; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Bhi08G001641 (gene) of Wax gourd (B227) v1 genome

Gene IDBhi08G001641
OrganismBenincasa hispida cv. B227 (Wax gourd (B227) v1)
DescriptionTCP domain-containing protein
Genome locationchr8:57972048..57973747
RNA-Seq ExpressionBhi08G001641
SyntenyBhi08G001641
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005333 - Transcription factor, TCP
IPR017887 - Transcription factor TCP subgroup


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6584451.1 HVA22-like protein a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-10478.91Show/hide
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KAG7020042.1 Transcription factor TCP15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-10878.05Show/hide
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XP_004137578.1 transcription factor TCP15 [Cucumis sativus]1.8e-12682.72Show/hide
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XP_008440976.1 PREDICTED: transcription factor TCP15-like [Cucumis melo]3.7e-12783.61Show/hide
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XP_038895370.1 transcription factor TCP15-like [Benincasa hispida]2.0e-157100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSM3 TCP domain-containing protein8.9e-12782.72Show/hide
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        S
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A0A1S3B2E2 transcription factor TCP15-like1.8e-12783.61Show/hide
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         SG DPLWRLQSA NQDG+LFRSGQ  PSGGLR SN     APLTLLPGKPLSLGPT     RG +N        DDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTGVS
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A0A5D2SLT0 TCP domain-containing protein3.0e-6649.01Show/hide
Query:  LHYHQNHRSTTSFPLQLLEKKEYDN---------PQPPLEI----------------------ISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVF
        LH+H +H    +FP QLLEKKE DN         P P L +                       SK P PKRTSTKDRHTKVDGRGRR RMPALCAARVF
Subjt:  LHYHQNHRSTTSFPLQLLEKKEYDN---------PQPPLEI----------------------ISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVF

Query:  QLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSY-----------YHPGV------------------MG
        QLTRELGHK DGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANF SLN SLR S +S+S+PSQLRSS +             PG+                  +G
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Query:  INSEA-MNNMAQMTQPKQD----HH----YLQQSTTGLIPAT----TPANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLAAP
        I+ EA  +++ +  +P+QD    HH    YL QS+TG IPA+     PANFWM+++ NNQ++ SGGDP+W   S NN    L+R G  S GL F N   P
Subjt:  INSEA-MNNMAQMTQPKQD----HH----YLQQSTTGLIPAT----TPANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLAAP

Query:  LTLLPGKPL---SLGPTTAGGGRGTMN----DDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTGVS
        + LLPG+ L   S G    GGG G+       +GHLN+ A  NP    +  TGVS
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A0A5D3BGG0 Transcription factor TCP15-like7.7e-7097.2Show/hide
Query:  MEGNDQLHYHQNHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPA
        MEGNDQLHYHQNHRS  SFPLQLLEKKEYD PQPPLEI+SKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPA
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Query:  VIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPG
        VIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPG
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A0A6J1C776 transcription factor TCP15-like4.9e-9368.58Show/hide
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        +QLHY QNH  +T+FPLQLLEKKEYD + Q   E++   SKKPS KRT+TKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPA
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Query:  VIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQPKQDH-----------HYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSD
        VIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGV+  NS+   NM +MTQ K+DH            YL Q + G   A  PANFWMLSD
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Query:  PNNQLLGSGGDPLWRL---QSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLA-APLTLLPGKPLSLGPTTAGGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTGVS
              G+  + LWRL    S NNQDG    +   SGGLR +NLA  PLTLLPGKPL+LGPT      GT+ +  HLNIYAAQNPP GA PDTGVS
Subjt:  PNNQLLGSGGDPLWRL---QSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLA-APLTLLPGKPLSLGPTTAGGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTGVS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53PH2 Transcription factor PCF34.2e-3345.5Show/hide
Query:  TKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMGINS
        TKDRHTKV+GRGRR RMPALCAARVFQLTRELGHK+DGETIEWLLQQAEPA++AATGTGTIPANF+SL  SLR +A+  S P   R++ ++H     +  
Subjt:  TKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMGINS

Query:  EAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSDPNNQLLGSG---------GDPLWRLQSANNQ-DGALFRSGQPSGGLRFSNLAAPLTLLPG
        +  +++A M      HH        L+P   P       +P  Q  G+G          D L++  S  +  DGA   + Q +     +  AAP    P 
Subjt:  EAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSDPNNQLLGSG---------GDPLWRLQSANNQ-DGALFRSGQPSGGLRFSNLAAPLTLLPG

Query:  KPLSLGPTTAG
           ++GP T G
Subjt:  KPLSLGPTTAG

Q93Z00 Transcription factor TCP143.0e-3961.73Show/hide
Query:  LHYHQ-------NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEP
        LH HQ         +S  S P Q  +K+     +    + +KKP  KR STKDRHTKVDGRGRR RMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEP
Subjt:  LHYHQ-------NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEP

