| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036972.1 DNA-directed RNA polymerase [Cucumis melo var. makuwa] | 5.1e-80 | 97.47 | Show/hide |
Query: LLLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEK
+LL RTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEK
Subjt: LLLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEK
Query: TADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
TADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVP+QLPYGPPAILS
Subjt: TADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| KAG6583479.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.6e-79 | 96.82 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR SVP QLPYGPPAILS
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| XP_004148776.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X1 [Cucumis sativus] | 8.6e-80 | 98.09 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| XP_008465290.2 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 [Cucumis melo] | 2.5e-79 | 97.45 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVP+QLPYGPPAILS
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| XP_031736287.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X2 [Cucumis sativus] | 8.6e-80 | 98.09 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LXJ4 DNA-directed RNA polymerase | 2.7e-103 | 100 | Show/hide |
Query: MKKPKVQGCEPWGFTKGASLFFKPRHKPDLLLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLM
MKKPKVQGCEPWGFTKGASLFFKPRHKPDLLLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLM
Subjt: MKKPKVQGCEPWGFTKGASLFFKPRHKPDLLLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLM
Query: TFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
TFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
Subjt: TFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| A0A1S3CNX9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 1.2e-79 | 97.45 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVP+QLPYGPPAILS
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| A0A5A7T0K7 DNA-directed RNA polymerase | 2.5e-80 | 97.47 | Show/hide |
Query: LLLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEK
+LL RTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEK
Subjt: LLLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEK
Query: TADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
TADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVP+QLPYGPPAILS
Subjt: TADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| A0A6J1HLT9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 4.6e-79 | 96.82 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR SVP QLPYGPPAILS
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| A0A6J1I0L0 DNA-directed RNA polymerase subunit | 4.6e-79 | 96.82 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR SVP QLPYGPPAILS
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A4IF62 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 9.4e-45 | 60.53 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL L+AVM T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT++GEVLGITRFG+ KM +SVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGP
ADHLF+A+ G+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+ + + P P
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGP
|
|
| F4JXF9 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 | 2.0e-50 | 66.45 | Show/hide |
Query: TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
T L AVMGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+RGEVLGI R GIQKMDKSVLM ASFE+T DHLF
Subjt: TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
Query: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
+A+ +G+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR +L YGP I+S
Subjt: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| O14802 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 1.2e-44 | 60.53 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL L+AVM T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT++GEVLGITRFG+ KM +SVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGP
ADHLF+A+ G+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+ + P P
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGP
|
|
| Q5ZL98 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 7.2e-45 | 60.53 | Show/hide |
Query: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
LL L+AVM T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT++GEVLGITRFG+ KM +SVLMLASFEKT
Subjt: LLEPRTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKT
Query: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGP
ADHLF+A+ G+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+ + P P
Subjt: ADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGP
|
|
| Q86AQ5 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc1 | 6.1e-44 | 64.18 | Show/hide |
Query: LQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNA
L+AVM T G+ G +T SNHI+E + LGIE AR I+ EI M SHGMSIDIRH+MLL DLM+F+GE+LGITRFGI KM +SVLMLASFEKT DHLF+A
Subjt: LQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNA
Query: SVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
+V+ R D I GVSEC+IMG+ +PLGTG+ K+ ++
Subjt: SVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G57660.1 nuclear RNA polymerase A1 | 2.1e-15 | 34.71 | Show/hide |
Query: SNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECV
SN I ++ + G+EAAR+ II EI + +S+G+S+ IRH+ L+ D MTF G ++R G S +FE + A+ G D +E S +
Subjt: SNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECV
Query: IMGIPMPLGTGMLKVRQRVSV
+G+P GTG + QRV +
Subjt: IMGIPMPLGTGMLKVRQRVSV
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 2.5e-24 | 42.52 | Show/hide |
Query: LQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNA
L AVM E VD T SNH+IE+ +VLGIEA R+ +++E++ + G ++ RH+ +L D MT+RG ++ ITR GI + D LM SFE+T D L +A
Subjt: LQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNA
Query: SVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTG
+ D + GV+E +++G P+GTG
Subjt: SVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTG
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 1.4e-51 | 66.45 | Show/hide |
Query: TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
T L AVMGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+RGEVLGI R GIQKMDKSVLM ASFE+T DHLF
Subjt: TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
Query: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
+A+ +G+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR +L YGP I+S
Subjt: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 1.4e-51 | 66.45 | Show/hide |
Query: TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
T L AVMGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+RGEVLGI R GIQKMDKSVLM ASFE+T DHLF
Subjt: TGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
Query: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
+A+ +G+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR +L YGP I+S
Subjt: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRVSVPQQLPYGPPAILS
|
|
| ATCG00170.1 DNA-directed RNA polymerase family protein | 2.1e-07 | 29.63 | Show/hide |
Query: PWGFTKGASLFFKPRHKPDLLLEPRTGL----QAVMGTEGVDGCNTKSNHI-IEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGE
PWGF GA L +++ R L Q V ++GV + HI I V+Q+ + + + E G+ R L + + +R
Subjt: PWGFTKGASLFFKPRHKPDLLLEPRTGL----QAVMGTEGVDGCNTKSNHI-IEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGE
Query: VLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLK
+LGITR + +S + ASF++TA L A++ GR D ++G+ E V++G +P GTG K
Subjt: VLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLK
|
|
