; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G10410 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G10410
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCCHC-type domain-containing protein
Genome locationChr1:6561072..6561974
RNA-Seq ExpressionCSPI01G10410
SyntenyCSPI01G10410
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_011658449.1 uncharacterized protein LOC105436008 [Cucumis sativus]3.1e-8675.11Show/hide
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        MAS+SQQTKENG MPI YPML PHNYT+WTIK EAILD Q VWEA EP RG                           A+KK+AKEIWD+LKTRYLGSER
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        VKMARV  LKSEFNVL+MKETETI++FAGKIS LASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYL IV  IEQFQDLETMPFEE IGRM  YEERTT+L  N
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        NNNTDGQLLLTHAEWKARQK +SG NSSMNKGH
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XP_031737549.1 uncharacterized protein LOC116402439 [Cucumis sativus]2.3e-9783.62Show/hide
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        MASISQQTKENGGM ILY MLTPHNYTVWTIKAEAILD QGV EA EPARGAE                           KKTAKEIWDSLKTRYLGSER
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        VKMARVQTLKSEF+VL+MKETETI++FAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIV GIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN
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        NNNTDGQLLLTH EWKARQKGHSGDNSSMNKG
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XP_031741713.1 uncharacterized protein LOC116403908 [Cucumis sativus]3.9e-8981.28Show/hide
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        M ILYPMLTPHNYTVWTIKAEAIL+ QGVWEA EPARGAE                           KKTAKEIWDSLKTRYLGSERVKMARVQTLKSEF
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        NVL+MKE ETI++F GKISGLASKFTTL VALEDSSLV KLLDSVPDKYLPIV GI+QFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTR RENNNNTDGQLLLTHA
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        EWKARQKGHSGDNSSMNKG
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XP_031745073.1 uncharacterized protein LOC116405251 [Cucumis sativus]7.1e-9983.62Show/hide
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        M S SQQTKENGGMPILYPMLTPHNYTVWTIKAEAILD QGVWEA EPARGAE                           KKTAKEIWDSLKTRYLGSER
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        VKMARVQTLK EFNVL+MKETE I++FAGKISGLASKFTTLGVAL+DSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN
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        NNNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSGDNSSM KG
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XP_042446635.1 uncharacterized protein LOC122031604 [Zingiber officinale]2.6e-7772.6Show/hide
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        KENGG+   YPML+PHNYTVW IK EAILD QGVWEA EPA GA+           KKTAKE+WDSLKTRYLGS+RVK ARVQTLKSEF+ L+MKETETI
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Query:  NDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLRENNNNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSG
        ++FA K+S L+SKF+TLG  LEDSSLVKKLLDSVPDK+ PIVAGIEQF DLE++PFEEAIGR+KAYEERT RLR N N+T+G+LLLTHAEW+ RQKG + 
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Query:  DNSSMNKG
        D SS  KG
Subjt:  DNSSMNKG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251U1A0 Putative zinc finger, CCHC-type2.8e-4846.55Show/hide
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        +A+ S   KEN  +   YP LT  NYT W+IK EAILD QG+W++ EP  G                           A+KKTAKE+W+SLKTR++G+ER
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Query:  VKMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN
        V+ AR+ TLKSEF  L+MK+ ET++++AGK+SG+ SK+ ++G  L D  LV KLLD+  +K++ +VA +EQ+ D+ETMPFEEAIGR+KAYE+R  RLR+ 
Subjt:  VKMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN

Query:  NNNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSGDNSSMNKG
        N   +  LLLT  + +A  KG    +S  N+G
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A0A251VAV7 Putative zinc finger, CCHC-type1.6e-4848.05Show/hide
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        A+ S   KE   + +  P LT  NYT W IK EA++D QG+WE+ EP             AR               A+KKTAKEIW+SLKTRY+G+ERV
Subjt:  ASISQQTKENGGMPILYPMLTPHNYTVWTIKAEAILDVQGVWEATEP-------------ARG--------------AEKKTAKEIWDSLKTRYLGSERV

Query:  KMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLRENN
        + AR+ TL SEF  L+ K+ E+I+DFAGK+SGL SK+ +LG  LED  LV+KLLD+VPD+YL +VA +EQ+ D+++MPFEEA+GR+KAYE+R  +LR+ N
Subjt:  KMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLRENN

Query:  NNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSGDNSSMNKG
         +++  LLLT +E    QK      SS  +G
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A0A5N6NYJ8 CCHC-type domain-containing protein1.1e-4946.55Show/hide
Query:  MASISQQTKENGGMPILYPMLTPHNYTVWTIKAEAILDVQGVWEATEPARG---------------------------AEKKTAKEIWDSLKTRYLGSER
        +A+ S   K+   + +  P LT  NYT W IK EA++D QG+WE+ EP  G                           A+KKTAKEIWDSLK RY+G++R
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Query:  VKMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN
        V+ AR+ TLK+EF +L+MKE E++++FAGK++G+ +K+ +LG  ++D  LV+KLLDSVPDKYL +VA IEQ+ D++TMPF+EAIGR+KAYE+R  +LR  
Subjt:  VKMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN

Query:  NNNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSGDNSSMNKG
        N  TD  LLLT  E ++  KG     S   +G
Subjt:  NNNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSGDNSSMNKG

A0A5N6P849 Uncharacterized protein8.0e-4845.69Show/hide
Query:  MASISQQTKENGGMPILYPMLTPHNYTVWTIKAEAILDVQGVWEATEPARG---------------------------AEKKTAKEIWDSLKTRYLGSER
        MA  +   KE+  M +  P+LT  NYT W IK EAILD QG+W+A EP  G                           ++KKTA+E+W+SLK RYLG+ER
Subjt:  MASISQQTKENGGMPILYPMLTPHNYTVWTIKAEAILDVQGVWEATEPARG---------------------------AEKKTAKEIWDSLKTRYLGSER

Query:  VKMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN
        V+ AR+ TL+SEF  L+MK+ ETI+++ GK+SG+ SK ++LG  L DS LV+KL D+VPDK++P+VA IEQ+ DL++MPFEEAIGR+KAYE+R  ++R+ 
Subjt:  VKMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLREN

Query:  NNNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSGDNSSMNKG
        +  T+  LLL+  + K   +     +SS  +G
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B6TPM7 Retrotransposon protein9.5e-4948.85Show/hide
Query:  YPMLTPHNYTVWTIKAEAILDVQGVWEATEPARGAE---------------------------KKTAKEIWDSLKTRYLGSERVKMARVQTLKSEFNVLQ
        YP+L+P +YT W IK E+ILD QG+WEA  P    E                           KKTA E+W SLKTR++G++RVK AR+ TLK EF+ L 
Subjt:  YPMLTPHNYTVWTIKAEAILDVQGVWEATEPARGAE---------------------------KKTAKEIWDSLKTRYLGSERVKMARVQTLKSEFNVLQ

Query:  MKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERT-TRLRENNNNTDGQLLLTHAEWK
        M++ E ++D+AGKISG+A+++  LG  L+D+++VKKLLD+VPD+  P+VAGIEQF D+ETMPFEEA+GR+KA++ER+  R        D QLLLT AEWK
Subjt:  MKETETINDFAGKISGLASKFTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERT-TRLRENNNNTDGQLLLTHAEWK

Query:  ARQKGHSGDNSSMNKGH
        AR+K  S      N G+
Subjt:  ARQKGHSGDNSSMNKGH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAGCATCTCGCAACAAACAAAGGAGAATGGTGGAATGCCGATTCTCTACCCGATGTTAACTCCACACAACTACACGGTGTGGACGATAAAGGCAGAAGCAATCCT
CGATGTTCAAGGAGTTTGGGAAGCAACAGAGCCAGCGAGAGGAGCCGAAAAGAAGACCGCAAAGGAAATATGGGATAGTCTCAAGACAAGGTACTTGGGCAGTGAGCGGG
TGAAGATGGCGAGAGTTCAAACCTTGAAGAGTGAGTTTAATGTTCTTCAGATGAAGGAAACCGAGACGATCAATGATTTCGCAGGAAAAATCAGCGGATTAGCAAGCAAG
TTCACCACCCTCGGGGTTGCACTTGAGGATTCATCATTGGTCAAGAAGCTCCTCGATTCCGTCCCCGACAAATATCTTCCCATTGTCGCCGGAATCGAGCAATTCCAAGA
TCTCGAAACTATGCCGTTTGAAGAAGCAATTGGACGGATGAAGGCATACGAGGAGCGAACAACACGACTCCGAGAAAACAATAACAACACCGATGGGCAACTCCTACTTA
CCCATGCCGAATGGAAAGCTAGACAAAAAGGACATAGTGGTGACAACTCTTCGATGAACAAAGGGCATTTGGTGGTACCGATCGAGGAAGATGGCGAGGACATGGTCGTG
GCTGTGGTCGTGACACTGAGCGTCAAAATAGTGCGGGAGACACTAGCAACACTGGAAATGGCACTCGTGATAAAAGTCACATTAAGTGTTTCACTTGCAACAAGATGGAA
CATTACGCGTCGAAATGTCCTGGAAAAGGTCGTGACGACGAAGCTCATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAAGCATCTCGCAACAAACAAAGGAGAATGGTGGAATGCCGATTCTCTACCCGATGTTAACTCCACACAACTACACGGTGTGGACGATAAAGGCAGAAGCAATCCT
CGATGTTCAAGGAGTTTGGGAAGCAACAGAGCCAGCGAGAGGAGCCGAAAAGAAGACCGCAAAGGAAATATGGGATAGTCTCAAGACAAGGTACTTGGGCAGTGAGCGGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASISQQTKENGGMPILYPMLTPHNYTVWTIKAEAILDVQGVWEATEPARGAEKKTAKEIWDSLKTRYLGSERVKMARVQTLKSEFNVLQMKETETINDFAGKISGLASK
FTTLGVALEDSSLVKKLLDSVPDKYLPIVAGIEQFQDLETMPFEEAIGRMKAYEERTTRLRENNNNTDGQLLLTHAEWKARQKGHSGDNSSMNKGHLVVPIEEDGEDMVV
AVVVTLSVKIVRETLATLEMALVIKVTLSVSLATRWNITRRNVLEKVVTTKLI