; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G01270 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G01270
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionBAT2_N domain-containing protein
Genome locationChr1:803591..806098
RNA-Seq ExpressionCSPI01G01270
SyntenyCSPI01G01270
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057843.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold274G001300 [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-16597.13Show/hide
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        FFPSN ATV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LS19 Uncharacterized protein1.3e-17299.37Show/hide
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A0A1S3CLW8 uncharacterized protein LOC1035024001.8e-16697.15Show/hide
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A0A5D3BHC7 Uncharacterized protein2.0e-16597.13Show/hide
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A0A6J1C043 uncharacterized protein LOC1110072521.2e-14987.42Show/hide
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A0A6J1E2A7 uncharacterized protein LOC1114301328.2e-15190.19Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48460.1 unknown protein9.5e-3532.93Show/hide
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        + G  G   F    +   E  ++  +  Q  +  FLW + P VL++S I P  +L  ++   F++  + + +  F  E +FY G+A+FL + DR +R   
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         D     +  ++   G   S+  T+ L +++P+  + + WP  G  A   + P+LVG  VQ  FE    R+ S  WP++PIVF+VYRL+Q+ RAA  V  
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Query:  LSFTIKGAEMTPNNLAINSSLGTLLNVLQCLGIICIWSLSSFLMRFFPS
        L F +K A  T        +L  L+  LQ L ++C+WS  +FLMR FPS
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AT3G60590.2 unknown protein1.6e-1028.57Show/hide
Query:  FISFYNHSKEGKRIPLSSVQSNQYKF------LWFVGPAVLVASFIFPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTAEPDT
        F S  + S E +++ +S+ Q    +       +W +GP+VL+ S + P+L+L   LS++F  S +   L L   + +F  G  +FL + D   R  +P  
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Query:  LKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTM-----GL---VWPWTGPAASAT-LAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVIPIVFQVYRLHQLNRA
          NS    S +F    S    L +  ++PM+ +     GL   + P     +SA  L PY + + VQ   E      +S  W V P+V++ YR+ QL R 
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          L
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AT3G60590.3 unknown protein1.6e-1028.57Show/hide
Query:  FISFYNHSKEGKRIPLSSVQSNQYKF------LWFVGPAVLVASFIFPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTAEPDT
        F S  + S E +++ +S+ Q    +       +W +GP+VL+ S + P+L+L   LS++F  S +   L L   + +F  G  +FL + D   R  +P  
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Query:  LKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTM-----GL---VWPWTGPAASAT-LAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVIPIVFQVYRLHQLNRA
          NS    S +F    S    L +  ++PM+ +     GL   + P     +SA  L PY + + VQ   E      +S  W V P+V++ YR+ QL R 
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          L
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AT5G63040.1 unknown protein9.7e-8861.62Show/hide
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        S   R++  L  A SE +  + E    + + V+     E    +++S + Y    GKPGFISFYN   + + I +    QS   + LW +GPAVLV+SFI
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Query:  FPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTA--EPDTLKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTMGLVWPWTGPAA
         P +YLR+++S +FEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVA FL +IDRSR+ +   P    N      +Q GQRISSVATL LSL+IPMVTMG VWPWTGPAA
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        SATLAPYLVGIVVQFAFEQYAR + S S P+IPI+FQVYRLHQLNRAAQLVTALSFT+KGAE T NNLAI  SLGTLLNV+Q LG+I IWS+SSFLM
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AT5G63040.2 unknown protein9.7e-8861.62Show/hide
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        S   R++  L  A SE +  + E    + + V+     E    +++S + Y    GKPGFISFYN   + + I +    QS   + LW +GPAVLV+SFI
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         P +YLR+++S +FEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVA FL +IDRSR+ +   P    N      +Q GQRISSVATL LSL+IPMVTMG VWPWTGPAA
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Sequences Show/hide sequences
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ATTTCCCAAGATGTTTGTCTCATTTAAATCCAATGGCAATGTTTTTGTTTTTAATTACTAAATGTTATGTTCTTGGTTCACTTTTGGAATTGTGCATAGTTGAATCCATC
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TTTAATTGATCGTTCAAGGAGAACTGCTGAACCTGACACTCTGAAAAACAGTTATCAAACCCTGTCTAATCAATTTGGACAGAGGATCTCTTCTGTAGCTACCTTAGCAC
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TTCAATGACAATTTTTGTTGTGTATCTGCTAAATGAGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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