; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G05430 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G05430
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionpectinesterase 3
Genome locationChr1:3504194..3505219
RNA-Seq ExpressionCSPI01G05430
SyntenyCSPI01G05430
Gene Ontology termsGO:0043086 - negative regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0030599 - pectinesterase activity (molecular function)
GO:0046910 - pectinesterase inhibitor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006501 - Pectinesterase inhibitor domain
IPR035513 - Invertase/pectin methylesterase inhibitor domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652503.1 hypothetical protein Csa_013672 [Cucumis sativus]2.0e-13299.21Show/hide
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XP_004137577.1 pectinesterase 3 [Cucumis sativus]2.0e-13299.21Show/hide
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XP_023001663.1 pectinesterase 3 [Cucurbita maxima]8.3e-8671.94Show/hide
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         +ESCL+G+EEMD+TSF EVK RM+KS EYVSN LAIVANIHVIL+KF MPLH
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XP_038895980.1 pectinesterase 3 [Benincasa hispida]1.1e-9075.4Show/hide
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        +ESCLEG+EEMD+TSF+EVK RMKKSIEYVSNSLAIVANIHVIL  F+MPLH
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVF4 PMEI domain-containing protein9.8e-13399.21Show/hide
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A0A1S3B0W1 pectinesterase 31.7e-12492.86Show/hide
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A0A5A7T3U1 Pectinesterase 31.7e-12492.86Show/hide
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A0A6J1EDL6 pectinesterase 32.9e-8471.43Show/hide
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A0A6J1KR63 pectinesterase 34.0e-8671.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q43111 Pectinesterase 35.5e-3233.46Show/hide
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        TRYP+SCF+SI SL  S   DPEL+  LSL+V+++ELS+    L++   E D     A+  C S   DA+ ++NDS++ + G    +  + + + N++TW
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        +S+A+T++++CL+ V E+++T    + +E++  M+ S E+ SNSLAIV  I  +L +F  P+H
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Q43867 Pectinesterase 13.1e-2733.21Show/hide
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        MD +N+ KGY K+     DL             K  T     LL     +IS ++L A+II+ +V   +H     STP      T +  ++  +C+VTR+
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Query:  PNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMS
        P SC +SI  L SS   DPE +  LSL+V ++EL ++S   + +  E  D    +AL+ C   IEDA+ ++ND+V+ +     +KTL+ SKI +++TW+S
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Query:  SAMTNEESCLEGVEEM--------DATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
        + +T+ E+C + ++E+        ++T  + +K  M +S E+ SNSLAIV+ I   L    +P+H
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Q8GX86 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 212.8e-1224.63Show/hide
Query:  ISALLLTALIISLIVGVYIHNSTPDNK-SSSTNAA-HTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGG-EGDGG
        IS++LL ++++++ VGV ++    D+K  +  NA+   +  VC  T Y  +C  ++   N     DP  ++  +  V++ ++++ ++  +++   + D  
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Query:  AAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKF
           AL  C+  ++ A+ ++++S  E+  G  E  L +  + N++ W+S+A+++EE+CLEG +     + E +K+ +K +IE   N LAI++ +   + + 
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Query:  NMP
         +P
Subjt:  NMP

Q9LUL8 Putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 263.8e-2537.33Show/hide
Query:  FAAAISALLLTALIISLIVGVYIH-------NSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKS
        +   IS  +L A+IIS  V + IH       + TP +    T AA ++  VC+VT YP SCF+SI  L  S   DPE+I  LSLQV ++EL+++    K 
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Query:  VGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFE---EVKRRMKKSIEYVSNSLA
        +  E  D G  +AL  C+  ++ AI +VN++V+ M    G+K L  + I ++ TW+S+A+T   +CL+ ++E+  T+     ++K  M  S E+ SNSLA
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Query:  IVANIHVILDKFNMPLH
        IVA I   +  F +P+H
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Q9SB38 Pectinesterase inhibitor 48.8e-1427.18Show/hide
Query:  LLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSS---TNAAHT--ISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAA
        +L  +++SL + V+I++S     +++   T   HT  +   CN T YP  C+  + S +S+ + DP  +   SL +++    N +  + ++  +     +
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Query:  ---AALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEE--MDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVAN
           + LKDC  +++D I ++  +VAEM+   G    TE  + N++TW+SSA+T+E +C +G EE  ++  + ++VK+ + +  +  SN+LA++ +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23205.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein6.3e-1527.54Show/hide
Query:  LLLRFAAAISALLLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSV--
        LL  F A++  L+LT           +H+ + D+    T+        CN T YP+ CF+S+ S +SS   DP L+   ++ V+L +  +++ +L ++  
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Query:  -------GGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRG--GSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEM-DATSFEEVKRRMKKSIEYV
                G     AAA   DC   ++DA+ ++  S+ +MR    +G       ++ N+QTW+S+A+T+EE+C +G +++ D    +++  R+    +  
Subjt:  -------GGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRG--GSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEM-DATSFEEVKRRMKKSIEYV

