; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G14840 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G14840
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationChr1:10507105..10508243
RNA-Seq ExpressionCSPI01G14840
SyntenyCSPI01G14840
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64943.1 hypothetical protein Csa_022813 [Cucumis sativus]1.2e-126100Show/hide
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XP_038894579.1 uncharacterized protein LOC120083099 [Benincasa hispida]7.1e-11993.36Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein5.9e-127100Show/hide
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A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998841.6e-12498.76Show/hide
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A0A5A7SY45 Senescence regulator1.6e-12498.76Show/hide
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A0A6J1G2B0 uncharacterized protein LOC1114500331.1e-10987.7Show/hide
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A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666063.2e-10987.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11700.1 Protein of unknown function, DUF5841.3e-1248.24Show/hide
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        SAPVNVP  SK      +E      ++ +ED G M+PPHE +A+S  +    S    SV EG GRTLKGR+LR+VR+A+W +TGF
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AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5841.2e-3949.8Show/hide
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        +P +  S+PSS   + D  D ELNEDD+F        ++  SH+ P +     SS +  +     LQ  K G    E  GILAALPE+  SSS   S  F
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        +HK          ++ SSSSSS       S SS+R IPT PKPP +RLP   S     KY QSAPV VP++S A++ R        +V  DD +E++GEM
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        LPPHEIVARSLAQS +LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAV+RRTGF+D
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5841.2e-1541.56Show/hide
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        + + L E E SS       SHF    S SSSSSSSP + R    +             + +K  SAP+NVP  SK     +              DD ++
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Query:  DDGEMLPPHEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRTGFLD
        DDG M+PPHE VAR LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL +VRNAV  +TGFL+
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5841.3e-1440.54Show/hide
Query:  ENEASSSLRNSSHFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISTSLKYQSAPVNVPIMSKAVVQRQLEVD-------VDDVDEDDGEML
        E E  S LR S     +  +S S    S+SS SS+R IP   +         +S   K  SAP+N+P  SK     +           +D  D+D+G M+
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        PPHE+VA+ LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL + RNAV  RTGFL+
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AT5G60680.1 Protein of unknown function, DUF5841.2e-1037.67Show/hide
Query:  ENEASSSLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISTSLKYQSAPVNVPIMSKAV-------VQRQLE--VDVDDVDEDDGEMLPP
        E++  + + + S  + +   SS  S   SS+R             P   S++    S PVNVP  SK +        +R +E   D DD +ED G+ LPP
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Query:  HEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRTGFLD
        HE     LA++ M S SV EG GRTLKGRDL +VRNA++ + GF D
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTCAACCTTCCTTCCTCCCGCTTCCGCCACCGCAATTCCCCTTCCTCCGAACGCTTTCTCGCCTCCTTCCCTTCTCCCCCCGTTCGCTCTTCAAACCCTAGTTC
CACCACCGCCCTCGACGACGATTCCGAGCTCAACGAAGACGACGTCTTCTGGACCGGCGATTTTGCTTCCGATTCCGTCCACCATAGCCACTCCACTCCTTCTTCCTCTT
CCTCTTCAACTCCTCGTCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGGTTTTCCTCTGCCTGAAACCTTCGGAATTCTCGCTGCTCTTCCCGAGAACGAGGCCTCCTCC
AGTCTTAGAAACTCTTCTCATTTCTATCACAAGGCCTCTGTTTCGTCTTCTTCCTCCTCCTCCCCTTCGTCTTCTCGTATGATTCCCACGATCCCCAAACCTCCTCTGGA
CCGATTGCCTCTTCCCATTTCGACCTCGTTGAAGTACCAGTCTGCACCTGTGAATGTGCCAATAATGTCGAAGGCGGTTGTTCAAAGACAGCTGGAGGTTGATGTGGACG
ATGTTGATGAAGACGATGGGGAGATGTTGCCGCCGCATGAGATTGTGGCTAGAAGTTTGGCTCAGTCGCCGATGTTGTCGTGCTCTGTGCTTGAGGGAGCTGGAAGGACG
TTAAAAGGGAGGGATCTTCGTCAGGTTCGCAACGCGGTTTGGAGACGAACAGGTTTTCTTGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATTGGAAGAATTATTGTGAAAATTAAAAGAAAAGAAAGCTGCGTTGTTCCCCTCATGGATTGGACGACGGCGCCCTGAATTCCTTCCTTTCTGAAATTCTGATTTTCC
GTACGGACCCGCCATTCCCATCATTCATTCATTCTTTCATTCATTCATTCTCATGGACCTCAACCTTCCTTCCTCCCGCTTCCGCCACCGCAATTCCCCTTCCTCCGAAC
GCTTTCTCGCCTCCTTCCCTTCTCCCCCCGTTCGCTCTTCAAACCCTAGTTCCACCACCGCCCTCGACGACGATTCCGAGCTCAACGAAGACGACGTCTTCTGGACCGGC
GATTTTGCTTCCGATTCCGTCCACCATAGCCACTCCACTCCTTCTTCCTCTTCCTCTTCAACTCCTCGTCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGGTTTTCCTCT
GCCTGAAACCTTCGGAATTCTCGCTGCTCTTCCCGAGAACGAGGCCTCCTCCAGTCTTAGAAACTCTTCTCATTTCTATCACAAGGCCTCTGTTTCGTCTTCTTCCTCCT
CCTCCCCTTCGTCTTCTCGTATGATTCCCACGATCCCCAAACCTCCTCTGGACCGATTGCCTCTTCCCATTTCGACCTCGTTGAAGTACCAGTCTGCACCTGTGAATGTG
CCAATAATGTCGAAGGCGGTTGTTCAAAGACAGCTGGAGGTTGATGTGGACGATGTTGATGAAGACGATGGGGAGATGTTGCCGCCGCATGAGATTGTGGCTAGAAGTTT
GGCTCAGTCGCCGATGTTGTCGTGCTCTGTGCTTGAGGGAGCTGGAAGGACGTTAAAAGGGAGGGATCTTCGTCAGGTTCGCAACGCGGTTTGGAGACGAACAGGTTTTC
TTGATTAAGGAATTGAATTCCAGTAATTATTTTTGGAGAACAGATTTGCACCATTCGCTAAGCTGCTACTGTCTGGTTCACTTTGACCACTTCTTGTGTCGCTCTTTTTA
GAAATATATATTGAGGGTCCAGGAATATTTGAATCTGCTTGACACTCATCGTAACGAGGAATTGGAATTGTAATTATCTGAAGGGCGCCTAAGAATTTTCTTTGAAGCTT
ATTTGTAAGTTTGACTGTTATCTCAAAACGTTTTTCAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISTSLKYQSAPVNVPIMSKAVVQRQLEVDVDDVDEDDGEMLPPHEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRT
LKGRDLRQVRNAVWRRTGFLD