; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G15050 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G15050
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description40S ribosomal protein S5
Genome locationChr1:10670123..10672130
RNA-Seq ExpressionCSPI01G15050
SyntenyCSPI01G15050
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000235 - Ribosomal protein S5/S7
IPR005716 - Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal
IPR020606 - Ribosomal protein S7, conserved site
IPR023798 - Ribosomal protein S7 domain
IPR036823 - Ribosomal protein S7 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035568.1 40S ribosomal protein S5 [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-10899.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

KAE8652818.1 hypothetical protein Csa_022860 [Cucumis sativus]1.7e-108100Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_004139502.3 40S ribosomal protein S5 [Cucumis sativus]1.7e-108100Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_004139812.1 40S ribosomal protein S5 [Cucumis sativus]1.8e-10798.07Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DV +QELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_008463640.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S5 [Cucumis melo]2.2e-10899.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5K0 Ribosomal_S7 domain-containing protein9.0e-10898.07Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DV +QELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A0A0LVI4 40S ribosomal protein S54.0e-10899.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVER TNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A1S3CLA9 40S ribosomal protein S51.1e-10899.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A5A7SN17 40S ribosomal protein S5-like isoform X12.6e-10798.07Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDV +QELTQ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A5D3E4H0 40S ribosomal protein S51.1e-10899.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65731 40S ribosomal protein S5 (Fragment)1.8e-9794.21Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        +VKLFNRW+FDDVQ++D+SL+DY+GV P+KHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTD NPIQVIVD
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIK+IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P46782 40S ribosomal protein S52.5e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P51427 40S ribosomal protein S5-26.8e-9786.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   DV ++      ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Q5E988 40S ribosomal protein S52.5e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

Q9ZUT9 40S ribosomal protein S5-16.2e-9886.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   ++ ++   Q  ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37270.1 ribosomal protein 5B4.4e-9986.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   ++ ++   Q  ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT2G37270.2 ribosomal protein 5B4.4e-9986.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   ++ ++   Q  ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.1 ribosomal protein 5A4.9e-9886.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   DV ++      ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.2 ribosomal protein 5A4.9e-9886.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   DV ++      ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

ATCG00900.1 Ribosomal protein S7p/S5e family protein2.7e-0835.29Show/hide
Query:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT
        RL N L+     +GKK +A +II  A++ I   T+ NP+ V+  A+    P     A R+G  G   +  ++I   +    AI  L   +R+   RN   
Subjt:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT

Query:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        +A  L+ EL++AAKGS +  AI+KK+E  R+A+ANR
Subjt:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGTTGAAGTTGATGTGGCAAGCCAGGAACTGACCCAGTCTCATCACGATGTGAAGCTGTTCAACCGCTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTGAACGACATCTCTTT
GGTTGATTACGTTGGGGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACACTGCTGGGAGGTATTCTGTCAAGCGCTTTCGGAAAGCTCAGTGCCCAATTGTGGAGA
GGCTCACAAATTCACTTATGATGCATGGTAGAAACAACGGGAAGAAGCTTATGGCAGTCCGGATTATTAAGCATGCAATGGAGATCATTCATCTTCTAACTGATCTCAAC
CCAATTCAAGTTATTGTTGACGCCGTTGTTAACAGTGGGCCACGTGAAGATGCTACTCGAATCGGTTCAGCCGGTGTTGTTAGGCGTCAGGCTGTGGATATATCCCCTCT
GCGTCGTGTTAACCAAGCAATCTATCTCCTTACGACTGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAATATCAAGACAATTGCAGAATGCTTAGCTGATGAACTTATTAATGCAG
CAAAGGGCTCTTCAAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCTAATCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTCTTTCTTCAACACTTCAGCCGCATCGTTCCTCTTCTCTAGGGCCATAGAGAGACCAGTGCGCCATTGCAGCGCTTAATAACTTCCCCTTCACTCTCTTCATCCTTT
GCTTCATTACTACGGAATAATGGCTGTTGAAGTTGATGTGGCAAGCCAGGAACTGACCCAGTCTCATCACGATGTGAAGCTGTTCAACCGCTGGACCTTTGATGATGTCC
AGGTGAACGACATCTCTTTGGTTGATTACGTTGGGGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACACTGCTGGGAGGTATTCTGTCAAGCGCTTTCGGAAAGCT
CAGTGCCCAATTGTGGAGAGGCTCACAAATTCACTTATGATGCATGGTAGAAACAACGGGAAGAAGCTTATGGCAGTCCGGATTATTAAGCATGCAATGGAGATCATTCA
TCTTCTAACTGATCTCAACCCAATTCAAGTTATTGTTGACGCCGTTGTTAACAGTGGGCCACGTGAAGATGCTACTCGAATCGGTTCAGCCGGTGTTGTTAGGCGTCAGG
CTGTGGATATATCCCCTCTGCGTCGTGTTAACCAAGCAATCTATCTCCTTACGACTGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAATATCAAGACAATTGCAGAATGCTTAGCT
GATGAACTTATTAATGCAGCAAAGGGCTCTTCAAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCTAATCGTTGAGGTAATATCTCGAGGTT
TGTTTTATGTCACACAACAAGAGTTTTATGTACTATTTTTTTGTCTCTGGCTACATTCTTCTAATGAACACTGAAGTTTAAGGTTCGGGTTTGGTTTCTTTGTTGTGACA
ATTCATATCTACTTGTTTTAGGTTTTTGAAGTTGAACAAGCTAATGCATGATGTGTTTCTTAAAGTTGGAGTATATTTTCTAGTATTAGTGAAACTTAACTGTCTCATTT
GGTTTTTTAGGTAAAATATTTTGCTAAGTGCAAGTTTTGGGTCCATATTGTTGTGGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLN
PIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR