG++ED  GEEYDS+L++             +SDSE+ED+R+
Subjt:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV

A0A5D3BIA4 Uncharacterized protein2.4e-5274.53Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL
        MKRAL GAVFNV SRTLSVSPPLRTFRS  LLSPFS F+LR YSSGNDKYN LNSTKNKDSL++DDVSTEELKRKIDKFYE GD +SLP IFEAILKRKL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYE-GDVESLPTIFEAILKRKL

Query:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
        SGKHED D E+MKEIRQRMPG++ED  GEEYDS+L++             +SDSE+ED+R+
Subjt:  SGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV

A0A6J1E804 uncharacterized protein LOC1114315722.6e-4670.48Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL
        MKRA+ GAVF   SR +S+SP L+T RSG LL  FS       R YSSGNDKYNGLNST  +NKDSL++DDVS EELKRKID+FYEGDVESLPTIFEAIL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL

Query:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV
        KRKLSGKH D D E+MKEIRQR+PG+VED   EEYDSDLS ELNE+ EEM++ S    SE+EDRRV
Subjt:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV

A0A6J1KP40 uncharacterized protein LOC1114952362.4e-4470.81Show/hide
Query:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL
        MKRA+ GAVF   SR +S+ P L+T RSG LL PFS       R YSSGNDKYNGLNST  +NKDSL++D VS EELKRKID+FYEGDVESLPTIFEAIL
Subjt:  MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSF---FSLRYYSSGNDKYNGLNST--KNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAIL

Query:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSED
        KRKLSGKH D D E+MKEI QRMPG+VED   EEYDSDLS +LNET EEME+  DSS+ ED
Subjt:  KRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLS-ELNETAEEMEDFSDSSDSED

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G73770.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown4.4e-0633.07Show/hide
Query:  YYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQ----------RMPGQVE-DSTGEE
        ++SS +D   G  +        E+ +S EELK++I  F  +G+ +++P +FEA++ RKLSGKH+D D E+M  +R+           +   +E D  G+ 
Subjt:  YYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQ----------RMPGQVE-DSTGEE

Query:  YDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDE
         DSD+      ++++ D  DSSDS+ E
Subjt:  YDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDE

AT1G73770.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown4.4e-0633.07Show/hide
Query:  YYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQ----------RMPGQVE-DSTGEE
        ++SS +D   G  +        E+ +S EELK++I  F  +G+ +++P +FEA++ RKLSGKH+D D E+M  +R+           +   +E D  G+ 
Subjt:  YYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQ----------RMPGQVE-DSTGEE

Query:  YDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDE
         DSD+      ++++ D  DSSDS+ E
Subjt:  YDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDE

AT3G18240.1 Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial7.2e-0937.25Show/hide
Query:  KDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDED
        K  L+ +DVS +ELK +I+K++ EG+ ++LP + EA+L+R+L  KH + D E++++I + +P + +D   E+++SD  E + T EE+ED  +S +   E 
Subjt:  KDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDED

Query:  RR
         R
Subjt:  RR

AT3G18240.2 Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial7.2e-0937.25Show/hide
Query:  KDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDED
        K  L+ +DVS +ELK +I+K++ EG+ ++LP + EA+L+R+L  KH + D E++++I + +P + +D   E+++SD  E + T EE+ED  +S +   E 
Subjt:  KDSLIEDDVSTEELKRKIDKFY-EGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDED

Query:  RR
         R
Subjt:  RR

AT4G21460.1 Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial2.5e-0933.99Show/hide
Query:  VYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNS----TKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDK-FYEGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDD
        + S  +S + P  T  +      F FFS     SG +      S    + +K  L+ +DVS +ELK +IDK F EG+ ++LP + EA+L+R+L  KH + 
Subjt:  VYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNS----TKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDK-FYEGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDD

Query:  DHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRR
        D E+M++I + +P + +D   E+++SD  E + T EE+ED  +S +   E  R
Subjt:  DHEMMKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACGAGCTCTATTGGGAGCTGTCTTCAATGTCTATTCTCGGACGCTTTCCGTCTCTCCTCCGCTTCGAACCTTTCGCTCTGGTCTCTTACTTTCTCCCTTTTCCTT
TTTTTCTTTGCGATATTACTCATCCGGGAATGACAAGTACAATGGACTGAACTCAACCAAAAACAAGGATTCTCTCATCGAAGATGATGTCAGTACCGAAGAGCTGAAGA
GGAAAATTGATAAATTTTACGAGGGTGATGTCGAGTCATTACCAACAATTTTTGAGGCAATTTTGAAAAGGAAGCTATCGGGTAAACACGAAGATGATGATCATGAGATG
ATGAAAGAAATTCGACAACGAATGCCCGGACAAGTTGAAGATTCTACAGGTGAAGAATATGATTCAGATTTAAGTGAGTTGAATGAAACTGCTGAAGAAATGGAGGATTT
CAGTGATTCTAGTGATTCTGAAGATGAAGATAGAAGGGTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAACGAGCTCTATTGGGAGCTGTCTTCAATGTCTATTCTCGGACGCTTTCCGTCTCTCCTCCGCTTCGAACCTTTCGCTCTGGTCTCTTACTTTCTCCCTTTTCCTT
TTTTTCTTTGCGATATTACTCATCCGGGAATGACAAGTACAATGGACTGAACTCAACCAAAAACAAGGATTCTCTCATCGAAGATGATGTCAGTACCGAAGAGCTGAAGA
GGAAAATTGATAAATTTTACGAGGGTGATGTCGAGTCATTACCAACAATTTTTGAGGCAATTTTGAAAAGGAAGCTATCGGGTAAACACGAAGATGATGATCATGAGATG
ATGAAAGAAATTCGACAACGAATGCCCGGACAAGTTGAAGATTCTACAGGTGAAGAATATGATTCAGATTTAAGTGAGTTGAATGAAACTGCTGAAGAAATGGAGGATTT
CAGTGATTCTAGTGATTCTGAAGATGAAGATAGAAGGGTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKRALLGAVFNVYSRTLSVSPPLRTFRSGLLLSPFSFFSLRYYSSGNDKYNGLNSTKNKDSLIEDDVSTEELKRKIDKFYEGDVESLPTIFEAILKRKLSGKHEDDDHEM
MKEIRQRMPGQVEDSTGEEYDSDLSELNETAEEMEDFSDSSDSEDEDRRV