CuGenDBv2

Gene ID	CSPI01G06190
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1118)
Genome location	Chr1:3889176..3890290
RNA-Seq Expression	CSPI01G06190
Synteny	CSPI01G06190
Gene Ontology terms	GO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process) GO:0010196 - nonphotochemical quenching (biological process) GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0090391 - granum assembly (biological process) GO:0009515 - granal stacked thylakoid (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009500 - Protein of unknown function DUF1118

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137438.1 uncharacterized protein LOC101204037 [Cucumis sativus]

1.1e-93

99.49

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_008451074.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492437 [Cucumis melo]

6.1e-92

97.97

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_022137623.1 uncharacterized protein LOC111009021 [Momordica charantia]

2.6e-79

88.12

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSR-----RKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEVTSFCSSS R  SF+YSYP  T SR        PL + SMA EKPLPSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSR-----RKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQ AVALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

XP_023520287.1 uncharacterized protein LOC111783600 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.3e-78

88.89

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGS-KKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL
        MEVTSFC SS RAASF+YSYPS T S RK+ L L SMA +KP PSAAKTV S KK+N+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGS-KKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGL

Query:  LSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        LSAAEKAGLSLSSIEKLG LSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPE+SVWEI LQ AVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  LSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

XP_038893804.1 uncharacterized protein LOC120082623 [Benincasa hispida]

3.9e-83

90.86

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEV+SFCSSS RAASF++SYPS T S RKR LHLHSMA EKP PSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPR+SISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVW+I LQV+VALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LQ98 Uncharacterized protein

5.4e-94

99.49

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A1S3BQ40 uncharacterized protein LOC103492437

2.9e-92

97.97

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A5D3BGQ3 Uncharacterized protein

2.9e-92

97.97

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
        MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMA EKP PSA+KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLL

Query:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        SAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
Subjt:  SAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

A0A6J1CAU4 uncharacterized protein LOC111009021

1.3e-79

88.12

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSR-----RKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEVTSFCSSS R  SF+YSYP  T SR        PL + SMA EKPLPSAAKTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSR-----RKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQ AVALVS+VGGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

A0A6J1K230 uncharacterized protein LOC111490350

2.0e-77

84.16

Show/hide

Query:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKR-----PLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        MEV S  +SS RAASFIYSYP  T S+ +      PLH+H+MA EKP  SA KT+GSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKR-----PLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLG+LSKAEELG+LSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPED+VWEIVLQ A ALVS++GGSAAFAASNLVSNLQR
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQR

Query:  SN
        SN
Subjt:  SN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G74730.1 Protein of unknown function (DUF1118)

1.6e-10

38.84

Show/hide

Query:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATD-PGT-PGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVS
        + +  ++E+ K+LS  EK+GLLS AE  GL+LSS+EKL + SKAE+LG+LS   +  GT P  L S +L  L      V L+P+DS   +V Q  +A   
Subjt:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSAATD-PGT-PGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVS

Query:  IVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
         + G      S ++  LQ ++
Subjt:  IVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

AT5G08050.1 Protein of unknown function (DUF1118)

1.3e-44

62.87

Show/hide

Query:  LHLHSMATEKPLPSAA-KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSA
        L +HSMA +KP PSAA +T+ SKK   T                  P +KLLTRVEQLKLL+KAEKAGLLS AEK+G SLS+IE+LG+L+KAEE GVLSA
Subjt:  LHLHSMATEKPLPSAA-KTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGILSKAEELGVLSA

Query:  ATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN
        AT+P TPG L +LSLGLLLLGP   Y+VPED  WE+V+QV VAL+S++GGSAAFAAS  VSNLQ+S+
Subjt:  ATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGTCACTTCTTTCTGTAGCAGCAGCACCAGAGCAGCTTCCTTCATCTACTCATATCCTTCCACAACCACTTCAAGAAGAAAACGCCCTCTTCATCTTCATTCCAT
GGCTACCGAGAAACCTCTCCCCTCCGCCGCTAAAACCGTCGGCTCCAAGAAGATCAACACCACGGTGTTCCCTCTCGGCGAGAAAGGCCCAAGGAGTAGCATCTCGCTCT
CGACTTCACCGCCGATTAAGCTACTGACGAGGGTGGAGCAATTGAAGTTACTAAGCAAGGCGGAGAAGGCTGGGTTGCTATCTGCGGCGGAGAAGGCCGGGTTGTCTTTG
TCTTCGATTGAGAAATTAGGAATTCTGTCGAAGGCTGAGGAATTGGGGGTTTTATCGGCAGCGACAGATCCAGGAACTCCCGGTGCGTTGCTGAGTTTAAGCTTAGGGCT
GTTGTTATTAGGGCCTTCATGTGTGTATTTGGTGCCGGAAGATAGTGTTTGGGAAATCGTGTTGCAGGTGGCAGTGGCTCTGGTCTCCATCGTCGGCGGTTCCGCAGCTT
TTGCCGCGTCGAATTTGGTCTCGAATTTGCAAAGATCGAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCAATATCCAACTACCTTCCCTCTCCATCATACATTTCCATGGTGCGGGCCTCTGCAATTCTCTCCTTCATCGGATTCATCCCTAACCATCGCCATTCTTCACTCTCCAC
ACACTCACTAACTCTCTTCTAGCTATGGAGGTCACTTCTTTCTGTAGCAGCAGCACCAGAGCAGCTTCCTTCATCTACTCATATCCTTCCACAACCACTTCAAGAAGAAA
ACGCCCTCTTCATCTTCATTCCATGGCTACCGAGAAACCTCTCCCCTCCGCCGCTAAAACCGTCGGCTCCAAGAAGATCAACACCACGGTGTTCCCTCTCGGCGAGAAAG
GCCCAAGGAGTAGCATCTCGCTCTCGACTTCACCGCCGATTAAGCTACTGACGAGGGTGGAGCAATTGAAGTTACTAAGCAAGGCGGAGAAGGCTGGGTTGCTATCTGCG
GCGGAGAAGGCCGGGTTGTCTTTGTCTTCGATTGAGAAATTAGGAATTCTGTCGAAGGCTGAGGAATTGGGGGTTTTATCGGCAGCGACAGATCCAGGAACTCCCGGTGC
GTTGCTGAGTTTAAGCTTAGGGCTGTTGTTATTAGGGCCTTCATGTGTGTATTTGGTGCCGGAAGATAGTGTTTGGGAAATCGTGTTGCAGGTGGCAGTGGCTCTGGTCT
CCATCGTCGGCGGTTCCGCAGCTTTTGCCGCGTCGAATTTGGTCTCGAATTTGCAAAGATCGAATTGAAATTCAGTGTTGGAATTTGTTAATGGCAGCCATGAAAGTTGT
AGTTATCAGCTTTCCTTCTCCTTCCATGTCGTCGTTTTGTATGCTGTAATTATTGAATTTCATCATTTCCCGGCGAGTTAAAATGGCGATATTTGAACGGCAAATCTTAT
GCTCTCAATTTTACACCTTATGCCGATTCAAAATTAAATATTGAAGCATGCATTTGCATTATATATAACAACAACCTTATATATTATATTCAAACTTAATACCACCAAAT
AATTACCCATCTAATATGTTAATTTTATTTTAAGCAATGAATCATTTTCC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEVTSFCSSSTRAASFIYSYPSTTTSRRKRPLHLHSMATEKPLPSAAKTVGSKKINTTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSL
SSIEKLGILSKAEELGVLSAATDPGTPGALLSLSLGLLLLGPSCVYLVPEDSVWEIVLQVAVALVSIVGGSAAFAASNLVSNLQRSN

CSPI01G06190 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome