; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G18310 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G18310
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCpSecY
Genome locationChr1:13756185..13760323
RNA-Seq ExpressionCSPI01G18310
SyntenyCSPI01G18310
Gene Ontology termsGO:0006616 - SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005048 - signal sequence binding (molecular function)
GO:0008320 - protein transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002208 - SecY/SEC61-alpha family
IPR023201 - SecY domain superfamily
IPR026593 - Protein translocase subunit SecY
IPR030659 - SecY conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035135.1 preprotein translocase subunit SCY1 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-28495.8Show/hide
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TYJ95944.1 preprotein translocase subunit SCY1 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-28696.16Show/hide
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XP_004149897.2 preprotein translocase subunit SCY1, chloroplastic [Cucumis sativus]2.5e-29799.27Show/hide
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XP_016899801.1 PREDICTED: preprotein translocase subunit SCY1, chloroplastic [Cucumis melo]4.9e-28595.61Show/hide
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        TGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTAS+LKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHL
Subjt:  TGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHL

Query:  TAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP
        TAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDR  P
Subjt:  TAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP

A0A5D3BAF5 CpSecY5.7e-28796.16Show/hide
Query:  MLITFTE-AVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQTFNS
        MLITF E A A SSSPL FTLSTQSLTNS RFPRPR SL  ASFSVPGKP+S KSWNL L+SNSSESSVFDPL IRPDLSSE SSTWE+FLGYFGQTFNS
Subjt:  MLITFTE-AVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQTFNS

Query:  ASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFIN
        ASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFIN
Subjt:  ASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFIN

Query:  AQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIF
        AQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRK ILQYTRYASVGFAIVQAIGQVL+LRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSV+TTYIGERITDLKLGNGTSLLIF
Subjt:  AQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIF

Query:  TSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARF
        TSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAI+ISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARF
Subjt:  TSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARF

Query:  TGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHL
        TGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTAS+LKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHL
Subjt:  TGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHL

Query:  TAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP
        TAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP
Subjt:  TAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP

A0A6J1C2R5 CpSecY2.0e-27993.59Show/hide
Query:  MLITFTEAVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQTFNSA
        MLIT  EA A SSSPL FTLSTQSLTNS RFPRPR S+  ASFSVP KP+  KSWNL L+SNSSESSVFDPL IRPDLSSE SSTW NFLG  GQTF S+
Subjt:  MLITFTEAVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQTFNSA

Query:  SSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINA
        SSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFL+LLGYLALSRLGIY+PLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINA
Subjt:  SSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINA

Query:  QIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFT
        QIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRK ILQYTRYASVGFAIVQAIGQVL+LRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSV+TTYIGERITDLKLGNGTSLLIFT
Subjt:  QIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFT

Query:  SIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFT
        SIISYLPASFGRT AQAFQDGNYVGLVAII SFFLLVLGIVYVQEAERKIP+NYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFT
Subjt:  SIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFT

Query:  GLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLT
        G+SVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGK+TAS+LKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLT
Subjt:  GLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLT

Query:  AFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP
        AFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRY P
Subjt:  AFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O63066 Preprotein translocase subunit SECY, chloroplastic2.1e-22283.72Show/hide
Query:  FDPLAIRPDLSSEFS-STWENFLGYFGQTFNSAS--STKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVG
        FDPL +  + S+  S S    F G     F S+S     ++K+ S RG AAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFL+LLG+LALSRLG+YIPLGGVNREAF G
Subjt:  FDPLAIRPDLSSEFS-STWENFLGYFGQTFNSAS--STKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVG

Query:  NLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVL
        NLDQNSLL TLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINAQIVFQLLAQ+YPKLQDLQ++EGEAGRK +LQYTRYASVGFAIVQAIGQVL+LRPYVNDFSTEWVL
Subjt:  NLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVL

Query:  SSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGL
        +SVTLLTLGSV TT+IGERI+DLKLGNGTSLLIFTSIISYLPASFGRT AQAFQDGNYVGL+ II+SF LLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRY+SR G L
Subjt:  SSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGL

Query:  QKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTA
        Q+SAYLPFKVNSSGVMPIIFSTS+LALPGTLARF+GL  LKKAA+ALNPGG+ YLPTN+LLIAFFNYYYTFLQLDPDD+SEQLKRQGASIPLVRPGKSTA
Subjt:  QKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTA

Query:  SYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRY
        +Y+K VL+RISVLGSAFLA+LAAGP+++EQT+HLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYD++R+
Subjt:  SYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRY

P93690 Preprotein translocase subunit SECY, chloroplastic2.8e-23076.97Show/hide
Query:  MLITFTEAVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTS----TKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQT
        ML+TFTEA A +S+    + S  S    H   + R     A+F +  KPTS        +    ++S  SSVFDPL I  D S   +S W+  L +  QT
Subjt:  MLITFTEAVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTS----TKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQT

Query:  FNSASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVP
        F S+S T+KD+S SARG+AAAIEDSSID GDFFKGPLPGKFL LLG LALSRLGIY+PLGGVNREAFVGNLDQNS +STLDSFSGGGIGRLGICSLGIVP
Subjt:  FNSASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVP

Query:  FINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSL
        FINAQIVFQLL+Q+YPKLQDLQK+EGEAGRK I QYT+YASVGFA+VQAIGQVLFLRPYVND+STEWVLSSV LLTLGSV TTY+GERI+DLKLGNGTSL
Subjt:  FINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSL

Query:  LIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTL
        LIFT+IISYLPASFGRT A+A+Q+GNY GL  I++SF  LV GIVYVQEAERKIP+NYASRY+ + GGLQKSAYLPFKVNS+GVMPIIFSTS+L+LP TL
Subjt:  LIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTL

Query:  ARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQT
        ARFTGL +LKKAA+AL PGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTA+Y+K VLSRISVLGS FLAILAAGPAV+EQ 
Subjt:  ARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQT

Query:  THLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDR
        THLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAE+ISQKYKNIEFYD+++
Subjt:  THLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDR

Q38885 Preprotein translocase subunit SCY1, chloroplastic1.5e-23679.17Show/hide
Query:  LITFTEAVAPSSSPLSF-TLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGK----PTSTKSWNLRLV--SNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFG
        +IT +E  + SSS  +F +LS  +  +S R  R  +    + FSV  K        KSWNL LV  S SSE+SVFDPL I PD +S  SS WE+F+    
Subjt:  LITFTEAVAPSSSPLSF-TLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGK----PTSTKSWNLRLV--SNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFG

Query:  QTFNSASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGI
         +F S+S  ++DK  S RG+AAAIEDSSID GDFFKGPLPGKFL+LLG+LALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNS+LSTLD+FSGGGIGRLGICSLGI
Subjt:  QTFNSASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGI

Query:  VPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGT
        VPFINAQIVFQLLAQ+YPKLQDLQK+EGEAGRK ILQYTRYASVGFAIVQAIGQV +LRPYVNDFSTEWV+SSVTLLTLGSV+TTYIGERI+DLKLGNGT
Subjt:  VPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGT

Query:  SLLIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPG
        SLLIFTSIISYLPASFGRTTA+A Q+GNY GL  I++SF LLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTS+ GGLQKSAYLPFKVNS+GVMPIIFSTS+LALP 
Subjt:  SLLIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPG

Query:  TLARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIE
        TLARFTG+S LK  A AL PGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTA ++K VL RISVLGSAFLA+LAAGPAV+E
Subjt:  TLARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIE

Query:  QTTHLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP
        Q THLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFY++D+Y+P
Subjt:  QTTHLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP

Q6ZG25 Preprotein translocase subunit SECY, chloroplastic1.7e-22477.41Show/hide
Query:  RFPRPRTSLTPASFS-VPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESS---------------------VFDPLAIRPDLSS--EFSSTWENFLGYFGQTFNSASSTKK
        R P P     P+S S V G P S +    R  S S+ ++                      FDPL +  D  S  +  S   NF G     F S+S  +K
Subjt:  RFPRPRTSLTPASFS-VPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESS---------------------VFDPLAIRPDLSS--EFSSTWENFLGYFGQTFNSASSTKK

Query:  DKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINAQIVFQ
        +KS   RG AAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFL+LLGYLALSRLGIYIPLGGVNR+AF GNLDQNSLL TLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINAQIVFQ
Subjt:  DKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINAQIVFQ

Query:  LLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFTSIISY
        LLAQ+YPKLQDLQK+EGEAGRK +LQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVL+SVTLLTLGSV TT+IGERI+DLKLGNGTSLLIFTSIISY
Subjt:  LLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFTSIISY

Query:  LPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFTGLSVL
        LPASFGRT AQAFQDGNYVGL+ II+SF  LVLGIVYVQEAERKIPLNYASRY+SR GGLQ+SAYLPFKVNSSGVMPIIFSTS+LALPGTLARFTGL  L
Subjt:  LPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFTGLSVL

Query:  KKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLTAFRGF
        KKAA++LNPGG+ Y+PTN+LLIAFFNYYYTFLQLDPDD+SEQLKRQGASIPLVRPGKSTA+++K VLS ISVLGSAFLA+LAAGP+V+EQ THLTAFRGF
Subjt:  KKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLTAFRGF

Query:  AGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYN
        AGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYD++R++
Subjt:  AGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYN

Q9XQU4 Preprotein translocase subunit SECY, chloroplastic1.6e-22276.84Show/hide
Query:  MLITFTEAVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQTFNSA
        MLIT  +   PS +    +L+ + +   H    PR  L  +SF         +S +   +  S + + FDPL I PDLSS  SSTW N L  F       
Subjt:  MLITFTEAVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQTFNSA

Query:  SSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINA
        +S++KDK    RG+AAAIEDSSID GDFF GPLPGKFL+LLG+LALSRLG+YIPLGGVNR+AF+GNLDQNSLL+TLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINA
Subjt:  SSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINA

Query:  QIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFT
        QIVFQLLAQ+YPKLQDLQK+EGEAGRK +LQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPY NDF+TEW L+SV LLTLGSV TTYIGE+IT+LKLGNGTSLLIFT
Subjt:  QIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFT

Query:  SIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFT
        +IISYLPASFGRT +QAF D NYVGLV II+SFFLLVLGIVYVQEAERKIP+NYASR+TS+ GG++KSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTS+LALPGTLARFT
Subjt:  SIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFT

Query:  GLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLT
        GLS LK AA+ALNPGGSFYLP NILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTA+++K VLSRISVLGS FLAILAAGPAV+EQT HLT
Subjt:  GLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLT

Query:  AFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRY
        AFRGFAGTS+LILVGCATDTARKV+AEIISQKYKNIE YD D+Y
Subjt:  AFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18710.1 SECY homolog 11.1e-23779.17Show/hide
Query:  LITFTEAVAPSSSPLSF-TLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGK----PTSTKSWNLRLV--SNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFG
        +IT +E  + SSS  +F +LS  +  +S R  R  +    + FSV  K        KSWNL LV  S SSE+SVFDPL I PD +S  SS WE+F+    
Subjt:  LITFTEAVAPSSSPLSF-TLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGK----PTSTKSWNLRLV--SNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFG

Query:  QTFNSASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGI
         +F S+S  ++DK  S RG+AAAIEDSSID GDFFKGPLPGKFL+LLG+LALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNS+LSTLD+FSGGGIGRLGICSLGI
Subjt:  QTFNSASSTKKDKSPSARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGI

Query:  VPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGT
        VPFINAQIVFQLLAQ+YPKLQDLQK+EGEAGRK ILQYTRYASVGFAIVQAIGQV +LRPYVNDFSTEWV+SSVTLLTLGSV+TTYIGERI+DLKLGNGT
Subjt:  VPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGT

Query:  SLLIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPG
        SLLIFTSIISYLPASFGRTTA+A Q+GNY GL  I++SF LLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTS+ GGLQKSAYLPFKVNS+GVMPIIFSTS+LALP 
Subjt:  SLLIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPG

Query:  TLARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIE
        TLARFTG+S LK  A AL PGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTA ++K VL RISVLGSAFLA+LAAGPAV+E
Subjt:  TLARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLDPDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIE

Query:  QTTHLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP
        Q THLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFY++D+Y+P
Subjt:  QTTHLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP

AT2G31530.1 SecY protein transport family protein1.1e-2928.17Show/hide
Query:  FFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLG---------ICSLGIVPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQ
        FFK  +  +       L LSR+G +IPL G +R      + Q+ L     SF  G +  LG         +  LG+ P I A I+ Q+L  + P L  L+
Subjt:  FFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLG---------ICSLGIVPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQ

Query:  KREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQV---LFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFTSIISYLPASFGRTTA
        K EG  G + I  Y  + S  FAIV+A+      L    +      + V+ + +LL  G++  T++ + I++   G+G+SL+I   I++    +  +   
Subjt:  KREGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQV---LFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFTSIISYLPASFGRTTA

Query:  QAFQDGNYVG----LVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYAS---RYTSRGGG--LQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFTGLSVLK
        Q    G++      L+ ++  F ++ +  V V E  RKI L Y        SR G    +   Y+PF +N +G+ P++ +T  LA P  LA   G   L 
Subjt:  QAFQDGNYVG----LVAIIISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYAS---RYTSRGGG--LQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFTGLSVLK

Query:  KAALALNPGGSFYLPTNIL--LIAFFNYYYTFLQLD--PDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLTAF
             LNP  +   P  +   + AFF + +    +   P ++++ L + GA IP ++PGK+T  YL  + +     G   L+ LA    V++     +  
Subjt:  KAALALNPGGSFYLPTNIL--LIAFFNYYYTFLQLD--PDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLTAF

Query:  RGFA--GTSVLILVGCATDTARKVQA
        +GF+   TSVLI+VG   +  R   A
Subjt:  RGFA--GTSVLILVGCATDTARKVQA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGATAACATTCACAGAAGCTGTTGCACCTTCTTCTTCCCCCCTTTCCTTCACTCTCTCCACTCAATCCCTTACTAATTCTCACCGCTTTCCAAGGCCTAGAACTTC
ACTCACCCCTGCTTCCTTCTCTGTTCCAGGCAAGCCCACTTCCACCAAATCCTGGAACCTTCGCCTCGTTTCCAACAGTTCTGAGAGCTCAGTTTTTGATCCCTTGGCCA
TCCGTCCTGATCTTTCTTCCGAATTTAGTAGTACATGGGAAAATTTTCTTGGCTATTTTGGCCAAACATTTAACAGTGCTTCAAGCACAAAAAAAGACAAATCTCCGTCA
GCTCGTGGATTGGCAGCTGCAATCGAAGACAGTTCCATTGACATAGGAGATTTCTTCAAAGGTCCGTTGCCTGGAAAATTCCTACAGCTGTTGGGCTATTTAGCTCTTTC
AAGGCTTGGAATCTATATCCCTCTTGGTGGAGTGAACCGAGAGGCTTTTGTTGGGAACTTGGATCAGAACAGCTTATTGAGCACTTTAGATTCATTTTCTGGAGGAGGCA
TTGGTAGGCTAGGGATATGCTCCCTAGGCATTGTTCCCTTTATTAATGCACAAATTGTCTTCCAGCTTCTTGCTCAAATTTATCCAAAATTGCAAGACCTTCAGAAAAGA
GAAGGTGAAGCAGGGCGAAAGACAATTCTGCAATATACTCGATATGCCTCAGTTGGATTTGCAATCGTACAAGCAATTGGCCAAGTTCTATTCCTTCGCCCCTATGTTAA
TGATTTTAGTACAGAATGGGTGCTCTCTTCTGTTACTTTATTGACACTTGGCTCAGTCGTAACAACGTACATAGGGGAACGGATCACAGACCTAAAGCTAGGAAACGGGA
CATCTCTTTTAATATTCACCAGCATCATCTCCTATTTACCAGCATCCTTTGGAAGGACCACTGCACAGGCATTCCAGGATGGTAATTATGTTGGATTGGTTGCTATCATA
ATCTCCTTCTTTCTATTGGTACTTGGAATTGTATATGTTCAGGAAGCAGAAAGGAAAATCCCCCTCAATTATGCTTCAAGATACACAAGCAGAGGTGGAGGACTTCAGAA
ATCTGCTTACCTGCCCTTCAAGGTTAATAGTTCTGGTGTAATGCCAATCATTTTCTCGACATCAACGTTAGCCCTTCCAGGTACTCTGGCTCGCTTCACAGGGCTATCGG
TCCTAAAGAAGGCTGCACTTGCTTTAAATCCAGGAGGTTCGTTCTATCTGCCAACCAACATCCTTTTGATAGCCTTCTTCAACTATTACTACACGTTCCTACAGTTGGAT
CCCGATGATGTGAGTGAGCAATTGAAGCGACAGGGTGCTTCAATTCCCCTCGTCCGCCCAGGAAAAAGTACAGCTTCATATCTGAAAGCGGTTCTAAGCCGGATTTCAGT
ACTTGGTTCAGCCTTCTTGGCAATCCTTGCTGCTGGTCCTGCTGTGATTGAACAGACAACACATTTAACAGCATTTCGAGGATTCGCAGGAACCTCTGTTCTTATTCTTG
TTGGTTGTGCAACAGACACTGCCAGAAAGGTACAAGCTGAGATAATCTCCCAGAAGTACAAGAATATAGAGTTTTATGACATTGATAGGTATAATCCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACAATAGAAAATGAAAAAGAAACATAAATCCTACAAATCAAAGGAAAAGAGAGAAAAAAGAATGGATAGGGTGAGGAAAGAATCGGCCACTCCTAATCCTCCCAACAT
CTCATAACGTTACCCTTTCGGAAACTCAAACTCAGGTGGGAGTAAATTATGTTGATAACATTCACAGAAGCTGTTGCACCTTCTTCTTCCCCCCTTTCCTTCACTCTCTC
CACTCAATCCCTTACTAATTCTCACCGCTTTCCAAGGCCTAGAACTTCACTCACCCCTGCTTCCTTCTCTGTTCCAGGCAAGCCCACTTCCACCAAATCCTGGAACCTTC
GCCTCGTTTCCAACAGTTCTGAGAGCTCAGTTTTTGATCCCTTGGCCATCCGTCCTGATCTTTCTTCCGAATTTAGTAGTACATGGGAAAATTTTCTTGGCTATTTTGGC
CAAACATTTAACAGTGCTTCAAGCACAAAAAAAGACAAATCTCCGTCAGCTCGTGGATTGGCAGCTGCAATCGAAGACAGTTCCATTGACATAGGAGATTTCTTCAAAGG
TCCGTTGCCTGGAAAATTCCTACAGCTGTTGGGCTATTTAGCTCTTTCAAGGCTTGGAATCTATATCCCTCTTGGTGGAGTGAACCGAGAGGCTTTTGTTGGGAACTTGG
ATCAGAACAGCTTATTGAGCACTTTAGATTCATTTTCTGGAGGAGGCATTGGTAGGCTAGGGATATGCTCCCTAGGCATTGTTCCCTTTATTAATGCACAAATTGTCTTC
CAGCTTCTTGCTCAAATTTATCCAAAATTGCAAGACCTTCAGAAAAGAGAAGGTGAAGCAGGGCGAAAGACAATTCTGCAATATACTCGATATGCCTCAGTTGGATTTGC
AATCGTACAAGCAATTGGCCAAGTTCTATTCCTTCGCCCCTATGTTAATGATTTTAGTACAGAATGGGTGCTCTCTTCTGTTACTTTATTGACACTTGGCTCAGTCGTAA
CAACGTACATAGGGGAACGGATCACAGACCTAAAGCTAGGAAACGGGACATCTCTTTTAATATTCACCAGCATCATCTCCTATTTACCAGCATCCTTTGGAAGGACCACT
GCACAGGCATTCCAGGATGGTAATTATGTTGGATTGGTTGCTATCATAATCTCCTTCTTTCTATTGGTACTTGGAATTGTATATGTTCAGGAAGCAGAAAGGAAAATCCC
CCTCAATTATGCTTCAAGATACACAAGCAGAGGTGGAGGACTTCAGAAATCTGCTTACCTGCCCTTCAAGGTTAATAGTTCTGGTGTAATGCCAATCATTTTCTCGACAT
CAACGTTAGCCCTTCCAGGTACTCTGGCTCGCTTCACAGGGCTATCGGTCCTAAAGAAGGCTGCACTTGCTTTAAATCCAGGAGGTTCGTTCTATCTGCCAACCAACATC
CTTTTGATAGCCTTCTTCAACTATTACTACACGTTCCTACAGTTGGATCCCGATGATGTGAGTGAGCAATTGAAGCGACAGGGTGCTTCAATTCCCCTCGTCCGCCCAGG
AAAAAGTACAGCTTCATATCTGAAAGCGGTTCTAAGCCGGATTTCAGTACTTGGTTCAGCCTTCTTGGCAATCCTTGCTGCTGGTCCTGCTGTGATTGAACAGACAACAC
ATTTAACAGCATTTCGAGGATTCGCAGGAACCTCTGTTCTTATTCTTGTTGGTTGTGCAACAGACACTGCCAGAAAGGTACAAGCTGAGATAATCTCCCAGAAGTACAAG
AATATAGAGTTTTATGACATTGATAGGTATAATCCTTAAAAGAGAATGTAATGAAACAAAACTGGTGCTAAACCTTCAGATTTGTATTTCATGGCACCATACTCGGTCAA
TAGAACACTTATTCTCTTAGCTTCCCCCAAGAAACTTTCTATGAAAAGTTTTACTCAAGCAGAGCTGGTAATACGATAACATTAGATTTTCATTCTATTGTTCAAATCAG
AAAGCAAGAAATTATTGGGTTCGACATGAAAACTATAATACTTCTATTACTGTTCGTACATCAATAAACTAAACTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLITFTEAVAPSSSPLSFTLSTQSLTNSHRFPRPRTSLTPASFSVPGKPTSTKSWNLRLVSNSSESSVFDPLAIRPDLSSEFSSTWENFLGYFGQTFNSASSTKKDKSPS
ARGLAAAIEDSSIDIGDFFKGPLPGKFLQLLGYLALSRLGIYIPLGGVNREAFVGNLDQNSLLSTLDSFSGGGIGRLGICSLGIVPFINAQIVFQLLAQIYPKLQDLQKR
EGEAGRKTILQYTRYASVGFAIVQAIGQVLFLRPYVNDFSTEWVLSSVTLLTLGSVVTTYIGERITDLKLGNGTSLLIFTSIISYLPASFGRTTAQAFQDGNYVGLVAII
ISFFLLVLGIVYVQEAERKIPLNYASRYTSRGGGLQKSAYLPFKVNSSGVMPIIFSTSTLALPGTLARFTGLSVLKKAALALNPGGSFYLPTNILLIAFFNYYYTFLQLD
PDDVSEQLKRQGASIPLVRPGKSTASYLKAVLSRISVLGSAFLAILAAGPAVIEQTTHLTAFRGFAGTSVLILVGCATDTARKVQAEIISQKYKNIEFYDIDRYNP