; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G20280 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G20280
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description(DL)-glycerol-3-phosphatase 2
Genome locationChr1:15969686..15974039
RNA-Seq ExpressionCSPI01G20280
SyntenyCSPI01G20280
Gene Ontology termsGO:0006114 - glycerol biosynthetic process (biological process)
GO:0016311 - dephosphorylation (biological process)
GO:0043136 - glycerol-3-phosphatase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006439 - HAD hydrolase, subfamily IA
IPR023198 - Phosphoglycolate phosphatase-like, domain 2
IPR023214 - HAD superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily
IPR041492 - Haloacid dehalogenase-like hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058275.1 (DL)-glycerol-3-phosphatase 2 [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-13197.93Show/hide
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XP_008453605.1 PREDICTED: (DL)-glycerol-3-phosphatase 2 [Cucumis melo]2.2e-15195.44Show/hide
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XP_023529419.1 (DL)-glycerol-3-phosphatase 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-13083.51Show/hide
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XP_038878592.1 (DL)-glycerol-3-phosphatase 2 [Benincasa hispida]6.0e-14189.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZT1 Uncharacterized protein9.9e-15898.6Show/hide
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A0A1S3BXU4 (DL)-glycerol-3-phosphatase 21.1e-15195.44Show/hide
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A0A5D3CIR5 (DL)-glycerol-3-phosphatase 21.2e-13197.93Show/hide
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A0A6J1C159 (DL)-glycerol-3-phosphatase 24.3e-12982.92Show/hide
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        L   S++P R+ Q+FIR+P S I RSS  +FPNR+  TV MA+LS D  S+GSITHVIFDMDGLLLDTE FYT+VQE ILAR+NKTFDWSLKAKMMG KA
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        IEAARVFVEESGISDSLS EDFLVEREDMLRSLFP SELMPGASRLI+HLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHH+VLGDDPEVK+GKPSP
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        D+FLAAAKRF DAPVD  RTLVFEDAPSGVLAAK+AGM+VIMVPDPRLD S+  +A+QVLSSLLDFNP+EWGLPPFEDSES
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A0A6J1F0H8 (DL)-glycerol-3-phosphatase 21.4e-12782.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JTE7 (DL)-glycerol-3-phosphatase 1, mitochondrial1.4e-10370.79Show/hide
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        F R P   +  S +F     TP     A ++   + +GSITHVIFDMDGLLLDTE FYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAAR+FV+ESGIS
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        DSLS EDF+VERE ML+ LFP S+LMPGASRL+RHLH KG+P  +ATG+H RHF+LKTQRH ELF LMHHVV GDDPEVK+GKP+PD FLAA++RF D P
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        VD  + LVFEDAPSGV AAKNAGM VIMVPD RLD S+   A+QVL+SLLDF P+EWGLP F+DS +
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Q08623 Pseudouridine-5'-phosphatase1.3e-5851.34Show/hide
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        +TH+IFDMDGLLLDTE  Y+ V ++I  RY+K + W +K+ +MG+KA+EAA++ ++   +   +S E+ + E +  L+ +FP + LMPGA +LI HL   
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        G+PF LAT S    F++KT RH E F L  H+VLGDDPEV+ GKP PDIFLA AKRF+  P   E+ LVFEDAP+GV AA  AGM+V+MVPD  L     
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          A  VL+SL DF P+ +GLP +E
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Q8VZP1 (DL)-glycerol-3-phosphatase 22.5e-10577.41Show/hide
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        M+N +  T+ +GSITHVIFDMDGLLLDTE FYTEVQE ILAR+NK FDWSLKAKMMGRKAIEAAR+FVEESGISDSLS EDFLVERE ML+ LFP SELM
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        PGASRLI+HLH K +P  +ATG+H RH++LKTQRH ELF LMHHVV GDDPEVKQGKP+PD FLAAA+RF D PVD+++ LVFEDAPSGVLAAKNAGM V
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        +MVPDPRLD SH   A+Q+++SL+DF P+EWGLPPFEDS
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Q94529 Probable pseudouridine-5'-phosphatase5.4e-5250Show/hide
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        +TH +FDMDGLLLDTE  YT   E IL  Y KT+ + +K ++MG +    AR  VE   +   +S E++  ++      L   ++LMPGA RL+RHLHA 
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         VPF LAT S     ELKT +H ELF L +H V G  D EV  GKP+PDIFL AA RF   P  ++  LVFED+P+GV AA +AGM+V+MVPDPRL    
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Query:  HGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED
          +A QVL+SL DF P+++GLP F D
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Q9D5U5 Pseudouridine-5'-phosphatase9.2e-5248Show/hide
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        +T +IFD+DGL+L+TE  YT+V E+I  RY K ++W +K+ +MG+KA+E A+  VE   +   +S E+ L E ++ L+ +   +  MPGA  LI HL   
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Query:  GVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSHH
         +PF LAT S    F+ KT RH   F L HH+VLGDDPEVK GKP  DIFL  AKRF+  P D +  LVFED+P+GV AA + GM+V+MVP   L +   
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Query:  GNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED
          A  VLSSL DF P+ +GLP F +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56500.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein1.2e-0927.06Show/hide
Query:  LQSPSSTPTRLFQHFIRF-PNSNIFRSSQFQFPNRTPITVSMANLSPD--TSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGF--------YTEVQEKILARYNKTFDW
        L S S  P R    F  F   + ++ S      + T ++V+  + +    T   G ++ V+FDMDG+L ++E          +TE+  ++       F  
Subjt:  LQSPSSTPTRLFQHFIRF-PNSNIFRSSQFQFPNRTPITVSMANLSPD--TSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGF--------YTEVQEKILARYNKTFDW

