| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6583479.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.6e-84 | 80.93 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQF+TFSG+EISK+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+ DFLRKMRNPKLE LRK +L KKIIKKC+ LT+ NKS + C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| XP_004148776.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.8e-92 | 89.69 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTR C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| XP_008465290.2 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 [Cucumis melo] | 2.6e-90 | 87.11 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC+TCHANFGDCPGHYGYVNL+LPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+KDFLRKMRNPKLEALRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKST+ C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| XP_038894318.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X1 [Benincasa hispida] | 2.1e-87 | 84.02 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQ EGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSG+EISK+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC TCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+KDFLRK+RNPKLE LRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKST+ C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| XP_038894319.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X2 [Benincasa hispida] | 2.1e-87 | 84.02 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQ EGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSG+EISK+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC TCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+KDFLRK+RNPKLE LRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKST+ C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LSG9 DNA-directed RNA polymerase | 6.0e-93 | 93.01 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTR-----LLSSLDACYYLL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTR L+ LD +Y +
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTR-----LLSSLDACYYLL
|
|
| A0A1S3CNX9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 1.3e-90 | 87.11 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKC+TCHANFGDCPGHYGYVNL+LPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+KDFLRKMRNPKLEALRK DLVKKIIKKCSTLTTGNKST+ C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| A0A2I4DDG5 DNA-directed RNA polymerase subunit | 8.2e-66 | 69.82 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
M AQ E + FTK PYIEDVGPRKIKSM+F+TFS +EISKLAEVQVYKG YYD R PI+GGLLDPRMGPANK C CATCH +FG+CPGH+GY+ LA+PV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTR
+NVGY +TIL+ILKCICKSC+ ILLEE L K++L+KMR+PK+E L+K +L+K I+KKC+ LT+GNK+ +
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTR
|
|
| A0A6J1HLT9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 3.9e-84 | 80.41 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MN+AQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQF+TFSG+EISK+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+ DFLRKMRNPKLE LRK +L KKIIKKC+ LT+ NKS + C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| A0A6J1I0L0 DNA-directed RNA polymerase subunit | 1.1e-83 | 79.9 | Show/hide |
Query: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
MN+ QVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQF+TFSG+EISK+AEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGY++LALPV
Subjt: MNRAQVEGLVFTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPV
Query: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKL+ DFLRKMRNPKLE LRK +L KKIIKKC+ LT+ NKS + C YL + K ++ L
Subjt: FNVGYFTTILEILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNKSTRLLSSLDACYYLLPKLFKTRELISTL
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| F4JXF9 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 | 1.4e-51 | 61.44 | Show/hide |
Query: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTIL
FTK+PYIEDVGP KIKS+ F+ S E+ K AEVQV+ YD + KP + GLLDPRMGP NK C TC NF +CPGHYGY+ L LPV+NVGYF IL
Subjt: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTIL
Query: EILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTT
+ILKCICK CS +LL+EKL++D LRKMRNP++E L+K +L K ++KKCST+ +
Subjt: EILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTT
|
|
| O94666 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc1 | 2.7e-26 | 41.72 | Show/hide |
Query: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQV-YKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKC
I+D P++IK +QF E K V+V + LY T R P + G LD MG +NK CATC + DC GH+GYV LALPVF++GYF L IL+
Subjt: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQV-YKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKC
Query: ICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNK
ICK CS +LL ++ + FL+ +R P ++ LR+ + K+I C + +K
Subjt: ICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTTGNK
|
|
| P04051 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 3.8e-28 | 42.45 | Show/hide |
Query: PRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYD--TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCICKS
P++IK ++F+ S A+I +EV+V +D R P G LDP+MG ++ +CATCH N C GH+G++ LALPVF++GYF ++IL+ ICK+
Subjt: PRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYD--TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCICKS
Query: CSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKC
CS ILL E + FL ++R P ++ LR++ ++KKI+ +C
Subjt: CSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKC
|
|
| Q6BI69 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 3.7e-31 | 42.36 | Show/hide |
Query: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTT--RKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILK
+ DV P+ IK ++F S +I +EV+V+ YD R P DGG LD +MG ++ +CATCH N C GH+G++ LALPVF+VGYF +++L+
Subjt: IEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTT--RKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILK
Query: CICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKC
CICK+CS +LL+E+ + FL +R P ++ LR++ ++KK++++C
Subjt: CICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKC
|
|
| Q86AQ5 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc1 | 6.5e-28 | 44.37 | Show/hide |
Query: EDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYD-TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCI
ED P+KI +QF S +I +L+ VQ+ +D RKP G+LD ++G ++K C TC + DC GH+GY+ L LPVF++GY I+ IL+ I
Subjt: EDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYD-TTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCI
Query: CKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKC
CKSCS ILL E+ + +LRKMRN K++ L++ L+KKI +C
Subjt: CKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKC
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G40030.1 nuclear RNA polymerase D1B | 5.2e-04 | 32.65 | Show/hide |
Query: KCATCHANFGD-CPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCICKSCSRI
KC +C A D C GH+GY+ L +P+++ + + ++L +C C +I
Subjt: KCATCHANFGD-CPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCICKSCSRI
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 9.4e-22 | 39.16 | Show/hide |
Query: KIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTR--KPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCICKSCS
K++ +QF S EI +++ + V + +TT KP GGL D R+G ++ KC TC AN +CPGH+GY+ LA P+++VG+ T+L I++C+C +CS
Subjt: KIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTR--KPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTILEILKCICKSCS
Query: RILL--EEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLT
+IL EE FK + K++NPK + +KKI+ C T
Subjt: RILL--EEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLT
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 1.0e-52 | 61.44 | Show/hide |
Query: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTIL
FTK+PYIEDVGP KIKS+ F+ S E+ K AEVQV+ YD + KP + GLLDPRMGP NK C TC NF +CPGHYGY+ L LPV+NVGYF IL
Subjt: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTIL
Query: EILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTT
+ILKCICK CS +LL+EKL++D LRKMRNP++E L+K +L K ++KKCST+ +
Subjt: EILKCICKSCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTT
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 2.8e-50 | 57.67 | Show/hide |
Query: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTIL
FTK+PYIEDVGP KIKS+ F+ S E+ K AEVQV+ YD + KP + GLLDPRMGP NK C TC NF +CPGHYGY+ L LPV+NVGYF IL
Subjt: FTKQPYIEDVGPRKIKSMQFTTFSGAEISKLAEVQVYKGLYYDTTRKPIDGGLLDPRMGPANKGCKCATCHANFGDCPGHYGYVNLALPVFNVGYFTTIL
Query: EILKCICK----------SCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTT
+ILKCICK CS +LL+EKL++D LRKMRNP++E L+K +L K ++KKCST+ +
Subjt: EILKCICK----------SCSRILLEEKLFKDFLRKMRNPKLEALRKVDLVKKIIKKCSTLTT
|
|
