; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G01980 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G01980
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionMajor facilitator superfamily protein
Genome locationChr1:1302123..1302661
RNA-Seq ExpressionCSPI01G01980
SyntenyCSPI01G01980
Gene Ontology termsGO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022857 - transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587515.1 Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-3070.83Show/hide
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KAG7021495.1 Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.0e-3171.88Show/hide
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KGN63639.1 hypothetical protein Csa_013737 [Cucumis sativus]1.7e-5798.26Show/hide
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XP_022933362.1 uncharacterized protein LOC111440723 [Cucurbita moschata]6.0e-3171.88Show/hide
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XP_023530984.1 uncharacterized protein LOC111793373 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-3171.88Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LRL3 Uncharacterized protein8.1e-5898.26Show/hide
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A0A2P5CJ35 Major facilitator2.1e-2150.49Show/hide
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A0A6J1BYJ5 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC1110069082.3e-2871.28Show/hide
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A0A6J1EZJ6 uncharacterized protein LOC1114407232.9e-3171.88Show/hide
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A0A6J1IDG8 uncharacterized protein LOC1114715791.2e-2175Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18940.1 Nodulin-like / Major Facilitator Superfamily protein2.0e-1645.83Show/hide
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AT1G74780.1 Nodulin-like / Major Facilitator Superfamily protein1.3e-1552.31Show/hide
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        +N+++++  ++FWLLF  M  GMGSGL+  +N+ Q+ +SL Y +V+IN+ VSLWSIWNFLGR G+
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AT2G34350.1 Nodulin-like / Major Facilitator Superfamily protein1.1e-1952.22Show/hide
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        TE   +    K+N   ++  V   +MN++E+I T NFWLLF  M  GMGSGLA  +N+ Q+ +SL Y TVQ+N+ VSLWSIWNFLGR GS
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AT2G34355.1 Major facilitator superfamily protein1.2e-1860.61Show/hide
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        + NI+E++ TVNFWLLF  M  GMGSG A  +NM Q+ +SL Y +VQ+N+ VSLWSIWNFLGR G+
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AT3G01930.1 Major facilitator superfamily protein1.3e-1245.59Show/hide
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        +  +  + +++   +FWL+FF++  G GSGL + DN+ Q+SQSLGY    +  FVS+ SIWNFLGR+G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACTTCAAATTACCGATGACCCCACTGAATATCACTGCGTTCCTAGTGAGGAAAAGATCAATGATGAGCTAATGATTGTGAAAGATAGAGAAATGAATATAATCGA
GTCAATCGGCACAGTGAACTTCTGGCTATTGTTTTTCACGATGACGTGGGGAATGGGATCTGGGTTAGCCATCACAGACAACATGAACCAACTCAGCCAGTCTTTAGGAT
ACAGAACAGTCCAGATCAACACCTTCGTTTCACTTTGGAGCATTTGGAATTTCCTTGGTCGTTTGGGATCTGCTATGCCTCTGATCTTCTCCTCTGGAAATTTAATGGCC
TTGTCTCGTTACCAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAATTGTTGCTTTGGAAGCTCTGTTTTATAGAATTCTGTCTTATGGTAAGCTCTACCGAGATGGATTCATATCTCCGCCTTCAATCTCCTCCTCATTCTTGCTTCCCCT
CTCGTCATCCCAATCAGAACAAAAACAGAGGAATCTGTTTTCAAAATGAAACTTCAAATTACCGATGACCCCACTGAATATCACTGCGTTCCTAGTGAGGAAAAGATCAA
TGATGAGCTAATGATTGTGAAAGATAGAGAAATGAATATAATCGAGTCAATCGGCACAGTGAACTTCTGGCTATTGTTTTTCACGATGACGTGGGGAATGGGATCTGGGT
TAGCCATCACAGACAACATGAACCAACTCAGCCAGTCTTTAGGATACAGAACAGTCCAGATCAACACCTTCGTTTCACTTTGGAGCATTTGGAATTTCCTTGGTCGTTTG
GGATCTGCTATGCCTCTGATCTTCTCCTCTGGAAATTTAATGGCCTTGTCTCGTTACCAATGACCGTCGGCCATATCATCGTAGTTTTAGGATTTCGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKLQITDDPTEYHCVPSEEKINDELMIVKDREMNIIESIGTVNFWLLFFTMTWGMGSGLAITDNMNQLSQSLGYRTVQINTFVSLWSIWNFLGRLGSAMPLIFSSGNLMA
LSRYQ