; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G09710 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G09710
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDUF4408 domain-containing protein
Genome locationChr1:6074287..6074971
RNA-Seq ExpressionCSPI01G09710
SyntenyCSPI01G09710
Gene Ontology termsGO:0034219 - carbohydrate transmembrane transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051119 - sugar transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573141.1 hypothetical protein SDJN03_27028, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-3154.12Show/hide
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         TL+  GD+ R  +   ++DEWE+   N E+LSKRADDFIARVNMQR+IEA ++ +CC++ T K +Y KK
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KAG7012326.1 hypothetical protein SDJN02_25078, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-3154.12Show/hide
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         TL+  GD+ R  +   ++DEWE+   N E+LSKRADDFIARVNMQR+IEA ++ +CC++ T K +Y KK
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KGN64433.2 hypothetical protein Csa_013667 [Cucumis sativus]2.4e-7699.34Show/hide
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XP_008446247.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489033 [Cucumis melo]4.8e-6981.87Show/hide
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        I++SSSSKSNHSPVNNIIINILLL  FLTA    LLWI+P             SSL H  NYPINFPTPTFVFILGNLIVVLLIGESK+FSSTTPDPFGF
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        DICFY GSF ET VSEGDQKR SESFDEEDEWEIESVNSEELSKRADDFIARVNMQRKIEAMMV+YCCDMMT KKRY KKYY
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XP_011660360.1 uncharacterized protein LOC105436383 [Cucumis sativus]1.6e-8899.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LWQ9 Uncharacterized protein7.7e-8999.42Show/hide
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        TLVSEGD KRTSESFDEEDEWEIESVNSEELSKRADDFIARVNMQRKIEAMMVMYCCDMMTMKKRYTKKYY
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A0A1S3BFF3 uncharacterized protein LOC1034890332.3e-6981.87Show/hide
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        I++SSSSKSNHSPVNNIIINILLL  FLTA    LLWI+P             SSL H  NYPINFPTPTFVFILGNLIVVLLIGESK+FSSTTPDPFGF
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        DICFY GSF ET VSEGDQKR SESFDEEDEWEIESVNSEELSKRADDFIARVNMQRKIEAMMV+YCCDMMT KKRY KKYY
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A0A5A7UM42 Protoheme IX farnesyltransferase2.3e-6981.87Show/hide
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A0A5N5K2G5 DUF4408 domain-containing protein1.5e-0733.52Show/hide
Query:  LTKIETSSSSKSNHSPVNNIIINILLLCC--FLTALLWILPSSSLFHPSN--YPINFP-------TPTFVFILGNLIVVLLIGESKVFSSTTPDPFGFDI
        L +I   + SK +    N  + +  +L C  F ++  W     SLFH       ++ P       +P F+FI+GNLI+V+L+GESK F+S++P     D+
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Query:  CFYD---------------GSFRETLVSEG---DQKRTSESFDEEDEWEIE--SVNSEELSKRADDFIARVNMQRKIEA
        C+ +               G  +E  + +     Q +T ES  E  + + E  S+ +EEL KRADDFIARVN QR  EA
Subjt:  CFYD---------------GSFRETLVSEG---DQKRTSESFDEEDEWEIE--SVNSEELSKRADDFIARVNMQRKIEA

A0A6J1CA01 uncharacterized protein LOC1110088101.1e-1846.99Show/hide
Query:  VNNIIINILLLCCFLTALL---------WILP---SSSLFHPSNYPINFPTPTFVFILGNLIVVLLIGESKVFSSTTPDPF--GFDICFYDGSFRETLVS
        +NN II+  LL  FLTAL+         WILP   SSS         N PT + VF+LGNLIV +L+GESK+FS  T D      D C +DGSF E   S
Subjt:  VNNIIINILLLCCFLTALL---------WILP---SSSLFHPSNYPINFPTPTFVFILGNLIVVLLIGESKVFSSTTPDPF--GFDICFYDGSFRETLVS

Query:  EGDQKRTSESFDEEDEWEIESV-NSEELSKRADDFIARVNMQRKIEAMMVMYCCDMMTMKKRYTKK
         G+ +   +  +  DEWE+ ++ + EELS+RADDFIARVNMQRKIEA ++ Y C+  TM K+Y ++
Subjt:  EGDQKRTSESFDEEDEWEIESV-NSEELSKRADDFIARVNMQRKIEAMMVMYCCDMMTMKKRYTKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G50610.1 unknown protein2.0e-0430.22Show/hide
Query:  ILLLCCFLTAL--LWILPSSSLF-----HPSNYPINFPTPTFVFILGNLIVVLLIGESKVFSSTTPDPFGFDICFYD---GSFRETLVSEGDQKRTSESF
        I+++ C +     +W+  S+S F        NY +N   P  +FIL N+IV++LIGES++    +  P    +  +     S     V  G Q+   E+ 
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        D     E    ++  +  + L++RADD IARVN QR++E
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AT5G50710.1 unknown protein2.0e-0430.22Show/hide
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        I+++ C +     +W+  S+S F        NY +N   P  +FIL N+IV++LIGES++    +  P    +  +     S     V  G Q+   E+ 
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Query:  D-----EEDEWEIESVNSEELSKRADDFIARVNMQRKIE
        D     E    ++  +  + L++RADD IARVN QR++E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTCTTACAAAGATCGAAACATCATCTTCATCAAAATCCAACCATTCCCCTGTAAATAATATAATCATCAACATCCTCCTCCTCTGCTGCTTTCTCACAGCTCTCTT
ATGGATCCTTCCTTCTTCATCTCTCTTTCATCCCTCCAATTACCCAATAAACTTTCCCACGCCCACTTTCGTTTTCATCCTTGGCAATCTCATCGTCGTCCTTCTCATCG
GAGAATCCAAGGTTTTTTCATCAACAACTCCGGACCCTTTCGGGTTTGATATTTGCTTTTACGATGGGAGTTTTCGAGAGACTTTGGTTAGTGAAGGGGATCAAAAGAGG
ACTTCTGAGAGCTTTGATGAGGAGGATGAGTGGGAAATTGAATCGGTTAATTCGGAGGAATTGAGTAAAAGGGCTGATGATTTTATTGCCAGAGTTAATATGCAGAGGAA
GATTGAAGCTATGATGGTTATGTATTGTTGTGATATGATGACGATGAAGAAACGATATACAAAGAAATACTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCTTCTTAGATTTCTTATAAATTTTCTTTTTTGAGAAAATCCCAATCAAGGAAAATGGGTCTTACAAAGATCGAAACATCATCTTCATCAAAATCCAACCATTCCCCTG
TAAATAATATAATCATCAACATCCTCCTCCTCTGCTGCTTTCTCACAGCTCTCTTATGGATCCTTCCTTCTTCATCTCTCTTTCATCCCTCCAATTACCCAATAAACTTT
CCCACGCCCACTTTCGTTTTCATCCTTGGCAATCTCATCGTCGTCCTTCTCATCGGAGAATCCAAGGTTTTTTCATCAACAACTCCGGACCCTTTCGGGTTTGATATTTG
CTTTTACGATGGGAGTTTTCGAGAGACTTTGGTTAGTGAAGGGGATCAAAAGAGGACTTCTGAGAGCTTTGATGAGGAGGATGAGTGGGAAATTGAATCGGTTAATTCGG
AGGAATTGAGTAAAAGGGCTGATGATTTTATTGCCAGAGTTAATATGCAGAGGAAGATTGAAGCTATGATGGTTATGTATTGTTGTGATATGATGACGATGAAGAAACGA
TATACAAAGAAATACTATTAAGTCTTCTGTAATTTATTAGCTTCTTTGTTTAACTAATGGAAGTCGTTCCGTTGGCATACTATGTAATGATTTGTTCATATTTCAAACTT
TATAAATGAAAAAACGAGACGAGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGLTKIETSSSSKSNHSPVNNIIINILLLCCFLTALLWILPSSSLFHPSNYPINFPTPTFVFILGNLIVVLLIGESKVFSSTTPDPFGFDICFYDGSFRETLVSEGDQKR
TSESFDEEDEWEIESVNSEELSKRADDFIARVNMQRKIEAMMVMYCCDMMTMKKRYTKKYY