CuGenDBv2

Gene ID	CSPI01G04480
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	Chr1:2808542..2813273
RNA-Seq Expression	CSPI01G04480
Synteny	CSPI01G04480
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR021562 - Protein of unknown function DUF3007

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137355.1 uncharacterized protein LOC101203378 [Cucumis sativus]

1.4e-107

100

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_008453500.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494194 [Cucumis melo]

9.0e-102

95.71

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT GCSN RIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYG FARERGTSRRLSKKEQ+DFPRKGFF TRKVVLTVPKDSSSSNTSSSN+D TNQ+EQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYD MQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_022925672.1 uncharacterized protein LOC111433018 [Cucurbita moschata]

8.2e-95

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVYGHFARERG+S RLSKKE+IDFP KGFFGT++VV+TVP+DSSSSNTSSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_023529460.1 uncharacterized protein LOC111792315 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.1e-94

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVYGHFARERG+S+R+SKKE IDFP KGFFGT+KVVLTV +DSSSSNTSSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

XP_038880733.1 uncharacterized protein LOC120072335 [Benincasa hispida]

2.2e-100

92.86

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT GCSNSRIF EREGTLFLGISAAPVLPQ ARVYGHFARERGTSRRLSKKEQ+DFPRKGFF TRKVVLTVP+DSSSSNTS+S +D TNQ+E+TPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLK+GLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAEL+ALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LPZ9 Uncharacterized protein

7.0e-108

100

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

A0A1S3BX71 uncharacterized protein LOC103494194

4.4e-102

95.71

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT GCSN RIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYG FARERGTSRRLSKKEQ+DFPRKGFF TRKVVLTVPKDSSSSNTSSSN+D TNQ+EQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYD MQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSASSEQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

A0A6J1E245 uncharacterized protein LOC111430086

3.2e-89

85.51

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MA+FT GCS SR F EREGTL LGI AA  LPQ A VYGHFARE GTSR+LSK+E +DFPRKGFF TRKVVLTVP+DSSSSNTSSS DD T++ EQTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAEL+ LLEQV+EEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSE
        SQS S +
Subjt:  SQSASSE

A0A6J1EFX7 uncharacterized protein LOC111433018

4.0e-95

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVYGHFARERG+S RLSKKE+IDFP KGFFGT++VV+TVP+DSSSSNTSSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

A0A6J1IDW5 uncharacterized protein LOC111471752

3.4e-94

88.57

Show/hide

Query:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG
        MAVFT G  NSRIF EREGTLFLG SAAPVLPQ ARVY HFARERG+S+RLSKKE IDFP KGFFGT+KVVLTVP+DSSSSN SSS DD TNQ++QTPFG
Subjt:  MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFG

Query:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK
        YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLE+AG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALLEQVEEEK
Subjt:  YTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEK

Query:  SQSASSEQVN
        SQSAS EQVN
Subjt:  SQSASSEQVN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G17930.1 unknown protein

1.7e-45

73.17

Show/hide

Query:  SSNTSSSNDDSTNQTEQTPFGYTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQK
        SSN++ + DDS  +T+ TPFGYTRKDV+LIG+GVT LG GL+SGLEY G DP+QAGN VQL+LVLGLTLGWISTY+FRV +K+MTYAQQLRDYE +VMQK
Subjt:  SSNTSSSNDDSTNQTEQTPFGYTRKDVLLIGLGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQK

Query:  RLESLTEAELVALLEQVEEEKSQ
        RLESL+EAEL AL+ QV+EEK++
Subjt:  RLESLTEAELVALLEQVEEEKSQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGTTTTTACTCTTGGATGCTCCAATTCCAGAATTTTTTCTGAAAGGGAAGGGACCTTGTTTTTAGGTATTTCGGCAGCTCCTGTTTTGCCACAGAGTGCGAGAGT
TTACGGACATTTTGCGAGAGAGAGAGGAACTAGTCGACGGTTGTCAAAAAAGGAACAAATTGATTTCCCAAGGAAAGGATTTTTTGGCACAAGGAAAGTTGTCCTCACAG
TCCCTAAGGACAGTAGTTCTTCAAACACAAGCAGCAGCAATGACGACTCTACAAATCAAACCGAGCAAACACCTTTTGGTTACACGAGGAAGGATGTTTTATTAATTGGT
TTAGGTGTCACAGTTCTTGGATTTGGATTGAAAAGTGGATTAGAGTATGCTGGATATGATCCTATGCAAGCAGGTAACGTCGTTCAGCTTGTTCTAGTTTTGGGTTTAAC
GCTAGGATGGATTTCCACGTACATGTTCAGAGTTTCAAGCAAGGACATGACATATGCTCAACAACTACGTGACTATGAAGACAAAGTCATGCAGAAACGCCTTGAAAGCC
TTACAGAAGCAGAGCTCGTAGCATTACTCGAACAAGTCGAGGAAGAAAAGAGTCAATCAGCAAGCAGCGAGCAGGTTAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ACTCCACAAGCTAAGGTTGAGCTATGAACCAATCATCCGTTGCATCTTCTTAACTAATTTCATCCGTTCCACCTTCGAATCTTCACATTATTCCTCTTCTTCCTCCTCCT
GCAGTTGGATTGATCAATTTCCTGCAACCACTCCTCTTCTGATACGTGACAAGCGTTCCGGAATGGCTGTTTTTACTCTTGGATGCTCCAATTCCAGAATTTTTTCTGAA
AGGGAAGGGACCTTGTTTTTAGGTATTTCGGCAGCTCCTGTTTTGCCACAGAGTGCGAGAGTTTACGGACATTTTGCGAGAGAGAGAGGAACTAGTCGACGGTTGTCAAA
AAAGGAACAAATTGATTTCCCAAGGAAAGGATTTTTTGGCACAAGGAAAGTTGTCCTCACAGTCCCTAAGGACAGTAGTTCTTCAAACACAAGCAGCAGCAATGACGACT
CTACAAATCAAACCGAGCAAACACCTTTTGGTTACACGAGGAAGGATGTTTTATTAATTGGTTTAGGTGTCACAGTTCTTGGATTTGGATTGAAAAGTGGATTAGAGTAT
GCTGGATATGATCCTATGCAAGCAGGTAACGTCGTTCAGCTTGTTCTAGTTTTGGGTTTAACGCTAGGATGGATTTCCACGTACATGTTCAGAGTTTCAAGCAAGGACAT
GACATATGCTCAACAACTACGTGACTATGAAGACAAAGTCATGCAGAAACGCCTTGAAAGCCTTACAGAAGCAGAGCTCGTAGCATTACTCGAACAAGTCGAGGAAGAAA
AGAGTCAATCAGCAAGCAGCGAGCAGGTTAATTGAAGTCATTTCTATACCTGTTTTTTAGAAGTTCTCGGACTAGAAATTGAGGAGCAGGGTCTTGTGCATAGTATTCTA
TATGGGAACAGTGTAGAATAAGTTTGAGTAGCTTAAATAATGCATTTTAGTAATCTATTCTTAGGATAATAAATCAAAACTACCTTATGACAAATATTCTTTAAACTATT
TTTTTTAGTACAAATAGGAAATGAGAGATTAAACTTCTTACGCATGGG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAVFTLGCSNSRIFSEREGTLFLGISAAPVLPQSARVYGHFARERGTSRRLSKKEQIDFPRKGFFGTRKVVLTVPKDSSSSNTSSSNDDSTNQTEQTPFGYTRKDVLLIG
LGVTVLGFGLKSGLEYAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSSKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEKSQSASSEQVN

CSPI01G04480 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome