; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G10840 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G10840
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionPatatin
Genome locationChr1:6779517..6779852
RNA-Seq ExpressionCSPI01G10840
SyntenyCSPI01G10840
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056869.1 hypothetical protein E6C27_scaffold96G00380 [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-4394.85Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGL
        MAATAPVAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQS+MSWRRK KLTSNRF+TKMCSTFDASRSNRMNKISG+
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGL

KAG6584077.1 hypothetical protein SDJN03_20009, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.4e-3775.44Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELE--TSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCST-FDASRSNRMNKISGL
        MAATA VAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELE  +S SSQR Q P+MA+SGC SSPPTFW S+MSWRRK K + +RFV K+CS+ FD S SN+MNKISG 
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELE--TSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCST-FDASRSNRMNKISGL

Query:  SYTILQNDFHSLHM
        +YTILQN+FHSLHM
Subjt:  SYTILQNDFHSLHM

KGN64543.2 hypothetical protein Csa_013063 [Cucumis sativus]1.2e-5299.1Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAA APVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHM
        ILQNDFHSLHM
Subjt:  ILQNDFHSLHM

XP_011648422.1 uncharacterized protein LOC105434455 [Cucumis sativus]1.2e-5299.1Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAA APVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHM
        ILQNDFHSLHM
Subjt:  ILQNDFHSLHM

XP_016898893.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485409 [Cucumis melo]1.0e-5195.5Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAATAPVAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQS+MSWRRK KLTSNRF+TKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHM
        ILQNDFHSLH+
Subjt:  ILQNDFHSLHM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX43 Uncharacterized protein5.8e-5399.1Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAA APVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHM
        ILQNDFHSLHM
Subjt:  ILQNDFHSLHM

A0A1S4DSE9 uncharacterized protein LOC1034854094.9e-5295.5Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAATAPVAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQS+MSWRRK KLTSNRF+TKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHM
        ILQNDFHSLH+
Subjt:  ILQNDFHSLHM

A0A314Z3X1 Uncharacterized protein2.9e-2049.57Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELET---SISSQRSQGP--EMASSGC-RSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKI
        MAA AP+AIGTRGT+GSLV+KEI+YF+K+EL+    S SS++ QG   +M SS C  SS P+FW  +M+W+RK + +S RF++ +CS    + +NR+N I
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELET---SISSQRSQGP--EMASSGC-RSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKI

Query:  SGLSYTILQNDFHSL
         G +Y IL++D ++L
Subjt:  SGLSYTILQNDFHSL

A0A5A7UTL1 Uncharacterized protein1.4e-4394.85Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGL
        MAATAPVAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQS+MSWRRK KLTSNRF+TKMCSTFDASRSNRMNKISG+
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGL

A0A6J1CHB1 uncharacterized protein LOC1110108624.6e-3472.32Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCR-SSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSY
        MAATAPVAIGTRGT+GSLVKKEIDYFAKIE E      R  G +MASS  R SSPPTFW ++MSWRRK K   NRF+TK+CS FD S SNR+NKISG +Y
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCR-SSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSY

Query:  TILQNDFHSLHM
        TILQNDF+SLHM
Subjt:  TILQNDFHSLHM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G21780.1 unknown protein1.0e-0938.53Show/hide
Query:  APVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIE-LETSISSQRSQGPEMASS----GCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLT---SNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISG
        AP+AIGTRGTIGSLV+KEIDYF            +R    E  ++       SS    W S   WR+K + T     +F   MCS  + S  NR   + G
Subjt:  APVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIE-LETSISSQRSQGPEMASS----GCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLT---SNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISG

Query:  LSYTILQND
         +Y IL++D
Subjt:  LSYTILQND


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCAACTGCTCCTGTTGCCATTGGAACTCGAGGAACCATTGGTTCACTCGTCAAGAAGGAAATAGATTATTTTGCCAAGATTGAGCTTGAAACCTCCATCAGCTC
ACAGAGGTCTCAAGGACCTGAAATGGCTTCGTCTGGCTGTAGAAGTTCACCACCCACCTTCTGGCAATCTTTAATGTCATGGCGAAGGAAGACGAAGCTAACCAGCAATC
GCTTTGTTACAAAAATGTGCTCGACTTTTGATGCTTCGAGAAGCAATCGAATGAATAAGATTTCTGGGTTGAGTTATACGATCCTTCAGAATGATTTCCATAGCTTGCAC
ATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCAACTGCTCCTGTTGCCATTGGAACTCGAGGAACCATTGGTTCACTCGTCAAGAAGGAAATAGATTATTTTGCCAAGATTGAGCTTGAAACCTCCATCAGCTC
ACAGAGGTCTCAAGGACCTGAAATGGCTTCGTCTGGCTGTAGAAGTTCACCACCCACCTTCTGGCAATCTTTAATGTCATGGCGAAGGAAGACGAAGCTAACCAGCAATC
GCTTTGTTACAAAAATGTGCTCGACTTTTGATGCTTCGAGAAGCAATCGAATGAATAAGATTTCTGGGTTGAGTTATACGATCCTTCAGAATGATTTCCATAGCTTGCAC
ATGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAATAPVAIGTRGTIGSLVKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSLMSWRRKTKLTSNRFVTKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLH
M