; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G00850 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G00850
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCentromere protein X
Genome locationChr1:519559..520590
RNA-Seq ExpressionCSPI01G00850
SyntenyCSPI01G00850
Gene Ontology termsGO:0006281 - DNA repair (biological process)
GO:0051382 - kinetochore assembly (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR018552 - Centromere protein X


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057803.1 centromere protein X isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-4496.12Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLL
          L
Subjt:  QLL

TYJ98487.1 centromere protein X isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-4595.19Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLLL
        Q+++
Subjt:  QLLL

XP_008464489.1 PREDICTED: centromere protein X isoform X2 [Cucumis melo]1.1e-4798.11Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

XP_031736273.1 protein MHF2 homolog isoform X1 [Cucumis sativus]1.9e-4789.08Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCE-------------VDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCE             VDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCE-------------VDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI

Query:  SRIEPTHLERVLPQLLLDF
        SRIEPTHLERVLPQLLLDF
Subjt:  SRIEPTHLERVLPQLLLDF

XP_031736274.1 protein MHF2 homolog isoform X2 [Cucumis sativus]3.1e-50100Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU58 Uncharacterized protein1.5e-50100Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

A0A1S3CLJ8 centromere protein X isoform X12.8e-4493.46Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFI-SEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVL
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLV   I +EAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVL
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFI-SEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVL

Query:  PQLLLDF
        PQLLLDF
Subjt:  PQLLLDF

A0A1S3CLK5 centromere protein X isoform X25.4e-4898.11Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

A0A5A7UPL0 Centromere protein X isoform X27.2e-4596.12Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLL
          L
Subjt:  QLL

A0A5D3BH88 Centromere protein X isoform X28.5e-4695.19Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLP

Query:  QLLL
        Q+++
Subjt:  QLLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A8MT69 Centromere protein X4.6e-0441.38Show/hide
Query:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF
        K      + +AL+L  +L+++F+ EA  R    A+AE   R++   LE+VLPQLLLDF
Subjt:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF

P0DJH7 Centromere protein X1.3e-0649.02Show/hide
Query:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF
        N +AL L ++L+++F+ EA  RAA  A+AE + +++  H+E+VLPQLLLDF
Subjt:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF

Q2NKU0 Centromere protein X8.3e-0643.1Show/hide
Query:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF
        K +    + +AL+L ++L++IF+ EA  R+   A+AEG++ ++   LE+VLPQLLLDF
Subjt:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF

Q8C4X1 Centromere protein X4.6e-0445.1Show/hide
Query:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF
        + +AL+L ++ ++IF+ EA  R    A+AE +  +E   LE+VLPQLLLDF
Subjt:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF

Q8L7N3 Protein MHF2 homolog1.6e-2563.73Show/hide
Query:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDC-EVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLL
        F  DLIHAIFK  W+RR  ERE++    DA+D  E +   GT+KK+R  SANANALKLS +L++ F+SEAVQRAA IAEAEG+ +IE THLER+LPQLLL
Subjt:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDC-EVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLL

Query:  DF
        DF
Subjt:  DF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G78790.1 unknown protein1.1e-2663.73Show/hide
Query:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDC-EVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLL
        F  DLIHAIFK  W+RR  ERE++    DA+D  E +   GT+KK+R  SANANALKLS +L++ F+SEAVQRAA IAEAEG+ +IE THLER+LPQLLL
Subjt:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDC-EVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLL

Query:  DF
        DF
Subjt:  DF

AT1G78790.2 unknown protein2.2e-1751.96Show/hide
Query:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDC-EVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLL
        F  DLIHAIFK  W+RR  ERE++    DA+D  E +   GT+KK+R                    SEAVQRAA IAEAEG+ +IE THLER+LPQLLL
Subjt:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDC-EVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLL

Query:  DF
        DF
Subjt:  DF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGAGACCGGATTTCATCCTGATCTAATTCACGCCATTTTCAAGCTCGAGTGGAGCAGAAGATCACTTGAGCGCGAGAAAAACGAGAATAATCCGGATGCTATGGA
TTGCGAGGTTGACGCTGGGGCTGGAACATCCAAGAAAAGCAGGCCGATGTCAGCTAATGCAAATGCTCTTAAATTGAGCTCTAAACTTGTACAAATTTTTATCTCAGAGG
CTGTGCAGCGCGCTGCAACAATTGCTGAAGCAGAAGGTATTAGCAGAATTGAACCCACTCATTTGGAGAGAGTTCTTCCGCAGTTACTACTGGATTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGAGACCGGATTTCATCCTGATCTAATTCACGCCATTTTCAAGCTCGAGTGGAGCAGAAGATCACTTGAGCGCGAGAAAAACGAGAATAATCCGGATGCTATGGA
TTGCGAGGTTGACGCTGGGGCTGGAACATCCAAGAAAAGCAGGCCGATGTCAGCTAATGCAAATGCTCTTAAATTGAGCTCTAAACTTGTACAAATTTTTATCTCAGAGG
CTGTGCAGCGCGCTGCAACAATTGCTGAAGCAGAAGGTATTAGCAGAATTGAACCCACTCATTTGGAGAGAGTTCTTCCGCAGTTACTACTGGATTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENNPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGISRIEPTHLERVLPQLLLDF