; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G08210 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G08210
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationChr1:5172010..5173787
RNA-Seq ExpressionCSPI01G08210
SyntenyCSPI01G08210
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055202.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-27595.04Show/hide
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XP_004152457.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Cucumis sativus]2.3e-28498.41Show/hide
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XP_008437964.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Cucumis melo]1.0e-27695.24Show/hide
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XP_023519182.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-25286.34Show/hide
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A0A0A0LU18 Uncharacterized protein1.1e-28498.41Show/hide
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A0A1S3AV83 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial4.9e-27795.24Show/hide
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A0A5A7UH90 Pentatricopeptide repeat-containing protein9.3e-27695.04Show/hide
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A0A5D3BHA7 Pentatricopeptide repeat-containing protein4.9e-27795.24Show/hide
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        FKHLEYHPSYAHS+SSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAI+VFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRV
Subjt:  FKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRV

Query:  EMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFG
        EMAYN+LFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQ+KEAWEFFLQMK+REVEIDVVTYTTMVHGFG
Subjt:  EMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFG

Query:  VVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVA
        VVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEM+KKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMD+AMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVA
Subjt:  VVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVA

Query:  IRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLPR
        IRYFCDAGD+EKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYN+LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEM+DRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILR QSKCGRLPR
Subjt:  IRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLPR

Query:  QFKL
        QFKL
Subjt:  QFKL

A0A6J1E803 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial4.3e-24985.15Show/hide
Query:  MLRKNINRRVTKTKTHTVFLHLSPPLHRFFLSCPNFTTQSTSALDTAAAAAATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQF
        M  +NIN  V K K   VFLHL  P     LSC +FTT+S     +A  A A DIA LVLESDPK LRG LHG Q+QFTPELV+KVLKRLWFHGPKALQF
Subjt:  MLRKNINRRVTKTKTHTVFLHLSPPLHRFFLSCPNFTTQSTSALDTAAAAAATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQF

Query:  FKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRV
        FK LEYHPSYAHS+SSFDHAIDIAGRMRDYK+VWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGC QDLHSFNTILDILCKSKRV
Subjt:  FKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRV

Query:  EMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFG
        EMAYN+LFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALE+LKEMV+RGLTPTITTYNI+LKGYFRAGQ+KEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFG
Subjt:  EMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFG

Query:  VVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVA
        VVGEIKRARKVF+EM+GEG+LPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAV++FE+M+ +GYVPNLTTYNV+IRGL HAGNMDKA EF+ERMKTDGCEPNVQTYNV 
Subjt:  VVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVA

Query:  IRYFCDAGDLEKGLSMFEKMG-QGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLP
        IRYFCDAGD+EKGLS+FEKMG  G LPNLDTYNV+ISAMFVRK+S+DLVVAGKLL+EM+D+GF+PRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFA EILR+QS+CGRLP
Subjt:  IRYFCDAGDLEKGLSMFEKMG-QGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLP

Query:  RQFKL
        R+FKL
Subjt:  RQFKL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3ECK2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62680, mitochondrial9.6e-5231.7Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR
        +++ +M      P   T   +   F    +   A+ +   M E G   D+ ++N I+D LCK+KRV  A++   ++ R   + +VV+Y  + NG C   R
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR

Query:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL
           A  +L +M+++ +TP + TY+ LL  + + G++ EA E F +M    ++ D+VTY+++++G  +   I  A ++F+ MV +G L    +YN +I   
Subjt:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL

Query:  CKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNV
        CK   VE+ + +F EM ++G V N  TYN +I+G F AG++DKA EF  +M   G  P++ TYN+ +   CD G+LEK L +FE M +  +  ++ TY  
Subjt:  CKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNV

Query:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG
        +I  M    K E+   A  L   +  +G  P   T+  +++GL   G
Subjt:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG

Q9C9A2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g71060, mitochondrial4.6e-5428.63Show/hide
Query:  NINRRVTK--TKTHTVFLHLSPPLHRFFLSCPNFTTQST---SALDTAAAA-----AATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHG
        N++RRV    + + +  L   P +H+      NFT   +   S+++T  +A      A  I  ++ +     +   L+   ++ +P L+++VLK+L   G
Subjt:  NINRRVTK--TKTHTVFLHLSPPLHRFFLSCPNFTTQST---SALDTAAAA-----AATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHG

Query:  PKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDIL
          AL  FK  E    + H+ S+++  I+  G+++ +K +W+LV  M+A+++  S +TFA+I+ R+  A K   AI  F  M E G   +   FN +LD L
Subjt:  PKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDIL

Query:  CKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTT
         KS+ V  A     K+ + +F+ D+ SY I+  GW       +  EV +EM + G  P +  Y I++  + +A + +EA  FF +M++R  +     + +
Subjt:  CKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTT

Query:  MVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNV
        +++G G   ++  A + F      G      TYNA++   C    +E+A    +EM  KG  PN  TY+++   L H   M ++ E  E  +T  CEP V
Subjt:  MVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNV

Query:  QTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ
         TY + +R FC+   L+  + ++++M G+G LP +  ++ LI+A+    K ++   A +   EM+D G  P    F+R+   LL  G +
Subjt:  QTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ

Q9FVX2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77360, mitochondrial1.4e-5530.35Show/hide
Query:  AAAATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPS
        A  A +I+ +++ S    L  +L    L+ + E+V+ VL R    G    +FF+  E    Y HS  ++   I+   ++R YK +W L+  MR +++  +
Subjt:  AAAATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPS

Query:  SKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVER
         +TF I+  ++  A K D AI  F  M ++  P +L +FN +L  LCKSK V  A   +F+ +R +F  D  +Y+I+  GW      PKA EV +EM++ 
Subjt:  SKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVER

Query:  GLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFE
        G  P I TY+I++    +AG++ EA      M     +     Y+ +VH +G    ++ A   F EM   G+    A +N++I   CK + ++N   + +
Subjt:  GLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFE

Query:  EMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDL
        EM  KG  PN  + N+++R L   G  D+A +   +M    CEP+  TY + I+ FC+  ++E    +++ M  +G  P++ T++VLI+ +   + ++  
Subjt:  EMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDL

Query:  VVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRV
         V   LL EM++ G  P   TF R+
Subjt:  VVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRV

Q9S7R4 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial8.0e-18472.56Show/hide
Query:  FTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLE-YHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMR
        +TP LV+ VLKRLW HGPKALQFF  L+ +H  Y H ASSFD AIDIA R+  + TVW+L+ RMR+ RIGPS KTFAI+AER+  AGKPD+A+K+FL+M 
Subjt:  FTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLE-YHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMR

Query:  EHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEF
        EHGC QDL SFNTILD+LCKSKRVE AY  LF+ LRG+F  D V+YN+I NGWCLIKRTPKALEVLKEMVERG+ P +TTYN +LKG+FRAGQ++ AWEF
Subjt:  EHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEF

Query:  FLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMD
        FL+MK+R+ EIDVVTYTT+VHGFGV GEIKRAR VF+EM+ EG+LPS ATYNAMIQVLCKKD+VENAV+MFEEMV++GY PN+TTYNV+IRGLFHAG   
Subjt:  FLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMD

Query:  KAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNG
        +  E ++RM+ +GCEPN QTYN+ IRY+ +  ++EK L +FEKMG G  LPNLDTYN+LIS MFVRK+SED+VVAGKLLLEMV+RGFIPRKFTFNRVLNG
Subjt:  KAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNG

Query:  LLLTGNQAFAKEILRLQSKCG-RLPRQFKL
        LLLTGNQAFAKEILRLQSK G RL R+F+L
Subjt:  LLLTGNQAFAKEILRLQSKCG-RLPRQFKL

Q9SXD1 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62670, mitochondrial5.6e-5231.06Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK
        AL+ RM A+   P   T+ ++       G  D A  +   M +      +  +NTI+D LCK K ++ A  NLFK +  K  + +VV+Y+ + +  C   
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK

Query:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV
        R   A  +L +M+ER + P + T++ L+  + + G+L EA + + +M +R ++  +VTY+++++GF +   +  A+++F  MV +   P   TYN +I+ 
Subjt:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV

Query:  LCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN
         CK   VE  + +F EM ++G V N  TYN++I+GLF AG+ D A E  + M +DG  PN+ TYN  +   C  G LEK + +FE + +  + P + TYN
Subjt:  LCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN

Query:  VLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLP
        ++I  M    K ED      L   +  +G  P    +N +++G    G++  A  + +   + G LP
Subjt:  VLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G62670.1 rna processing factor 24.0e-5331.06Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK
        AL+ RM A+   P   T+ ++       G  D A  +   M +      +  +NTI+D LCK K ++ A  NLFK +  K  + +VV+Y+ + +  C   
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK

Query:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV
        R   A  +L +M+ER + P + T++ L+  + + G+L EA + + +M +R ++  +VTY+++++GF +   +  A+++F  MV +   P   TYN +I+ 
Subjt:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV

Query:  LCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN
         CK   VE  + +F EM ++G V N  TYN++I+GLF AG+ D A E  + M +DG  PN+ TYN  +   C  G LEK + +FE + +  + P + TYN
Subjt:  LCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN

Query:  VLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLP
        ++I  M    K ED      L   +  +G  P    +N +++G    G++  A  + +   + G LP
Subjt:  VLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLP

AT1G62680.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein6.8e-5331.7Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR
        +++ +M      P   T   +   F    +   A+ +   M E G   D+ ++N I+D LCK+KRV  A++   ++ R   + +VV+Y  + NG C   R
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR

Query:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL
           A  +L +M+++ +TP + TY+ LL  + + G++ EA E F +M    ++ D+VTY+++++G  +   I  A ++F+ MV +G L    +YN +I   
Subjt:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL

Query:  CKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNV
        CK   VE+ + +F EM ++G V N  TYN +I+G F AG++DKA EF  +M   G  P++ TYN+ +   CD G+LEK L +FE M +  +  ++ TY  
Subjt:  CKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNV

Query:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG
        +I  M    K E+   A  L   +  +G  P   T+  +++GL   G
Subjt:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG

AT1G71060.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein3.3e-5528.63Show/hide
Query:  NINRRVTK--TKTHTVFLHLSPPLHRFFLSCPNFTTQST---SALDTAAAA-----AATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHG
        N++RRV    + + +  L   P +H+      NFT   +   S+++T  +A      A  I  ++ +     +   L+   ++ +P L+++VLK+L   G
Subjt:  NINRRVTK--TKTHTVFLHLSPPLHRFFLSCPNFTTQST---SALDTAAAA-----AATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHG

Query:  PKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDIL
          AL  FK  E    + H+ S+++  I+  G+++ +K +W+LV  M+A+++  S +TFA+I+ R+  A K   AI  F  M E G   +   FN +LD L
Subjt:  PKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDIL

Query:  CKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTT
         KS+ V  A     K+ + +F+ D+ SY I+  GW       +  EV +EM + G  P +  Y I++  + +A + +EA  FF +M++R  +     + +
Subjt:  CKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTT

Query:  MVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNV
        +++G G   ++  A + F      G      TYNA++   C    +E+A    +EM  KG  PN  TY+++   L H   M ++ E  E  +T  CEP V
Subjt:  MVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNV

Query:  QTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ
         TY + +R FC+   L+  + ++++M G+G LP +  ++ LI+A+    K ++   A +   EM+D G  P    F+R+   LL  G +
Subjt:  QTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ

AT1G74900.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein7.3e-16466.05Show/hide
Query:  FTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLE-YHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMR
        +TP LV+ VLKRLW HGPKALQFF  L+ +H  Y H ASSFD AIDIA R+  + TVW+L+ RMR+ RIGPS KTFAI+AER+  AGKPD+A+K+FL+M 
Subjt:  FTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLE-YHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMR

Query:  EHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEF
        EHGC QDL SFNTILD+LCKSKRVE AY  LF+ LRG+F  D V+YN+I NGWCLIKRTPKALEVLKEMVERG+ P +TTYN +LKG+FRAGQ++ AWEF
Subjt:  EHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEF

Query:  FLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMD
        FL+MK+R+ EIDVVTYTT+VHGFGV GEIKRAR VF+EM+ EG+LPS ATYNAMIQVLCKKD+VENAV+MFEEMV++GY PN+TTYNV+IRGLFHAG   
Subjt:  FLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMD

Query:  KAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNG
        +  E ++RM+ +GCEPN QTYN+ IRY+ +  ++EK L +FEKMG G  LPNLDTYN+LIS MFVRK+SED+VVA                         
Subjt:  KAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNG

Query:  LLLTGNQAFAKEILRLQSKCG-RLPRQFKL
            GNQAFAKEILRLQSK G RL R+F+L
Subjt:  LLLTGNQAFAKEILRLQSKCG-RLPRQFKL

AT1G77360.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.0e-5630.35Show/hide
Query:  AAAATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPS
        A  A +I+ +++ S    L  +L    L+ + E+V+ VL R    G    +FF+  E    Y HS  ++   I+   ++R YK +W L+  MR +++  +
Subjt:  AAAATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPS

Query:  SKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVER
         +TF I+  ++  A K D AI  F  M ++  P +L +FN +L  LCKSK V  A   +F+ +R +F  D  +Y+I+  GW      PKA EV +EM++ 
Subjt:  SKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVER

Query:  GLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFE
        G  P I TY+I++    +AG++ EA      M     +     Y+ +VH +G    ++ A   F EM   G+    A +N++I   CK + ++N   + +
Subjt:  GLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFE

Query:  EMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDL
        EM  KG  PN  + N+++R L   G  D+A +   +M    CEP+  TY + I+ FC+  ++E    +++ M  +G  P++ T++VLI+ +   + ++  
Subjt:  EMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNVLISAMFVRKKSEDL

Query:  VVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRV
         V   LL EM++ G  P   TF R+
Subjt:  VVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTCGAAAAAACATCAATCGAAGAGTAACCAAGACGAAGACGCATACTGTTTTTCTCCATCTTTCCCCACCATTACATAGATTCTTCCTCTCATGTCCCAACTTCAC
TACCCAATCTACCTCCGCCCTAGACACCGCCGCCGCCGCCGCCGCTACGGATATCGCCACTCTTGTCCTCGAATCCGACCCCAAAAGCTTGAGGGGATCCCTCCATGGAT
TACAACTTCAATTTACCCCTGAACTTGTCGACAAGGTTCTCAAGCGCCTATGGTTCCATGGACCGAAAGCGCTGCAATTTTTCAAACACCTTGAGTACCATCCATCTTAT
GCCCATTCTGCATCTTCCTTCGACCACGCCATCGATATTGCAGGTCGTATGCGTGACTACAAGACCGTATGGGCTCTAGTAGCTCGAATGCGAGCTCGCCGGATTGGACC
CAGTTCAAAAACCTTCGCAATCATAGCTGAGAGGTTCGTAGGCGCTGGAAAACCTGATAGAGCGATCAAGGTTTTCTTGTCGATGCGGGAGCATGGGTGTCCTCAGGATC
TGCATTCGTTTAACACCATTCTCGACATTCTCTGTAAGTCAAAACGTGTAGAAATGGCTTATAACAATCTGTTCAAGGTTTTGAGAGGAAAATTTAAGGCTGATGTTGTT
AGTTATAACATAATTGCAAATGGATGGTGTTTGATTAAGCGTACACCCAAAGCGTTGGAGGTTTTGAAGGAGATGGTGGAAAGAGGTTTAACTCCAACTATTACTACTTA
CAATATACTTTTAAAAGGGTATTTTAGAGCTGGTCAGCTTAAGGAAGCTTGGGAGTTCTTTTTGCAAATGAAAGAGAGGGAAGTTGAAATTGATGTTGTTACTTATACTA
CTATGGTTCATGGGTTTGGTGTTGTGGGTGAAATTAAAAGGGCTCGAAAGGTTTTCAATGAAATGGTTGGTGAAGGGATTCTTCCTTCAACAGCAACTTACAATGCTATG
ATACAGGTTCTGTGTAAGAAAGATAGTGTGGAGAATGCAGTATTGATGTTTGAGGAGATGGTAAAGAAGGGTTATGTGCCGAATTTGACCACTTATAACGTGGTTATAAG
AGGATTGTTTCATGCAGGGAATATGGATAAGGCTATGGAGTTTATTGAGAGGATGAAAACTGATGGGTGTGAACCAAATGTTCAGACATATAACGTTGCTATTCGGTACT
TTTGTGATGCTGGTGACCTTGAAAAGGGGTTGAGTATGTTTGAGAAGATGGGGCAGGGGAGCTTACCAAATTTGGATACGTATAATGTTTTGATTAGTGCAATGTTTGTG
AGGAAGAAGTCTGAAGATTTAGTGGTTGCTGGGAAGCTGTTGCTTGAGATGGTTGATAGAGGATTCATTCCTAGGAAGTTCACTTTCAATCGAGTTCTCAACGGGCTTTT
GCTGACGGGTAATCAAGCTTTTGCAAAGGAGATTTTGAGACTACAGAGCAAATGTGGCCGTCTTCCTCGCCAATTTAAGTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGAAAATAGGAGGGAAAATCAAGAGGAAGAGGGAAAAAGAAGATGTTTCAATCAGCGGCAAAAGCACCACCATTTTCGCTATGCTTCGAAAAAACATCAATCGAAGAG
TAACCAAGACGAAGACGCATACTGTTTTTCTCCATCTTTCCCCACCATTACATAGATTCTTCCTCTCATGTCCCAACTTCACTACCCAATCTACCTCCGCCCTAGACACC
GCCGCCGCCGCCGCCGCTACGGATATCGCCACTCTTGTCCTCGAATCCGACCCCAAAAGCTTGAGGGGATCCCTCCATGGATTACAACTTCAATTTACCCCTGAACTTGT
CGACAAGGTTCTCAAGCGCCTATGGTTCCATGGACCGAAAGCGCTGCAATTTTTCAAACACCTTGAGTACCATCCATCTTATGCCCATTCTGCATCTTCCTTCGACCACG
CCATCGATATTGCAGGTCGTATGCGTGACTACAAGACCGTATGGGCTCTAGTAGCTCGAATGCGAGCTCGCCGGATTGGACCCAGTTCAAAAACCTTCGCAATCATAGCT
GAGAGGTTCGTAGGCGCTGGAAAACCTGATAGAGCGATCAAGGTTTTCTTGTCGATGCGGGAGCATGGGTGTCCTCAGGATCTGCATTCGTTTAACACCATTCTCGACAT
TCTCTGTAAGTCAAAACGTGTAGAAATGGCTTATAACAATCTGTTCAAGGTTTTGAGAGGAAAATTTAAGGCTGATGTTGTTAGTTATAACATAATTGCAAATGGATGGT
GTTTGATTAAGCGTACACCCAAAGCGTTGGAGGTTTTGAAGGAGATGGTGGAAAGAGGTTTAACTCCAACTATTACTACTTACAATATACTTTTAAAAGGGTATTTTAGA
GCTGGTCAGCTTAAGGAAGCTTGGGAGTTCTTTTTGCAAATGAAAGAGAGGGAAGTTGAAATTGATGTTGTTACTTATACTACTATGGTTCATGGGTTTGGTGTTGTGGG
TGAAATTAAAAGGGCTCGAAAGGTTTTCAATGAAATGGTTGGTGAAGGGATTCTTCCTTCAACAGCAACTTACAATGCTATGATACAGGTTCTGTGTAAGAAAGATAGTG
TGGAGAATGCAGTATTGATGTTTGAGGAGATGGTAAAGAAGGGTTATGTGCCGAATTTGACCACTTATAACGTGGTTATAAGAGGATTGTTTCATGCAGGGAATATGGAT
AAGGCTATGGAGTTTATTGAGAGGATGAAAACTGATGGGTGTGAACCAAATGTTCAGACATATAACGTTGCTATTCGGTACTTTTGTGATGCTGGTGACCTTGAAAAGGG
GTTGAGTATGTTTGAGAAGATGGGGCAGGGGAGCTTACCAAATTTGGATACGTATAATGTTTTGATTAGTGCAATGTTTGTGAGGAAGAAGTCTGAAGATTTAGTGGTTG
CTGGGAAGCTGTTGCTTGAGATGGTTGATAGAGGATTCATTCCTAGGAAGTTCACTTTCAATCGAGTTCTCAACGGGCTTTTGCTGACGGGTAATCAAGCTTTTGCAAAG
GAGATTTTGAGACTACAGAGCAAATGTGGCCGTCTTCCTCGCCAATTTAAGTTATGAAGCTAGCAGCGATTATAAATGATGGTGTGAGTTTCAGTGCCTTCATTTGACCT
TGTTGTGCAGCTGGCACTTCAGAACCAGTTCCATTCTATCTGAATACGTCAAACAAGATTTTGAACTATATTTATGGATCCGTAAGTGTTTGAATCGTTTATGGATGGGC
AAGTTACTCTCCTTGATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLRKNINRRVTKTKTHTVFLHLSPPLHRFFLSCPNFTTQSTSALDTAAAAAATDIATLVLESDPKSLRGSLHGLQLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSY
AHSASSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIKVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNNLFKVLRGKFKADVV
SYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQLKEAWEFFLQMKEREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAM
IQVLCKKDSVENAVLMFEEMVKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDKAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDLEKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYNVLISAMFV
RKKSEDLVVAGKLLLEMVDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRLQSKCGRLPRQFKL