; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G06200 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G06200
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr1:3890563..3893091
RNA-Seq ExpressionCSPI01G06200
SyntenyCSPI01G06200
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64061.1 hypothetical protein Csa_013259 [Cucumis sativus]8.2e-66100Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

TYJ98943.1 uncharacterized protein E5676_scaffold248G001440 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-6397.62Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMN  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

XP_004137440.2 uncharacterized protein LOC101204278, partial [Cucumis sativus]8.2e-66100Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

XP_008451315.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492624, partial [Cucumis melo]1.0e-6397.62Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMN  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

XP_022923781.1 uncharacterized protein LOC111431390, partial [Cucurbita moschata]1.5e-5989.68Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKA+SS  QTL+RYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMN  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVM5 Uncharacterized protein4.0e-66100Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

A0A1S3BR63 uncharacterized protein LOC1034926244.8e-6497.62Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMN  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

A0A5D3BI32 Uncharacterized protein4.8e-6497.62Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMN  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

A0A6J1E7N6 uncharacterized protein LOC1114313907.2e-6089.68Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKA+SS  QTL+RYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMN  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

A0A6J1KK07 uncharacterized protein LOC1114953031.8e-5887.3Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD
        MAKA+SS  QTL+RYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRV CPA+ KEKAI+PTSNPETVFDIKYY+RDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+N  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G08060.1 unknown protein1.7e-4566.93Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIK-F
        ++ AASSL+Q LRRYIKKPW+ITGPCA PEY  AVP A EYR+ CPATI E+AI+P+S+PETV++I Y+ RDQRRNRPPIRR +L K +V +MM E K F
Subjt:  MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIK-F

Query:  DPADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK
        D +DFPKVYLT  +EED++T GGGY+K
Subjt:  DPADFPKVYLTAAIEEDMNTHGGGYQK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAAGCTGCTTCTTCTTTATTGCAAACCCTAAGGCGCTACATTAAGAAACCTTGGGAGATCACTGGCCCGTGTGCAGATCCAGAGTACAGATCAGCGGTTCCGAG
CGCTTTAGAGTACAGGGTCGTTTGCCCCGCCACCATAAAGGAGAAAGCCATTATCCCTACATCCAATCCCGAAACCGTTTTTGACATTAAGTATTACACTCGCGACCAGC
GTCGGAATCGCCCTCCGATTCGACGCACCATCCTCAAGAAACCCGACGTCGAGAAGATGATGAAGGAGATCAAATTCGACCCTGCTGACTTCCCCAAAGTTTATCTCACT
GCCGCGATTGAGGAGGATATGAATACCCATGGGGGTGGTTATCAGAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAAAGCTGCTTCTTCTTTATTGCAAACCCTAAGGCGCTACATTAAGAAACCTTGGGAGATCACTGGCCCGTGTGCAGATCCAGAGTACAGATCAGCGGTTCCGAG
CGCTTTAGAGTACAGGGTCGTTTGCCCCGCCACCATAAAGGAGAAAGCCATTATCCCTACATCCAATCCCGAAACCGTTTTTGACATTAAGTATTACACTCGCGACCAGC
GTCGGAATCGCCCTCCGATTCGACGCACCATCCTCAAGAAACCCGACGTCGAGAAGATGATGAAGGAGATCAAATTCGACCCTGCTGACTTCCCCAAAGTTTATCTCACT
GCCGCGATTGAGGAGGATATGAATACCCATGGGGGTGGTTATCAGAAGTAGAAAGGTTTGGTGGGTTCTTAAATGTTTTTCATGATCTTCTTGCTGCATTCTGGATTATT
TCCTTTTGTTACTCTTGTCTTCTGCTCGATTTTTGTTGCTGCTATTCTATAGCATTGTAATCCTAAGAGTTGTTCTAGTTAATAATTGTCAACATTGGTAGCAAATTACT
GTAAATGACTATATACTTCGGAATGTTTGCCAGGTTCTTTGCGCTCTGGGCAATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKAASSLLQTLRRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKEIKFDPADFPKVYLT
AAIEEDMNTHGGGYQK