; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G09850 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G09850
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionTranscription factor ICE1-like isoform X1
Genome locationChr1:6167918..6171824
RNA-Seq ExpressionCSPI01G09850
SyntenyCSPI01G09850
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055355.1 transcription factor ICE1-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]0.0e+0098.55Show/hide
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A0A1S3B0C1 transcription factor ICE1-like isoform X12.0e-31098.36Show/hide
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A0A1S4DVZ7 transcription factor ICE1-like isoform X27.2e-29093.45Show/hide
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Subjt:  AIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNL

Query:  GLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT
        GLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT
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A0A5A7UNZ7 Transcription factor ICE1-like isoform X10.0e+0098.55Show/hide
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        MLSRVGNVLWMENR+DEDSSSWTKNN DHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFTDPPDNLLLPPG
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        DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSNNPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTP+LCLGSQLTAQ
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        NVAPM DNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGS+LGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMG+ENGKKRKM
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Query:  VYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGD
        +YADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGD
Subjt:  VYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGD

Query:  AIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNL
        AIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCP+SFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNL
Subjt:  AIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNL

Query:  GLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT
        GLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT
Subjt:  GLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT

A0A5D3BKM8 Transcription factor ICE1-like isoform X12.0e-31098.36Show/hide
Query:  MLSRVGNVLWMENRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFTDPPDNLLLPPG
        MLSRVGNVLWMENR+DEDSSSWTKNN DHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFTDPPDNLLLPPG
Subjt:  MLSRVGNVLWMENRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFTDPPDNLLLPPG

Query:  DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSNNPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTPSLCLGSQLTAQ
        DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSNNPL+HGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTP+LCLGSQLTAQ
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Query:  NVAPMSDNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMGEENGKKRKM
        NVAPM DNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGS+LGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMG+ENGKKRKM
Subjt:  NVAPMSDNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMGEENGKKRKM

Query:  VYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGD
        +YADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGD
Subjt:  VYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGD

Query:  AIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNL
        AIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCP+SFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNL
Subjt:  AIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNL

Query:  GLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT
        GLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10S44 Transcription factor BHLH37.8e-3143.65Show/hide
Query:  GGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIK
        G   + K  G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRS+VPKISKMDR SILGD I+Y+KEL +RI  L  E+  +P    L        L     S S    
Subjt:  GGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIK

Query:  EELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF
        E L   S         + +V  R      I + C   PG+LLSTV AL+ LGL+I+Q V+SCF+ F M     ++  + Q V  ++IK  L  S G+
Subjt:  EELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF

Q336V8 Basic helix-loop-helix protein 0048.6e-3043.6Show/hide
Query:  GNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLT
        G    A ++V     +  + G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRSVVP+ISKMDR SILGD I Y+KEL+ RI +L  E     S ++ T   S   L 
Subjt:  GNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLT

Query:  --PTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVH-PEQ
            PPS SS  +  L   S         R EV  RE  +  I M C   P LL ST+ AL+ LG++I+Q VISCF+ FAM     +   + +     E+
Subjt:  --PTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVH-PEQ

Query:  IKAILLDSVGF
        IK  L  S G+
Subjt:  IKAILLDSVGF

Q9LPW3 Transcription factor SCREAM29.6e-9848.78Show/hide
Query:  HTDINDITFSQNF-TDPPDNLLL---PPGDSSSSCSP---------SSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKV--VSNNPLDHGFDLGAEVGFLDVQA
        HT+ ND  F+  F  +P +NLLL      DSSSS SP         +S         Q + FL     + SL  V  ++NN  D   D G + GFL  Q 
Subjt:  HTDINDITFSQNF-TDPPDNLLL---PPGDSSSSCSP---------SSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKV--VSNNPLDHGFDLGAEVGFLDVQA

Query:  SNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTPSLCLGSQLTAQNVAPMSDNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSL
                            SP S   T     G   +  +  P  +N SG  G         + L  NR+K+L+PL+   S G+QPTLFQKRAA+R+S 
Subjt:  SNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTPSLCLGSQLTAQNVAPMSDNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSL

Query:  ADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTS---IDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKK
        + K  +                         E + + RK  Y  E+ DTS   ID S  NY+SDD   N N                         KGKK
Subjt:  ADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTS---IDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKK

Query:  KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCP-TS
        KG+PAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAI+YLKELLQRINDLH ELE +P  +     +S HPLTPTP +LS R+KEELCP +S
Subjt:  KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCP-TS

Query:  FPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF
         PSP GQ  RVEVR+REG+AVNIHMFCGRRPGLLLST+RALDNLGLD+QQAVISCFNGFA+D+FRAEQC E  DV PEQIKA+LLD+ G+
Subjt:  FPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF

Q9LSE2 Transcription factor ICE12.0e-11147.34Show/hide
Query:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN
        G  +W+      R++ +  SW +N  D +                    S FK ML  E DW  S     N  H  D+  +    +F        +P DN
Subjt:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN

Query:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS
        LLL    DSSSSCSPS +   ++DPSQ   FL        L  V S+ NP D+ F+ G+E GFL    +     ++ G G LT  G  DLS     + P 
Subjt:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS

Query:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE
              L    +AP S+N     C G       + F        + NR+K+L+PLE   S GAQPTLFQKRAA+R+S    GS +G              
Subjt:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE

Query:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
                  E+   R+     ++ +T I+ S  NY+SD+        ++ESG+       A S   GG  KGKKKG+PAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
Subjt:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML

Query:  RSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMF
        RSVVPKISKMDRASILGDAI+YLKELLQRINDLHNELE +P G+     +SFHPLTPTP +LS R+KEELCP+S PSP GQ ARVEVR+REGRAVNIHMF
Subjt:  RSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMF

Query:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF
        CGRRPGLLL+T++ALDNLGLD+QQAVISCFNGFA+D+FRAEQC EGQ++ P+QIKA+L D+ G+
Subjt:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF

Q9LSL1 Transcription factor bHLH931.1e-2941.55Show/hide
Query:  GGDQKGKK----KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLS
        GG+   KK    +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRS+VPKISKMDR SILGDAI+Y+KELL +IN L +E +                L  +  S  
Subjt:  GGDQKGKK----KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLS

Query:  SRIKEELCPTSFPSP---NGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLD
        S++  +L   +   P   N     ++ R  + R   + + C  +PGLLLSTV  L+ LGL+I+Q VISCF+ F++    +E   +   +  E IK  L  
Subjt:  SRIKEELCPTSFPSP---NGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLD

Query:  SVGFNSA
        + G+  +
Subjt:  SVGFNSA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12860.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.8e-9948.78Show/hide
Query:  HTDINDITFSQNF-TDPPDNLLL---PPGDSSSSCSP---------SSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKV--VSNNPLDHGFDLGAEVGFLDVQA
        HT+ ND  F+  F  +P +NLLL      DSSSS SP         +S         Q + FL     + SL  V  ++NN  D   D G + GFL  Q 
Subjt:  HTDINDITFSQNF-TDPPDNLLL---PPGDSSSSCSP---------SSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKV--VSNNPLDHGFDLGAEVGFLDVQA

Query:  SNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTPSLCLGSQLTAQNVAPMSDNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSL
                            SP S   T     G   +  +  P  +N SG  G         + L  NR+K+L+PL+   S G+QPTLFQKRAA+R+S 
Subjt:  SNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTPSLCLGSQLTAQNVAPMSDNCSGLAGFQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSL

Query:  ADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTS---IDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKK
        + K  +                         E + + RK  Y  E+ DTS   ID S  NY+SDD   N N                         KGKK
Subjt:  ADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTS---IDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKK

Query:  KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCP-TS
        KG+PAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAI+YLKELLQRINDLH ELE +P  +     +S HPLTPTP +LS R+KEELCP +S
Subjt:  KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCP-TS

Query:  FPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF
         PSP GQ  RVEVR+REG+AVNIHMFCGRRPGLLLST+RALDNLGLD+QQAVISCFNGFA+D+FRAEQC E  DV PEQIKA+LLD+ G+
Subjt:  FPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF

AT3G26744.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.4e-11247.34Show/hide
Query:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN
        G  +W+      R++ +  SW +N  D +                    S FK ML  E DW  S     N  H  D+  +    +F        +P DN
Subjt:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN

Query:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS
        LLL    DSSSSCSPS +   ++DPSQ   FL        L  V S+ NP D+ F+ G+E GFL    +     ++ G G LT  G  DLS     + P 
Subjt:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS

Query:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE
              L    +AP S+N     C G       + F        + NR+K+L+PLE   S GAQPTLFQKRAA+R+S    GS +G              
Subjt:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE

Query:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
                  E+   R+     ++ +T I+ S  NY+SD+        ++ESG+       A S   GG  KGKKKG+PAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
Subjt:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML

Query:  RSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMF
        RSVVPKISKMDRASILGDAI+YLKELLQRINDLHNELE +P G+     +SFHPLTPTP +LS R+KEELCP+S PSP GQ ARVEVR+REGRAVNIHMF
Subjt:  RSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMF

Query:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF
        CGRRPGLLL+T++ALDNLGLD+QQAVISCFNGFA+D+FRAEQC EGQ++ P+QIKA+L D+ G+
Subjt:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF

AT3G26744.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.4e-11247.34Show/hide
Query:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN
        G  +W+      R++ +  SW +N  D +                    S FK ML  E DW  S     N  H  D+  +    +F        +P DN
Subjt:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN

Query:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS
        LLL    DSSSSCSPS +   ++DPSQ   FL        L  V S+ NP D+ F+ G+E GFL    +     ++ G G LT  G  DLS     + P 
Subjt:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS

Query:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE
              L    +AP S+N     C G       + F        + NR+K+L+PLE   S GAQPTLFQKRAA+R+S    GS +G              
Subjt:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE

Query:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
                  E+   R+     ++ +T I+ S  NY+SD+        ++ESG+       A S   GG  KGKKKG+PAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
Subjt:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML

Query:  RSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMF
        RSVVPKISKMDRASILGDAI+YLKELLQRINDLHNELE +P G+     +SFHPLTPTP +LS R+KEELCP+S PSP GQ ARVEVR+REGRAVNIHMF
Subjt:  RSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMF

Query:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF
        CGRRPGLLL+T++ALDNLGLD+QQAVISCFNGFA+D+FRAEQC EGQ++ P+QIKA+L D+ G+
Subjt:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF

AT3G26744.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.4e-11247.34Show/hide
Query:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN
        G  +W+      R++ +  SW +N  D +                    S FK ML  E DW  S     N  H  D+  +    +F        +P DN
Subjt:  GNVLWME----NRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFT-------DPPDN

Query:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS
        LLL    DSSSSCSPS +   ++DPSQ   FL        L  V S+ NP D+ F+ G+E GFL    +     ++ G G LT  G  DLS     + P 
Subjt:  LLLPPG-DSSSSCSPSSSVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSN-NPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLT--GFTDLSPTSQMNTPS

Query:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE
              L    +AP S+N     C G       + F        + NR+K+L+PLE   S GAQPTLFQKRAA+R+S    GS +G              
Subjt:  LCLGSQLTAQNVAPMSDN-----CSGLAG---FQSFDENLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIE

Query:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
                  E+   R+     ++ +T I+ S  NY+SD+        ++ESG+       A S   GG  KGKKKG+PAKNLMAERRRRKKLNDRLYML
Subjt:  GGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTKLDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYML

Query:  RSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMF
        RSVVPKISKMDRASILGDAI+YLKELLQRINDLHNELE +P G+     +SFHPLTPTP +LS R+KEELCP+S PSP GQ ARVEVR+REGRAVNIHMF
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Query:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF
        CGRRPGLLL+T++ALDNLGLD+QQAVISCFNGFA+D+FRAEQC EGQ++ P+QIKA+L D+ G+
Subjt:  CGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGF

AT5G65640.1 beta HLH protein 938.0e-3141.55Show/hide
Query:  GGDQKGKK----KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLS
        GG+   KK    +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRS+VPKISKMDR SILGDAI+Y+KELL +IN L +E +                L  +  S  
Subjt:  GGDQKGKK----KGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPTPPSLS

Query:  SRIKEELCPTSFPSP---NGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLD
        S++  +L   +   P   N     ++ R  + R   + + C  +PGLLLSTV  L+ LGL+I+Q VISCF+ F++    +E   +   +  E IK  L  
Subjt:  SRIKEELCPTSFPSP---NGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLD

Query:  SVGFNSA
        + G+  +
Subjt:  SVGFNSA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTTCCAGAGTTGGGAACGTTCTTTGGATGGAAAATCGGGACGATGAAGACTCATCTTCCTGGACTAAAAACAACACCGACCACAATCATCTCAACCACCCTGTTAA
TTGCTCTGTTTTGAACAACAAAGACGAAATCACCTCCCTTTCTACCTTCAAATCCATGCTTGAGGTTGAAGATGACTGGTGTATCTCTGCTAATGCTCTCCATAACCATA
ACCACCACACCGACATCAATGACATTACCTTCTCTCAAAATTTCACCGACCCACCTGATAATTTGTTGCTCCCCCCTGGAGATTCCTCCTCTTCTTGTTCCCCTTCTTCT
TCTGTGTTTAATAACATTGACCCATCTCAATTGCGTTTCTTCTTACCTCCAACTCGCACTTTGTCTTCACTTCATAAGGTAGTTTCTAACAACCCTTTAGACCATGGCTT
CGATTTGGGAGCAGAGGTTGGGTTTCTTGACGTCCAAGCTTCAAATGCTTCGACTCTGCTCAACGATGGAGGTGGGTTATTAACTGGGTTCACTGATTTAAGCCCAACTA
GTCAGATGAACACTCCTAGTTTGTGCTTAGGTTCTCAATTGACAGCACAAAACGTGGCCCCAATGAGTGATAATTGTTCGGGATTAGCTGGATTTCAGAGTTTTGATGAG
AATTTGGGAAATGCTCTGCTTTTGAATCGGTCTAAGCTTTTGAGACCACTTGAATCTTTTCCCTCAGTGGGAGCTCAGCCGACTCTTTTCCAGAAGAGGGCTGCTCTAAG
GAAGAGTTTAGCTGATAAGGGAAGCAGTTTGGGGGTTTTGAGCCCCGATGGCGGCTGGTTTTCAAATAGGATTGAAGGGGGGATTGGGAAAAATGAAATGGGTGAAGAAA
ATGGGAAGAAGAGGAAAATGGTTTATGCAGATGAATTGCAAGATACTAGCATCGATACATCCCGTTTCAATTACGATTCTGATGACTTTACCGAGAATACTAACACTAAA
TTGGATGAGAGTGGTAGAAATGTTGGAAATACATCTAACGCCAATAGTACAGTAACCGGCGGCGACCAGAAGGGGAAGAAAAAAGGACTTCCAGCGAAGAATTTAATGGC
CGAGAGACGCCGGAGGAAGAAGCTCAATGATAGGCTGTACATGCTGAGGTCCGTTGTTCCAAAAATCAGCAAAATGGATAGAGCTTCAATTCTTGGAGATGCAATTGAGT
ACTTGAAGGAATTACTGCAAAGAATCAACGACCTCCATAATGAATTGGAGTTTTCTCCTTCTGGGGCAGCCTTGACGCCAGGTGCAAGCTTCCATCCCTTGACTCCAACA
CCACCAAGCCTCTCGAGTCGTATAAAGGAGGAGCTTTGTCCTACCTCATTTCCCAGCCCAAACGGCCAACCTGCAAGGGTCGAAGTTAGAGTACGAGAAGGACGTGCAGT
AAATATACACATGTTTTGTGGCCGCCGACCGGGTCTCTTGCTCTCTACAGTTAGGGCATTAGATAATCTTGGACTGGATATCCAACAGGCTGTGATTAGCTGCTTTAATG
GTTTTGCTATGGACATTTTTCGAGCAGAGCAATGCAGCGAAGGTCAAGATGTCCATCCTGAGCAAATAAAAGCAATATTATTGGATTCAGTTGGCTTCAATAGTGCCACA
TAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTTCCTCTTTCCTTCTCTTCAATTTTCTCTCCATCTTCTTCTTTAAACTTTCTCTCTCATTTCCCTCTCATTTCCCTCTCCACCTCACTGCACTTATCTCTTTCTGTCA
GTTTTCCTCCATTTCTTTTCCCATTCCCAATAAACTCTTTTCCTAACCCAAACCTCCAGAAAAATTTAAAAACAAAAAACTACTCTTCAACCTCATACTCATCATCACCT
TCTTCTTCACCATGCTTTCCAGAGTTGGGAACGTTCTTTGGATGGAAAATCGGGACGATGAAGACTCATCTTCCTGGACTAAAAACAACACCGACCACAATCATCTCAAC
CACCCTGTTAATTGCTCTGTTTTGAACAACAAAGACGAAATCACCTCCCTTTCTACCTTCAAATCCATGCTTGAGGTTGAAGATGACTGGTGTATCTCTGCTAATGCTCT
CCATAACCATAACCACCACACCGACATCAATGACATTACCTTCTCTCAAAATTTCACCGACCCACCTGATAATTTGTTGCTCCCCCCTGGAGATTCCTCCTCTTCTTGTT
CCCCTTCTTCTTCTGTGTTTAATAACATTGACCCATCTCAATTGCGTTTCTTCTTACCTCCAACTCGCACTTTGTCTTCACTTCATAAGGTAGTTTCTAACAACCCTTTA
GACCATGGCTTCGATTTGGGAGCAGAGGTTGGGTTTCTTGACGTCCAAGCTTCAAATGCTTCGACTCTGCTCAACGATGGAGGTGGGTTATTAACTGGGTTCACTGATTT
AAGCCCAACTAGTCAGATGAACACTCCTAGTTTGTGCTTAGGTTCTCAATTGACAGCACAAAACGTGGCCCCAATGAGTGATAATTGTTCGGGATTAGCTGGATTTCAGA
GTTTTGATGAGAATTTGGGAAATGCTCTGCTTTTGAATCGGTCTAAGCTTTTGAGACCACTTGAATCTTTTCCCTCAGTGGGAGCTCAGCCGACTCTTTTCCAGAAGAGG
GCTGCTCTAAGGAAGAGTTTAGCTGATAAGGGAAGCAGTTTGGGGGTTTTGAGCCCCGATGGCGGCTGGTTTTCAAATAGGATTGAAGGGGGGATTGGGAAAAATGAAAT
GGGTGAAGAAAATGGGAAGAAGAGGAAAATGGTTTATGCAGATGAATTGCAAGATACTAGCATCGATACATCCCGTTTCAATTACGATTCTGATGACTTTACCGAGAATA
CTAACACTAAATTGGATGAGAGTGGTAGAAATGTTGGAAATACATCTAACGCCAATAGTACAGTAACCGGCGGCGACCAGAAGGGGAAGAAAAAAGGACTTCCAGCGAAG
AATTTAATGGCCGAGAGACGCCGGAGGAAGAAGCTCAATGATAGGCTGTACATGCTGAGGTCCGTTGTTCCAAAAATCAGCAAAATGGATAGAGCTTCAATTCTTGGAGA
TGCAATTGAGTACTTGAAGGAATTACTGCAAAGAATCAACGACCTCCATAATGAATTGGAGTTTTCTCCTTCTGGGGCAGCCTTGACGCCAGGTGCAAGCTTCCATCCCT
TGACTCCAACACCACCAAGCCTCTCGAGTCGTATAAAGGAGGAGCTTTGTCCTACCTCATTTCCCAGCCCAAACGGCCAACCTGCAAGGGTCGAAGTTAGAGTACGAGAA
GGACGTGCAGTAAATATACACATGTTTTGTGGCCGCCGACCGGGTCTCTTGCTCTCTACAGTTAGGGCATTAGATAATCTTGGACTGGATATCCAACAGGCTGTGATTAG
CTGCTTTAATGGTTTTGCTATGGACATTTTTCGAGCAGAGCAATGCAGCGAAGGTCAAGATGTCCATCCTGAGCAAATAAAAGCAATATTATTGGATTCAGTTGGCTTCA
ATAGTGCCACATAAATATCTGCTAGACAAGTAAAGAATACTTGTCCTTTGACAAACTGAACCATTTCAATCAGATTCTACCTTGCTTTTTTTTCTTCTTAGGCTGAGTTC
TCTGTTGTTCATCAAGTAATTGACTCCATTGTTGACTCAGAAGTAAAATCTTCTGGAATATTATGTGCATTGACTTGTTGTTGAGATGATTGTCACAATTTAAAGTTGCG
GTTTGTGTAACTATTCCATGTTTCAGAAAAAAAGTGGATTGCATTAGTCAAGAGGTCGTAACTTGATAATCTCATCCTTCTGAATCATCACTAATCAAAAGATTAGATAA
TTTCACTCTATGTTTTCATCCATTTTGGTTGAGCACACCCAACTTCATCCCTACATCAGCTCTAACATATCTTAGCTGCTCGAAATATATATTAATAAGATGAATTGGTT
CTTTTTTTCAAGAGAAAAGCAAGAGAGAAAGAGAGGGCTGAACCATTCTACTCAATGCAGAACTAGGATTAAATTTGCACGATGGACATGATTTATGATCTCACAATATC
AAACTCCTTAGCACTAACTAGTTTTAACTATAAAAGTGTGCTGTCGATGTACAAAGAGCAATTTCCTGTTTGCAACTAAAACTGCTAAGAAACACTAAACCAAACGCTTT
TTGACAATCTCAAATGCCTAAAGCAAACCAAAATGCATGTTTCTGCATTTGGGACACTTCAATGAATTGCATGATACAGAAGCTTTTCCTTTGAATCAGAAGAACTCCAT
ATGCCCTATGATGCGAAAATGGTTTTACCAATTAGTATAACCAAGAAATGGAAAAATATCACAAGCTATTGCGTTTGCTTGTTGGTACGCACATTTGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLSRVGNVLWMENRDDEDSSSWTKNNTDHNHLNHPVNCSVLNNKDEITSLSTFKSMLEVEDDWCISANALHNHNHHTDINDITFSQNFTDPPDNLLLPPGDSSSSCSPSS
SVFNNIDPSQLRFFLPPTRTLSSLHKVVSNNPLDHGFDLGAEVGFLDVQASNASTLLNDGGGLLTGFTDLSPTSQMNTPSLCLGSQLTAQNVAPMSDNCSGLAGFQSFDE
NLGNALLLNRSKLLRPLESFPSVGAQPTLFQKRAALRKSLADKGSSLGVLSPDGGWFSNRIEGGIGKNEMGEENGKKRKMVYADELQDTSIDTSRFNYDSDDFTENTNTK
LDESGRNVGNTSNANSTVTGGDQKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELEFSPSGAALTPGASFHPLTPT
PPSLSSRIKEELCPTSFPSPNGQPARVEVRVREGRAVNIHMFCGRRPGLLLSTVRALDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCSEGQDVHPEQIKAILLDSVGFNSAT