; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G13460 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G13460
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRrna intron-encoded homing endonuclease
Genome locationChr1:8951927..8952416
RNA-Seq ExpressionCSPI01G13460
SyntenyCSPI01G13460
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF1854983.1 hypothetical protein Lal_00045103 [Lupinus albus]2.5e-4695.96Show/hide
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KAG8365712.1 hypothetical protein BUALT_Bualt17G0000400 [Buddleja alternifolia]6.1e-4898.99Show/hide
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PPR87549.1 hypothetical protein GOBAR_AA33147 [Gossypium barbadense]1.5e-4696.97Show/hide
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TKY45627.1 hypothetical protein E2542_SST30377 [Spatholobus suberectus]3.3e-4695.96Show/hide
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TXG51768.1 hypothetical protein EZV62_024292 [Acer yangbiense]2.5e-49100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0R0GQW8 Uncharacterized protein4.0e-4593.94Show/hide
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A0A2P5W8Y1 Uncharacterized protein7.2e-4796.97Show/hide
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A0A4U5PNX9 Uncharacterized protein6.8e-4583.76Show/hide
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A0A5C7H450 Uncharacterized protein1.2e-49100Show/hide
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A0A6A5LDC5 Uncharacterized protein1.2e-4695.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTATGCGGAGATCATTGCAAT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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