; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G05640 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G05640
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 45
Genome locationChr1:3588888..3589480
RNA-Seq ExpressionCSPI01G05640
SyntenyCSPI01G05640
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR038821 - CLE-related protein 45-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036085.1 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 45 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-4694.74Show/hide
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KAG6584463.1 hypothetical protein SDJN03_20395, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-3784.88Show/hide
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KAG6607448.1 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-2773.03Show/hide
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KAG7037105.1 hypothetical protein SDJN02_00726, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.5e-2375.34Show/hide
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KGN64003.1 hypothetical protein Csa_013092 [Cucumis sativus]3.1e-49100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQI0 Uncharacterized protein1.5e-49100Show/hide
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A0A2P6P2N1 Uncharacterized protein2.9e-2156.84Show/hide
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        MG L ++  +LL+CI FLALQPE  +GL ++DLALRWDK H    NS   VK V+VED   + L+ APAP+   DP+Q NKR VR+GSDPIHN+C
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A0A314XM06 Uncharacterized protein2.0e-2257.89Show/hide
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        MGFL +R  +L +CI FLALQPE  +GL ++DLALRWDK H+    S   VK V+VED   + L+ APAPS   DP Q NKR+VR+GSDPIHN+C
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A0A5D3BHX9 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 455.3e-4794.74Show/hide
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M5WYZ5 Uncharacterized protein2.0e-2257.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGTTCTTGATCCATAGGGTGACCATGCTACTTCTCTGTATTTGGTTTTTGGCTCTTCAACCAGAAGGAACCAATGGGTTGACAAACATTGATCTAGCACTCAGATG
GGATAAAGCACACATTCCCATTTTCAATAGCTTCAAGTTTGTGAAGGATGTATCTGTTGAGGATGATTGGGGAAGAATGCTGGCTTTTGCTCCAGCACCTTCGACAGGTT
TAGATCCAACCCAGTTGAACAAAAGAAGGGTTCGAAGAGGATCTGATCCTATCCACAACAAATGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCCTAAACTTTGGCTCTGCATATATCTCAGACACATCCTTCTCCTCCCCATTCCCTCCTCATCGAACACAAATACTTTCATCCTTCTTCTGGTTTTAAGTACAAATGGG
GTTCTTGATCCATAGGGTGACCATGCTACTTCTCTGTATTTGGTTTTTGGCTCTTCAACCAGAAGGAACCAATGGGTTGACAAACATTGATCTAGCACTCAGATGGGATA
AAGCACACATTCCCATTTTCAATAGCTTCAAGTTTGTGAAGGATGTATCTGTTGAGGATGATTGGGGAAGAATGCTGGCTTTTGCTCCAGCACCTTCGACAGGTTTAGAT
CCAACCCAGTTGAACAAAAGAAGGGTTCGAAGAGGATCTGATCCTATCCACAACAAATGTTGAGAAGAAGAAATGAAGAAGATACAAAGACGTTTCGTACCCGTTTGTTT
TCAAAGAAAAATAGAATGTTGGGAAGCCCTGTTGATGAAAAGATGATATCCTAGATAGTTTATCAAAGATTGTTGGCAGCTTTCTTGTAGAATTGAAGATTACATCTACT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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