; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G14330 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G14330
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr1:9945215..9946431
RNA-Seq ExpressionCSPI01G14330
SyntenyCSPI01G14330
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACR36505.1 unknown [Zea mays]2.0e-0444.23Show/hide
Query:  AASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAK---PGSGITGSRA--RTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRP
        A STL+   +      TT++  A    P +  TG     R+ NRVTF +SSW P +R  SPY SAAR LA+AAVS   L  + S APAVSS  SR+  R 
Subjt:  AASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAK---PGSGITGSRA--RTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRP

Query:  SLVR
        +  R
Subjt:  SLVR

RYQ97876.1 hypothetical protein Ahy_B08g093951 [Arachis hypogaea]8.8e-1672.84Show/hide
Query:  LVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRPSLVR
        LV N     GI GSRA  TNRVT L SSWIP ++  SPYSSAARALAIAAVSRR L AT SAAPAVSS ASRA LRPS VR
Subjt:  LVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRPSLVR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LY47 Uncharacterized protein7.9e-4799.08Show/hide
Query:  MFLIANAASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALR
        MFLIANAASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFL+SSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALR
Subjt:  MFLIANAASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALR

Query:  PSLVRVCSH
        PSLVRVCSH
Subjt:  PSLVRVCSH

A0A0E0GFT0 Uncharacterized protein6.8e-0656.34Show/hide
Query:  ANAASTLNRAAVP-FSNANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAA
        A A STL    VP  S ANT LV N +   G+ GSRA  TNRVTF  SSW+P +   SPYSSAAR  A+AA
Subjt:  ANAASTLNRAAVP-FSNANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAA

A0A444Y7Q4 Uncharacterized protein4.3e-1672.84Show/hide
Query:  LVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRPSLVR
        LV N     GI GSRA  TNRVT L SSWIP ++  SPYSSAARALAIAAVSRR L AT SAAPAVSS ASRA LRPS VR
Subjt:  LVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRPSLVR

A0A7C9D5Y8 Uncharacterized protein1.1e-1962.28Show/hide
Query:  MFLIANAASTLNRAAVPFSN-----ANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKAS
        MF  A A STL R AVP        ANT LV N +   GI GSRA  TNRVT LESS IP +   SPYSSAARA AIAAVS + L AT SAAPAVSSKAS
Subjt:  MFLIANAASTLNRAAVPFSN-----ANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKAS

Query:  RAALRPSLVRVCSH
        R   +P+LV VCSH
Subjt:  RAALRPSLVRVCSH

C4J5Q5 Uncharacterized protein9.8e-0544.23Show/hide
Query:  AASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAK---PGSGITGSRA--RTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRP
        A STL+   +      TT++  A    P +  TG     R+ NRVTF +SSW P +R  SPY SAAR LA+AAVS   L  + S APAVSS  SR+  R 
Subjt:  AASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAK---PGSGITGSRA--RTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRP

Query:  SLVR
        +  R
Subjt:  SLVR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCCTCATCGCAAATGCCGCCAGCACCTTGAATAGAGCCGCCGTTCCTTTCTCCAATGCGAACACTACGCTCGTCTTTAACGCCAAACCCGGTTCCGGAATCACCGG
ATCTCGTGCTAGGACAACGAATCGCGTCACGTTTCTCGAATCGTCTTGGATTCCGTTCTCGAGGATTTCGAGCCCGTACAGCTCGGCGGCGCGTGCGCTAGCGATTGCGG
CTGTATCGCGGAGGTTGTTGAGGGCTACGTGTTCGGCGGCGCCGGCGGTATCGTCGAAGGCTTCACGCGCGGCGTTGAGGCCGAGTTTGGTGAGAGTTTGTTCGCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATCATAATTATTTATTTCTTTTAAAACAATAGAAGGGGAAAGAGTCCAACCAAATAGTTCTTCAAATCTAGCTTTTGGGTTTTACATTTGAACATTTTGTATCATCAAT
CAGACAACATCAAAATAGTCAGCAGTGGATTATGCTTATGAACAACAATTTAAAAAATCAATGCATAAACAAATCATACAATTTGAATTAAAACACAACACCAATAATAA
TAATCTTATACTTTGATTTCAACCACTTTTGTTGGCCATGGCCATCTCCATTGGATACCAACCCAACACCCTGAAGAACGAAGCATATTCCTTCAACTCCGCCATAGCTT
CTTCACCTTTCCCTTCCTCCATTGACGCCTCAAAGTCCGCATAAAACACATACTCAAACCTCTTCACCCTCTCCTCCACTCTCATCGGACAGCTCCGGTGCGGCCTCGAT
TCAATCTTCGTCAACTTAATGTTCCTCATCGCAAATGCCGCCAGCACCTTGAATAGAGCCGCCGTTCCTTTCTCCAATGCGAACACTACGCTCGTCTTTAACGCCAAACC
CGGTTCCGGAATCACCGGATCTCGTGCTAGGACAACGAATCGCGTCACGTTTCTCGAATCGTCTTGGATTCCGTTCTCGAGGATTTCGAGCCCGTACAGCTCGGCGGCGC
GTGCGCTAGCGATTGCGGCTGTATCGCGGAGGTTGTTGAGGGCTACGTGTTCGGCGGCGCCGGCGGTATCGTCGAAGGCTTCACGCGCGGCGTTGAGGCCGAGTTTGGTG
AGAGTTTGTTCGCATTGAGCTAGGGCTTGAGGATGGGAAATAATTCTTCTGATGGATTCTGATCGGACTCCTGGTAAGGCTAAGAGGCAATGGTGAACCGGTAGTTGAAC
TTCGCCGATTATGTGGAGGGTATAGCGGAGGAGAAGATCATAGTTACGATGAATAGAACCGCCAAGGGAGTTTTCAATTGGGAGAACGGCGAGATCGGCAATGCGATTCT
CAACCGATTGAAAGGCAGTTTCGAATTGATCGCAGGGGATTGTTACGCAGTTAGGGCAGGCTTTGCCGGCGGCGGCTTCGGAGTAAGCACCGGGAACCCCTTGGTAAGCG
ACGTGAAGCTTTTGAGCGCCCATTGAAGCCGGAGACTACTTTCCGACGGTTGCGACGGCGTAGCCCTTGAGTTTTTCTTTGTTATTGAGTAATTTACAAAGTGGGTGGAC
AGAAATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLIANAASTLNRAAVPFSNANTTLVFNAKPGSGITGSRARTTNRVTFLESSWIPFSRISSPYSSAARALAIAAVSRRLLRATCSAAPAVSSKASRAALRPSLVRVCSH