Query:  SNSLAIV
        SN+LA+V
Subjt:  SNSLAIV

AT1G53840.1 pectin methylesterase 12.2e-2833.21Show/hide
Query:  MDQINALKGYAKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFAAAISALLLTALIISLIVGVYIH----NSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRY
        MD +N+ KGY K+     DL             K  T     LL     +IS ++L A+II+ +V   +H     STP      T +  ++  +C+VTR+
Subjt:  MDQINALKGYAKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFAAAISALLLTALIISLIVGVYIH----NSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRY

Query:  PNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMS
        P SC +SI  L SS   DPE +  LSL+V ++EL ++S   + +  E  D    +AL+ C   IEDA+ ++ND+V+ +     +KTL+ SKI +++TW+S
Subjt:  PNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMS

Query:  SAMTNEESCLEGVEEM--------DATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH
        + +T+ E+C + ++E+        ++T  + +K  M +S E+ SNSLAIV+ I   L    +P+H
Subjt:  SAMTNEESCLEGVEEM--------DATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH

AT2G01610.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein8.5e-2032.97Show/hide
Query:  PDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNE-------LSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQV
        P   +++TN    I   CN T YP+ CFTS+    S+ Q  P  +  L++ VSL++       LS +SR      G+G   A+A ++DC S +EDA+ ++
Subjt:  PDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNE-------LSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQV

Query:  NDSVAEMR------GGSGEKTLTES---KIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSF--EEVKRRMKKSIEYVSNSLAIV
          S+ ++R      GG+  +   E+   ++ N+QTWMS+A+T+E++C +G E+MD        V  R+++     SN+LA+V
Subjt:  NDSVAEMR------GGSGEKTLTES---KIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSF--EEVKRRMKKSIEYVSNSLAIV

AT3G14300.1 pectinesterase family protein2.7e-2637.33Show/hide
Query:  FAAAISALLLTALIISLIVGVYIH-------NSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKS
        +   IS  +L A+IIS  V + IH       + TP +    T AA ++  VC+VT YP SCF+SI  L  S   DPE+I  LSLQV ++EL+++    K 
Subjt:  FAAAISALLLTALIISLIVGVYIH-------NSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSSPQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKS

Query:  VGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFE---EVKRRMKKSIEYVSNSLA
        +  E  D G  +AL  C+  ++ AI +VN++V+ M    G+K L  + I ++ TW+S+A+T   +CL+ ++E+  T+     ++K  M  S E+ SNSLA
Subjt:  VGGE-GDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFE---EVKRRMKKSIEYVSNSLA

Query:  IVANIHVILDKFNMPLH
        IVA I   +  F +P+H
Subjt:  IVANIHVILDKFNMPLH

AT3G47670.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein1.5e-2936Show/hide
Query:  MDQINALKGYAKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFA-AAISALLLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNS
        M+ IN LKGY K++     + H    P  KP+S       FS     A  ++ +LLL   +++L  G + H+       SS     ++  +C+VTRYP +
Subjt:  MDQINALKGYAKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFA-AAISALLLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNS

Query:  CFTSI-FSLNSSPQP-DPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEM---RGGSGEKTLTESKIGNIQTWM
        CF S+  SLN S    +PE IL LSL+V+  E+SN+S   +S+    D    AA+ DC     DA+SQ+NDS+ E+   +   G   LTE  +G+++TW+
Subjt:  CFTSI-FSLNSSPQP-DPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEM---RGGSGEKTLTESKIGNIQTWM

Query:  SSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVIL
        S+AMT+ E+C +G+EEM      E+K++M+ + + +S SLAIV+ +  +L
Subjt:  SSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVKRRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVIL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCAAATCAATGCTCTCAAAGGCTATGCCAAACTCACTCACCTCAACCTCGACCTCGAACATCAAATTCCCCCACCCCCCTCCAAACCAAACTCCAAATTCCCCAC
CAACCACAATTTTTCTCTCCTACTCCGCTTCGCCGCCGCCATCTCCGCCCTCCTCCTCACCGCTCTAATCATCAGTCTGATCGTCGGAGTCTACATCCACAACTCCACCC
CCGACAACAAATCATCATCCACTAACGCTGCCCACACAATCAGCATCGTCTGCAACGTAACTCGTTACCCTAATTCCTGCTTCACCTCAATCTTTTCTCTCAATTCCTCT
CCCCAACCCGACCCCGAACTCATTTTAAACCTCTCTCTCCAAGTTTCCCTAAACGAGCTCTCCAATATGTCCCGATGGCTAAAAAGCGTAGGTGGAGAGGGCGACGGAGG
AGCAGCAGCAGCTTTGAAGGACTGCCAGAGCCAAATCGAAGACGCAATTAGCCAAGTCAATGATTCGGTAGCAGAAATGAGAGGCGGTTCCGGGGAGAAGACGTTGACGG
AGAGTAAGATCGGGAACATTCAGACGTGGATGAGCAGTGCGATGACGAATGAGGAAAGCTGTTTGGAGGGAGTGGAGGAGATGGATGCGACGTCGTTTGAAGAGGTGAAG
AGGAGGATGAAAAAGTCCATAGAATACGTAAGCAACAGCTTGGCCATCGTGGCTAACATCCACGTCATTCTTGACAAATTTAATATGCCACTTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAATAAATGAAAACTGTGGGTTTATCTTTGACTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTGCAAACTTGAAAGGAACGAACTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTCT
AAATTTGAACAGAAACCGATCAATTTGTAAAATCATGGATCAAATCAATGCTCTCAAAGGCTATGCCAAACTCACTCACCTCAACCTCGACCTCGAACATCAAATTCCCC
CACCCCCCTCCAAACCAAACTCCAAATTCCCCACCAACCACAATTTTTCTCTCCTACTCCGCTTCGCCGCCGCCATCTCCGCCCTCCTCCTCACCGCTCTAATCATCAGT
CTGATCGTCGGAGTCTACATCCACAACTCCACCCCCGACAACAAATCATCATCCACTAACGCTGCCCACACAATCAGCATCGTCTGCAACGTAACTCGTTACCCTAATTC
CTGCTTCACCTCAATCTTTTCTCTCAATTCCTCTCCCCAACCCGACCCCGAACTCATTTTAAACCTCTCTCTCCAAGTTTCCCTAAACGAGCTCTCCAATATGTCCCGAT
GGCTAAAAAGCGTAGGTGGAGAGGGCGACGGAGGAGCAGCAGCAGCTTTGAAGGACTGCCAGAGCCAAATCGAAGACGCAATTAGCCAAGTCAATGATTCGGTAGCAGAA
ATGAGAGGCGGTTCCGGGGAGAAGACGTTGACGGAGAGTAAGATCGGGAACATTCAGACGTGGATGAGCAGTGCGATGACGAATGAGGAAAGCTGTTTGGAGGGAGTGGA
GGAGATGGATGCGACGTCGTTTGAAGAGGTGAAGAGGAGGATGAAAAAGTCCATAGAATACGTAAGCAACAGCTTGGCCATCGTGGCTAACATCCACGTCATTCTTGACA
AATTTAATATGCCACTTCACTAATTTTTATTTTTAAAATGTAATCATCATCACCATCATCATCATGTTCAATACAAATACCCCTTTGTTTGTTTGTTTTTCTTTTAATTT
CCTCAATGAAAAGAAAAAATAAATAGTCCTTGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDQINALKGYAKLTHLNLDLEHQIPPPPSKPNSKFPTNHNFSLLLRFAAAISALLLTALIISLIVGVYIHNSTPDNKSSSTNAAHTISIVCNVTRYPNSCFTSIFSLNSS
PQPDPELILNLSLQVSLNELSNMSRWLKSVGGEGDGGAAAALKDCQSQIEDAISQVNDSVAEMRGGSGEKTLTESKIGNIQTWMSSAMTNEESCLEGVEEMDATSFEEVK
RRMKKSIEYVSNSLAIVANIHVILDKFNMPLH