Query:  AVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRS-SSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQ
        +VIAATGTGTIPANF SLN SLR S +S+SLPS  RS +S + P    I S AM    Q  Q
Subjt:  AVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRS-SSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQ

Q9C518 Transcription factor TCP82.5e-3361.54Show/hide
Query:  RTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMG
        + STKDRHTKVDGRGRR RMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPA++AATGTGTIPANF++L+ SLR S +++S P       Y   G +G
Subjt:  RTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMG

Query:  INSEAMNN------MAQMTQPKQD-HHYLQ
        +     +        A  T P    HH LQ
Subjt:  INSEAMNN------MAQMTQPKQD-HHYLQ

Q9C9L2 Transcription factor TCP156.1e-4844.3Show/hide
Query:  NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIIS---------KKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVI
        +H    +FPLQLL+     +    L IIS         KKP PKRTSTKDRHTKV+GRGRR RMPA+CAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVI
Subjt:  NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIIS---------KKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVI

Query:  AATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLR---SSSYYHPGVMGI---------------NSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPAT---TP
        AATGTGTIPANF SLN SLR S +S+S  + LR   SS Y+H     +               +  + ++ +Q+    Q  +YL QST G +P +     
Subjt:  AATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLR---SSSYYHPGVMGI---------------NSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPAT---TP

Query:  ANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLAAPLTLLPGKPLSLGPTTAGGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTG
        A FW   D    L     +P      A +             G+   N AAP+ L  G+PL+ G    GGG G   +  H  + AA N  +    +TG
Subjt:  ANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLAAPLTLLPGKPLSLGPTTAGGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTG

Q9LQF0 Transcription factor TCP231.3e-3442.11Show/hide
Query:  PQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLP
        P      ++   +P +  +KDRH KVDGRGRR RMPA+CAARVFQLTREL HKSDGETIEWLLQQAEPA+IAATGTGTIPAN ++LN SLR S +++S P
Subjt:  PQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLP

Query:  SQLRSSSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLA
             S  +H G    N+       Q+  P   HH    S++  +P T      +  DPN      G         A +QD    RS       R  N+ 
Subjt:  SQLRSSSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLA

Query:  APLTLLPGKPLSLGPTTA------GGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPH
         P+  L   P S    +A      GGG G  N         A NP H
Subjt:  APLTLLPGKPLSLGPTTA------GGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35560.1 TCP family transcription factor9.3e-3642.11Show/hide
Query:  PQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLP
        P      ++   +P +  +KDRH KVDGRGRR RMPA+CAARVFQLTREL HKSDGETIEWLLQQAEPA+IAATGTGTIPAN ++LN SLR S +++S P
Subjt:  PQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLP

Query:  SQLRSSSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLA
             S  +H G    N+       Q+  P   HH    S++  +P T      +  DPN      G         A +QD    RS       R  N+ 
Subjt:  SQLRSSSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLA

Query:  APLTLLPGKPLSLGPTTA------GGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPH
         P+  L   P S    +A      GGG G  N         A NP H
Subjt:  APLTLLPGKPLSLGPTTA------GGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPH

AT1G58100.1 TCP family transcription factor1.8e-3461.54Show/hide
Query:  RTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMG
        + STKDRHTKVDGRGRR RMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPA++AATGTGTIPANF++L+ SLR S +++S P       Y   G +G
Subjt:  RTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMG

Query:  INSEAMNN------MAQMTQPKQD-HHYLQ
        +     +        A  T P    HH LQ
Subjt:  INSEAMNN------MAQMTQPKQD-HHYLQ

AT1G69690.1 TCP family transcription factor4.3e-4944.3Show/hide
Query:  NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIIS---------KKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVI
        +H    +FPLQLL+     +    L IIS         KKP PKRTSTKDRHTKV+GRGRR RMPA+CAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVI
Subjt:  NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIIS---------KKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVI

Query:  AATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLR---SSSYYHPGVMGI---------------NSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPAT---TP
        AATGTGTIPANF SLN SLR S +S+S  + LR   SS Y+H     +               +  + ++ +Q+    Q  +YL QST G +P +     
Subjt:  AATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLR---SSSYYHPGVMGI---------------NSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPAT---TP

Query:  ANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLAAPLTLLPGKPLSLGPTTAGGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTG
        A FW   D    L     +P      A +             G+   N AAP+ L  G+PL+ G    GGG G   +  H  + AA N  +    +TG
Subjt:  ANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANNQDGALFRSGQPSGGLRFSNLAAPLTLLPGKPLSLGPTTAGGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTG

AT1G72010.1 TCP family transcription factor4.3e-3374.74Show/hide
Query:  SPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSS
        S  +  TKDRHTKVDGRGRR RMPA+CAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPA+IA+TGTGTIPANF++LN SLR    S       +SSS
Subjt:  SPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSS

AT3G47620.1 TEOSINTE BRANCHED, cycloidea and PCF (TCP) 142.1e-4061.73Show/hide
Query:  LHYHQ-------NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEP
        LH HQ         +S  S P Q  +K+     +    + +KKP  KR STKDRHTKVDGRGRR RMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEP
Subjt:  LHYHQ-------NHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEP

Query:  AVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRS-SSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQ
        +VIAATGTGTIPANF SLN SLR S +S+SLPS  RS +S + P    I S AM    Q  Q
Subjt:  AVIAATGTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRS-SSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGAAATGACCAACTTCACTATCACCAAAACCATCGCTCGACTACTTCTTTTCCTCTTCAATTGTTAGAGAAGAAGGAATATGATAATCCTCAACCTCCT
CTTGAGATCATCTCTAAGAAGCCCTCTCCTAAGAGAACCTCTACTAAGGACCGTCACACCAAAGTCGATGGCCGCGGTCGTCGCACCCGAATGCCTGCTCTTTGT
GCTGCTAGAGTTTTCCAGCTTACTCGTGAGCTCGGCCACAAGTCCGATGGCGAAACCATCGAATGGCTTCTTCAGCAGGCCGAGCCTGCTGTTATTGCCGCTACC
GGTACAGGGACCATACCTGCAAACTTTAACTCTCTCAATACCTCACTAAGAAGATCGGCTACAAGCATTTCTCTACCATCTCAACTAAGATCCTCGTCTTACTAC
CACCCGGGAGTGATGGGGATCAACTCTGAAGCAATGAATAATATGGCTCAAATGACTCAACCAAAACAAGATCATCACTATCTCCAACAATCCACCACAGGGCTA
ATCCCTGCCACTACTCCGGCCAACTTTTGGATGCTTTCCGACCCCAACAACCAATTACTCGGCAGCGGAGGCGACCCTTTATGGAGGCTTCAGTCGGCCAACAAC
CAAGACGGCGCTTTATTCAGATCAGGGCAACCCTCCGGTGGTTTACGTTTTTCGAATCTGGCTGCTCCGTTGACGCTCCTCCCAGGAAAGCCACTCTCATTGGGA
CCCACTACTGCCGGAGGTGGACGTGGAACCATGAATGATGATGGGCACTTGAATATTTACGCCGCCCAAAATCCGCCGCATGGGGCGGCGCCCGACACCGGTGTC
TCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGGAAATGACCAACTTCACTATCACCAAAACCATCGCTCGACTACTTCTTTTCCTCTTCAATTGTTAGAGAAGAAGGAATATGATAATCCTCAACCTCCT
CTTGAGATCATCTCTAAGAAGCCCTCTCCTAAGAGAACCTCTACTAAGGACCGTCACACCAAAGTCGATGGCCGCGGTCGTCGCACCCGAATGCCTGCTCTTTGT
GCTGCTAGAGTTTTCCAGCTTACTCGTGAGCTCGGCCACAAGTCCGATGGCGAAACCATCGAATGGCTTCTTCAGCAGGCCGAGCCTGCTGTTATTGCCGCTACC
GGTACAGGGACCATACCTGCAAACTTTAACTCTCTCAATACCTCACTAAGAAGATCGGCTACAAGCATTTCTCTACCATCTCAACTAAGATCCTCGTCTTACTAC
CACCCGGGAGTGATGGGGATCAACTCTGAAGCAATGAATAATATGGCTCAAATGACTCAACCAAAACAAGATCATCACTATCTCCAACAATCCACCACAGGGCTA
ATCCCTGCCACTACTCCGGCCAACTTTTGGATGCTTTCCGACCCCAACAACCAATTACTCGGCAGCGGAGGCGACCCTTTATGGAGGCTTCAGTCGGCCAACAAC
CAAGACGGCGCTTTATTCAGATCAGGGCAACCCTCCGGTGGTTTACGTTTTTCGAATCTGGCTGCTCCGTTGACGCTCCTCCCAGGAAAGCCACTCTCATTGGGA
CCCACTACTGCCGGAGGTGGACGTGGAACCATGAATGATGATGGGCACTTGAATATTTACGCCGCCCAAAATCCGCCGCATGGGGCGGCGCCCGACACCGGTGTC
TCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGNDQLHYHQNHRSTTSFPLQLLEKKEYDNPQPPLEIISKKPSPKRTSTKDRHTKVDGRGRRTRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVIAAT
GTGTIPANFNSLNTSLRRSATSISLPSQLRSSSYYHPGVMGINSEAMNNMAQMTQPKQDHHYLQQSTTGLIPATTPANFWMLSDPNNQLLGSGGDPLWRLQSANN
QDGALFRSGQPSGGLRFSNLAAPLTLLPGKPLSLGPTTAGGGRGTMNDDGHLNIYAAQNPPHGAAPDTGVS