Query:  SLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSEL-MPGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLG
        + +AK +G  A        E  G     + E F     D      P+S +  PGA  L+     KG+   +A+ + R   +   +  G    +   +V  
Subjt:  SLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSEL-MPGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLG

Query:  DDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMV
        D    +  KP+PDIFLAAAK      V     +V EDA +GV AA+ A M+ I V
Subjt:  DDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMV

AT2G38740.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein1.2e-0624.38Show/hide
Query:  PDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGF----YTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQS-ELM
        P  S    +  ++FD+DG L D++      + E+ ++I        D     + +  K      + +    +S  L    F  E+E + R +  +  + +
Subjt:  PDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGF----YTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQS-ELM

Query:  PGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKV
         G  +L + +  +G+     T + + + EL   + G L      V+LG + E  +  P P +     K      V  E TLVFED+ SG+ A   AGM V
Subjt:  PGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKV

Query:  I
        I
Subjt:  I

AT4G21470.1 riboflavin kinase/FMN hydrolase3.5e-3839.57Show/hide
Query:  LSPDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSELMPGA
        +S   S K   + V+ D+DG L++T+G   ++  K L +Y K +D     K++G+  +EAA   VE+  +   +  ++F  E   +  +   + + +PGA
Subjt:  LSPDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSELMPGA

Query:  SRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMV
        +RLIRHL   GVP  LA+ S R + E K   H E +K    V++G D EV +GKPSPDIFL AAKR    P D    LV ED+  GV+A K AG KVI V
Subjt:  SRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMV

Query:  PDPRLDSSHHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED
        P     +  + +A++V++SLLD   ++WGLPPF+D
Subjt:  PDPRLDSSHHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED

AT4G25840.1 glycerol-3-phosphatase 19.6e-10570.79Show/hide
Query:  FIRFPNSNIFRSSQFQFPNRTPITVSMANLSPDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGIS
        F R P   +  S +F     TP     A ++   + +GSITHVIFDMDGLLLDTE FYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAAR+FV+ESGIS
Subjt:  FIRFPNSNIFRSSQFQFPNRTPITVSMANLSPDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGIS

Query:  DSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSELMPGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAP
        DSLS EDF+VERE ML+ LFP S+LMPGASRL+RHLH KG+P  +ATG+H RHF+LKTQRH ELF LMHHVV GDDPEVK+GKP+PD FLAA++RF D P
Subjt:  DSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSELMPGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAP

Query:  VDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSHHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDSES
        VD  + LVFEDAPSGV AAKNAGM VIMVPD RLD S+   A+QVL+SLLDF P+EWGLP F+DS +
Subjt:  VDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSHHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDSES

AT5G57440.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein1.8e-10677.41Show/hide
Query:  MANLSPDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSELM
        M+N +  T+ +GSITHVIFDMDGLLLDTE FYTEVQE ILAR+NK FDWSLKAKMMGRKAIEAAR+FVEESGISDSLS EDFLVERE ML+ LFP SELM
Subjt:  MANLSPDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARVFVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSELM

Query:  PGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKV
        PGASRLI+HLH K +P  +ATG+H RH++LKTQRH ELF LMHHVV GDDPEVKQGKP+PD FLAAA+RF D PVD+++ LVFEDAPSGVLAAKNAGM V
Subjt:  PGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVDAERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKV

Query:  IMVPDPRLDSSHHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDS
        +MVPDPRLD SH   A+Q+++SL+DF P+EWGLPPFEDS
Subjt:  IMVPDPRLDSSHHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTCAATTTTTGCAAAGCCCCTCTTCCACTCCAACAAGACTCTTTCAACACTTCATACGTTTTCCCAATTCCAACATTTTCCGTTCTTCTCAATTCCAATTCCCAAA
TCGCACTCCAATCACAGTTTCAATGGCTAATCTCTCCCCCGACACTTCTTCCAAAGGATCCATTACTCACGTTATCTTTGATATGGACGGACTCTTATTGGATACTGAGG
GGTTTTACACTGAAGTACAAGAGAAAATTCTGGCTAGGTATAATAAAACTTTTGATTGGTCACTTAAGGCAAAGATGATGGGCAGGAAAGCTATAGAAGCTGCTCGGGTC
TTTGTTGAAGAGAGTGGGATTAGTGATTCTCTTAGTCCGGAGGATTTTCTTGTGGAAAGAGAAGACATGCTACGAAGCTTGTTTCCGCAAAGTGAGCTTATGCCAGGAGC
TAGCCGGTTGATCAGACATCTTCATGCAAAAGGAGTACCATTTGGCTTGGCCACCGGATCTCATAGACGTCATTTTGAACTTAAAACACAAAGACATGGTGAACTTTTTA
AGTTGATGCATCACGTTGTTCTTGGTGATGATCCAGAGGTTAAACAAGGGAAACCATCGCCGGATATATTTCTTGCAGCTGCTAAAAGATTTGCGGATGCTCCAGTGGAT
GCGGAAAGAACCCTTGTTTTTGAAGATGCCCCCTCAGGTGTTCTTGCAGCTAAAAATGCAGGAATGAAGGTAATTATGGTTCCAGATCCAAGGTTGGATAGTTCTCATCA
TGGCAATGCAAATCAGGTATTGAGTTCCCTCTTGGATTTCAACCCCAAGGAATGGGGTCTGCCTCCTTTTGAAGATTCAGAAAGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGCTAATAAATTGGGAAAGGCCTCAACTTTATTTTATTCTGTTGTGTTCGATGCTTCAATTTTTGCAAAGCCCCTCTTCCACTCCAACAAGACTCTTTCAACACTTCATA
CGTTTTCCCAATTCCAACATTTTCCGTTCTTCTCAATTCCAATTCCCAAATCGCACTCCAATCACAGTTTCAATGGCTAATCTCTCCCCCGACACTTCTTCCAAAGGATC
CATTACTCACGTTATCTTTGATATGGACGGACTCTTATTGGATACTGAGGGGTTTTACACTGAAGTACAAGAGAAAATTCTGGCTAGGTATAATAAAACTTTTGATTGGT
CACTTAAGGCAAAGATGATGGGCAGGAAAGCTATAGAAGCTGCTCGGGTCTTTGTTGAAGAGAGTGGGATTAGTGATTCTCTTAGTCCGGAGGATTTTCTTGTGGAAAGA
GAAGACATGCTACGAAGCTTGTTTCCGCAAAGTGAGCTTATGCCAGGAGCTAGCCGGTTGATCAGACATCTTCATGCAAAAGGAGTACCATTTGGCTTGGCCACCGGATC
TCATAGACGTCATTTTGAACTTAAAACACAAAGACATGGTGAACTTTTTAAGTTGATGCATCACGTTGTTCTTGGTGATGATCCAGAGGTTAAACAAGGGAAACCATCGC
CGGATATATTTCTTGCAGCTGCTAAAAGATTTGCGGATGCTCCAGTGGATGCGGAAAGAACCCTTGTTTTTGAAGATGCCCCCTCAGGTGTTCTTGCAGCTAAAAATGCA
GGAATGAAGGTAATTATGGTTCCAGATCCAAGGTTGGATAGTTCTCATCATGGCAATGCAAATCAGGTATTGAGTTCCCTCTTGGATTTCAACCCCAAGGAATGGGGTCT
GCCTCCTTTTGAAGATTCAGAAAGCTAGGTCCTCACATTGGGTTCATGCTGCTGAGATACAAAACTCACCATTTCAATAGAATGGTTAGATTCTTTTTCTCCACATTTCA
AGAGAAAGGCTCCCATCAAGTTATTTATTAGTTTGCTTGGCCTTTCTTGCCTAAACTATGAACATTGATTACCAATTTCTATGATTGAAATGGGACTAATGTTGCAGTTT
CTCCTTTTTGACTTGCTTATCTATTGATCTTAACAGAGAGATGAATCTCAAAATTGTTGTAATTGTTGATCAGAATCTCACATTTATTACTATTATTGTTATTACTTTGG
TCTATTTGTTCATATAATAAAACTAAATGTATTCGGCTAAAATGAGCTTACTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLQFLQSPSSTPTRLFQHFIRFPNSNIFRSSQFQFPNRTPITVSMANLSPDTSSKGSITHVIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGRKAIEAARV
FVEESGISDSLSPEDFLVEREDMLRSLFPQSELMPGASRLIRHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHVVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFADAPVD
AERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSHHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDSES