; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G08180 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G08180
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionSerine/threonine-protein kinase fray2
Genome locationChr1:5157512..5163038
RNA-Seq ExpressionCSPI01G08180
SyntenyCSPI01G08180
Gene Ontology termsGO:0000380 - alternative mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
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GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR034604 - Serine/Arginine-related protein 53


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055199.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucumis melo var. makuwa]8.4e-17296.17Show/hide
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XP_011651355.1 RNA-binding protein 25 [Cucumis sativus]6.4e-180100Show/hide
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XP_023519444.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-15288.77Show/hide
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XP_038895540.1 serine/threonine-protein kinase fray2 isoform X2 [Benincasa hispida]1.1e-15591.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTD9 Uncharacterized protein3.1e-180100Show/hide
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A0A1S3AV81 serine/threonine-protein kinase fray23.7e-17396.72Show/hide
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A0A5A7UP09 Serine/threonine-protein kinase fray24.1e-17296.17Show/hide
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A0A5D3BJE5 Serine/threonine-protein kinase fray23.7e-17396.72Show/hide
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A0A6J1KJG1 serine/threonine-protein kinase fray22.7e-15288.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G48120.1 unknown protein1.9e-6853.13Show/hide
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        ER  R+SS RRR  S+ER+    S RR     R R S RRS     Y D+ R + R RS+ RR+R   D +  RR  RSRSLS  R+R            
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          R  E  K +  DYSRLI+GYD MS AE+VKAKMKLQL ETA  D +KG   GWERFEFDK+AP+DDEE+ E A+DDA LVK +GQS+RFSAIEA++EE
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        Q+KAAHDEAMFG P  Q  +    +D  E  N +  E   +  A +LLSEK++AKQQGSWRDRARK+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGAATCGAAAGCAGCGGCGTATTACGATGAGCTCACTCGTAAAGGAGAAGGAGCAGCAAGGTTCAAACGAGGTCTCGGTTTTTCCGCCTCCGACTCCAACAGTGA
CGTGGTCTCCGCGTCCAAGGGCTCCGCACTGCCGTCGTCGTCTTCCTTTCTCAGCTCTTTTGTTAAAGCCTCTAGCCCTTCCAAGCCCTCCGAGTTCGAAAAACAAGCTC
AGCTCGAGGCTATTCAGAACAAGCTCAAGAAGAAGAAACCAAGCTCCCCCGATAGACAAGAGAGGCGCTCTAGGGATTTGGAGAGAGATAGAAGGAAATCGAGCCCTAGA
CGAAGGTCTTTGAGTAAAGAGAGGGAGAGACATTCGCACTCGAGGAGGCGGAGTTCGAGTAGAGATAGGGAGAGACATTCGAGGCGGCGAAGTAGGAGTCGAGATAGGTA
TGGGGATAAGTATAGGGATAAGGATAGAGAGAGGAGTAGTAGGAGAAGAAGTAGGTCTAGGAGTGATTCAGATAGAGACCGGCGGCGTCGACGGAGTAGAAGCTTGTCGG
TAGAGAGGAAGAGGTCGGACGACGATGGTAGCAAAGGAGGGGGAAAACAGAAAGGCCGTAAAGTTGAAAGACAGAAGACTGAAGGTGTTGATTATTCAAGATTGATTGAA
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AGGCTAGGAAAGAGGAGCAAATCAAAGCTGCACATGACGAGGCCATGTTTGGAGCACCAGTGCGTCAATTATTAAGTACAACCGATGATGAGGACAAGGTCGAGGCCGAG
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G
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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