; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G15380 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G15380
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionX-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like
Genome locationChr1:10951948..10952643
RNA-Seq ExpressionCSPI01G15380
SyntenyCSPI01G15380
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583719.1 hypothetical protein SDJN03_19651, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-4961.22Show/hide
Query:  MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLA
        ME+ + +  +N+++Y+ +    +SS   S+ VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FS+FPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLA
Subjt:  MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLA

Query:  TSSV-------SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEV--EEEEEEEDQ
        TSSV       SSSSSSSSFG YC F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE EE ++E     E  EE+ EEDEGCFT+EV  EEEEEEE++
Subjt:  TSSV-------SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEV--EEEEEEEDQ

Query:  KEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV
        +EG RR+LE+VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT  LIAV
Subjt:  KEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV

KAG7019366.1 hypothetical protein SDJN02_18326, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.7e-5062.71Show/hide
Query:  SLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV----
        ++N+++Y+ +    +SS   S+ VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FSLFPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLATSSV    
Subjt:  SLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV----

Query:  ---SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEV-EEEEEEEDQKEGKRRELE
           SSSSSSSSFG YC F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE E+E E+        +EE EEDEGCFT+EV EEEEEEE+++EG RR+LE
Subjt:  ---SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEV-EEEEEEEDQKEGKRRELE

Query:  IVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV
        +VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT  LIAV
Subjt:  IVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV

XP_022927104.1 X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like [Cucurbita moschata]2.0e-4658.96Show/hide
Query:  SLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV----
        ++N+++Y+ +    +SS N  + VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FSLFPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLATSSV    
Subjt:  SLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV----

Query:  ----SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGE---------------LLEEELEEDEGCFTDEVEEE
            SSSSSSSSFG Y  F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE EE ++E     E                 +EE EEDEGCFT+EVEEE
Subjt:  ----SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGE---------------LLEEELEEDEGCFTDEVEEE

Query:  EEEEDQKEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV
        EEE    EGKRR+LE+VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT  LIAV
Subjt:  EEEEDQKEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV

XP_031736046.1 uncharacterized protein LOC105434473 [Cucumis sativus]1.8e-11198.71Show/hide
Query:  MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV
        MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV
Subjt:  MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV

Query:  SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEV--EEEEEEEDQKEGKRRELEIV
        SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVA DEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEV  EEEEEEEDQKEGKRRELEIV
Subjt:  SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEV--EEEEEEEDQKEGKRRELEIV

Query:  VSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTHLIAV
        VSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTHLIAV
Subjt:  VSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTHLIAV

XP_038877796.1 glutamic acid-rich protein-like [Benincasa hispida]1.0e-6171.62Show/hide
Query:  SESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV--SSS
        S  SLNL + D   R++S   NC SKVE L RMVK TVF L+L LFFS FSLFPHSFSVYFSTF+FS+L HA+ERKYMFLICN GILFLLATSSV   SS
Subjt:  SESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV--SSS

Query:  SSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAV-AIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVSTE
        SSSSSFG      HS H+HHH L EHD+VAA+   D E      QEEEEE+EE I R E LEEE+EEDEGCFTDEVE+++EEE   EGKRRELE+VVSTE
Subjt:  SSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAV-AIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVSTE

Query:  ELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTHLIAV
        ELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT LIAV
Subjt:  ELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTHLIAV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVQ2 Uncharacterized protein2.5e-9090.95Show/hide
Query:  MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV
        MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV
Subjt:  MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV

Query:  SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVS
        SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVA DEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEE  KEGK+R  +  + 
Subjt:  SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVS

Query:  TEELNKKIEE
            +++IE+
Subjt:  TEELNKKIEE

A0A6J1CN51 nardilysin-like1.2e-3152.48Show/hide
Query:  MEQHLSESSLNLN---NYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILF
        ME+H     L+ +   N D + R+     N SSKV+ LK MVK    + VFCL++ LF SLFSLFPHSF++YFS  LFS+L HA++R YMFL+CN GIL 
Subjt:  MEQHLSESSLNLN---NYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILF

Query:  LLATSSVSSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKR-
        LLATS +  S+S          PH    HH+ L E +    V    E D D T          +     + EE E+DEGCFTDEVEEEEEEE   EGKR 
Subjt:  LLATSSVSSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKR-

Query:  RELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIE---AAQTHLIAV
         ELE+VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRI+   AAQT L+AV
Subjt:  RELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIE---AAQTHLIAV

A0A6J1EH25 X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like9.8e-4758.96Show/hide
Query:  SLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV----
        ++N+++Y+ +    +SS N  + VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FSLFPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLATSSV    
Subjt:  SLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVK----LTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSV----

Query:  ----SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGE---------------LLEEELEEDEGCFTDEVEEE
            SSSSSSSSFG Y  F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE EE ++E     E                 +EE EEDEGCFT+EVEEE
Subjt:  ----SSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGE---------------LLEEELEEDEGCFTDEVEEE

Query:  EEEEDQKEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV
        EEE    EGKRR+LE+VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT  LIAV
Subjt:  EEEEDQKEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT-HLIAV

A0A6P3ZZX9 glutamic acid-rich protein-like2.5e-1841.25Show/hide
Query:  NLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFF---SLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSVSSSSSSS
        N+ N +   R +++    +S +++L+R +++ +   LL LF    S  SLFPHSFSVYFST LFSI T ++ERKYMFL+CN GIL  LA SSVSS+SSS+
Subjt:  NLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFF---SLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSVSSSSSSS

Query:  SFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELL----------------EEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGK
          G            + + FE +       +EE D D  ++E+EE+E      E L                E E  E+EG ++  +++E EE++ +  +
Subjt:  SFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELL----------------EEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGK

Query:  RRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTHLIAV
             +V ST+ELNKK EEFIRKMKEE+RIE AQ  LIAV
Subjt:  RRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTHLIAV

B9SA78 Uncharacterized protein2.1e-1744.93Show/hide
Query:  MVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSVSSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAI
        +V +++F L L  F+S FS+ P+SF VYF+T LFS LT  +ERKYMFLICN GIL  LA +SVSSSSS S   ++     ++     +    +VVA VAI
Subjt:  MVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSVSSSSSSSSFGNYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAI

Query:  DEESDSDH-------TQEEEE------EKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAA
         +E +++        T+EEEE      EKE+   +GE  E+ + EDEG   +    E+++E+  +G+    + + +TEELN++IEEFIRKMKEE+RIE A
Subjt:  DEESDSDH-------TQEEEE------EKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAA

Query:  QTHLIAV
        Q  LIAV
Subjt:  QTHLIAV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G13130.1 unknown protein4.4e-0731.19Show/hide
Query:  KVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSVSSSSSS---------------SSFGNYCPF
        K E+LK++ K     + +     L  L  H F +Y   F+  ++THAV++ YMFL+CN G++ ++A  S   +SS                  F +Y   
Subjt:  KVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSVSSSSSS---------------SSFGNYCPF

Query:  PHSRHNHHHNLFEHDVVA-AVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVST-EELNKKIEEFIR
            +   H +     +A  V ++E++    T++ EEE ++      L + + EE+ G     + EEEE           + ++ ST EE+NKK +EFIR
Subjt:  PHSRHNHHHNLFEHDVVA-AVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVST-EELNKKIEEFIR

Query:  KMKEEMRIEAAQTHLIAV
        KMKEE+RIE A+ HLI V
Subjt:  KMKEEMRIEAAQTHLIAV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAACAACACTTAAGTGAAAGCAGCTTGAATCTGAATAATTATGATGTTATATTTAGATCAACATCATCATCCAAGAATTGCAGCAGCAAAGTTGAGTGGTTGAAAAG
GATGGTGAAGCTGACTGTGTTTTGTTTGCTTTTAGGGTTGTTTTTTTCTCTCTTCTCTCTATTTCCTCATTCCTTTAGTGTCTATTTTTCAACTTTCCTCTTCTCCATTC
TAACCCATGCTGTGGAAAGAAAATACATGTTCTTGATTTGTAATATTGGAATTCTTTTTCTTCTTGCCACTTCCTCTGTTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCTTTTGGG
AATTATTGTCCATTTCCCCATTCCCGTCATAATCATCATCACAACTTATTTGAACATGATGTTGTGGCCGCTGTTGCCATTGATGAAGAATCTGATTCTGATCACACCCA
AGAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGGAATATGTAGAGGTGAATTATTAGAAGAAGAATTAGAAGAAGATGAAGGGTGTTTTACAGATGAGGTTGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGATCAAAAAGAAGGAAAAAGGAGAGAATTAGAGATAGTGGTGAGCACAGAAGAATTGAACAAGAAAATTGAAGAGTTCATTAGAAAAATGAAGGAGGAAATGAGG
ATTGAAGCAGCTCAAACTCACCTCATTGCTGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAACAACACTTAAGTGAAAGCAGCTTGAATCTGAATAATTATGATGTTATATTTAGATCAACATCATCATCCAAGAATTGCAGCAGCAAAGTTGAGTGGTTGAAAAG
GATGGTGAAGCTGACTGTGTTTTGTTTGCTTTTAGGGTTGTTTTTTTCTCTCTTCTCTCTATTTCCTCATTCCTTTAGTGTCTATTTTTCAACTTTCCTCTTCTCCATTC
TAACCCATGCTGTGGAAAGAAAATACATGTTCTTGATTTGTAATATTGGAATTCTTTTTCTTCTTGCCACTTCCTCTGTTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCTTTTGGG
AATTATTGTCCATTTCCCCATTCCCGTCATAATCATCATCACAACTTATTTGAACATGATGTTGTGGCCGCTGTTGCCATTGATGAAGAATCTGATTCTGATCACACCCA
AGAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGGAATATGTAGAGGTGAATTATTAGAAGAAGAATTAGAAGAAGATGAAGGGTGTTTTACAGATGAGGTTGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGATCAAAAAGAAGGAAAAAGGAGAGAATTAGAGATAGTGGTGAGCACAGAAGAATTGAACAAGAAAATTGAAGAGTTCATTAGAAAAATGAAGGAGGAAATGAGG
ATTGAAGCAGCTCAAACTCACCTCATTGCTGTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEQHLSESSLNLNNYDVIFRSTSSSKNCSSKVEWLKRMVKLTVFCLLLGLFFSLFSLFPHSFSVYFSTFLFSILTHAVERKYMFLICNIGILFLLATSSVSSSSSSSSFG
NYCPFPHSRHNHHHNLFEHDVVAAVAIDEESDSDHTQEEEEEKEEGICRGELLEEELEEDEGCFTDEVEEEEEEEDQKEGKRRELEIVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMR
IEAAQTHLIAV