; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G20610 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G20610
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionbasic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
Genome locationChr1:16263037..16267245
RNA-Seq ExpressionCSPI01G20610
SyntenyCSPI01G20610
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058209.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis melo var. makuwa]6.7e-10192.02Show/hide
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XP_004146337.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis sativus]2.2e-128100Show/hide
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XP_008453552.1 PREDICTED: transcription factor bHLH35 [Cucumis melo]3.9e-11792.95Show/hide
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XP_022922024.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita moschata]3.7e-9982.11Show/hide
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        ERR+Q EI ELESGK  KITG EFDQ +LPLLLR KRKKTE+YFSY SP SR SPIEV DLSVTYMGDRTI VSMTCCKRADSMVKLCEVFESL LKIIT
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        ANI+AVSGRLLKTVFIEAE+EERD LKIKIETAIAGLNDPHSPMSI
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XP_038878728.1 transcription factor bHLH35-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.4e-10886.83Show/hide
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        MD IG+DY N  G +IFI  EE  SWG +EP SG YDSSSPD  S+ASKN  SERNRR+KLNERLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAIDYI +LHDQERR
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU95 BHLH domain-containing protein1.1e-128100Show/hide
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A0A1S3BWL7 transcription factor bHLH351.9e-11792.95Show/hide
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        MD IGDDYLN  G +IFIGEELDSW LEEP S  YDSSSPDGSAASKN+ SERNRRRKLNERLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQ
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A0A5A7UXG0 Transcription factor bHLH353.2e-10192.02Show/hide
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like1.8e-9982.11Show/hide
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        MD  G+D +N FG++IFI  EELDSWG +EP SG YDSSSP+G    S+A+KN+ASERNRRRKLNERLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAIDYI DLH+Q
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        ERR+Q EI ELESGK  KITG EFDQ +LPLLLR KRKKTE+YFSY SP SR SPIEV DLSVTYMGDRTI VSMTCCKRADSMVKLCEVFESL LKIIT
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        ANI+AVSGRLLKTVFIEAE+EERD LKIKIETAIAGLNDPHSPMSI
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A0A6J1JJ79 transcription factor bHLH35-like6.8e-9981.71Show/hide
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        MD  G+D +N FG++IFI  EELDSWG +EP SG YDSSSP+G    S+A+KN+ASERNRRRKLNERLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAIDYI DLH+Q
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Query:  ERRIQAEIYELESGKLKKITGYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIIT
        ERR+Q EI ELESGK  KITG EFDQ +LPLLLR KR KTE+YFSY SP SR SPIEV DLSVTYMGDRTI VSMTCCKRADSMVKLCEVFESL LKIIT
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        ANI+AVSGRLLKTVFIEAE+EERD LKIKIETAIAGLNDPHSPMSI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JEB7 Transcription factor BHLH68.7e-3536.04Show/hide
Query:  EELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGS------------------------------------------AASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMD
        EELDS  L      +Y+SSSPDGS                                           A+KN+  ER+RRRKLNE+L+ALRSVVPNI+KMD
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Query:  KASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELES--------GKLKKITGYEFDQD-----QLPLLLRSKRKKTEQYFSYDS-------PVSRISPIEVLDLS
        KASIIKDAI+YI  L  +E+++  E+  LES               G   D++       P     + KK ++  S  S         +   P+E+ +L 
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Query:  VTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDCLKIKIETAIAGLNDPHSPMS
        V+ +GDR +VVS+TC KR D+M ++C   E L L++ITANIT+V+G L+ T+F+E +  +   +K  +E A++ L    SP+S
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH353.9e-5959.82Show/hide
Query:  SWGLEEPFSGDYDSSSPDGSA---ASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKIT-GYEF
        SW LEE  SG YDSSSPDG+A   ASKN+ SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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Query:  DQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERD
        D+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESLNLKI+T+N+T+ SG +  TVFIEA++EE++
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Query:  CLKIKIETAIAGLNDPHSP
         L++KIET I   N+  SP
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Q700E3 Transcription factor bHLH274.6e-4447.16Show/hide
Query:  MDIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGS----AASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLH
        M+ +  +Y N +   +F      E DSW +EE FSG  +SSSPDG+    A+SKNV SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNISK+DKAS+IKD+IDY+ +L 
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Query:  DQERRIQAEIYELESGKL---KKITGYEFDQDQLPLL-------LRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLC
        DQE+ ++AEI ELES        +  Y+ +  +  L        +RSK+ K   Y    S   +  PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC
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Query:  EVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIE
        +V ESLNL I+T N ++ + RL  T+F++
Subjt:  EVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIE

Q9LSE2 Transcription factor ICE12.5e-1330.98Show/hide
Query:  SKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKITGYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPV
        +KN+ +ER RR+KLN+RL+ LRSVVP ISKMD+ASI+ DAIDY+ +L  +   +  E+     G L   +         P  L  + K+     S  SP 
Subjt:  SKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKITGYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPV

Query:  SRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDCLKIKIETAI
         + + +E     V     R + + M C +R   ++   +  ++L L +  A I+  +G  L     E  QE ++ L  +I+  +
Subjt:  SRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDCLKIKIETAI

Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES1.6e-1229.84Show/hide
Query:  YDSSSPDGSAASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEI---YELESGKLKKITGYEFDQDQLP-----L
        Y   S  GS A KN+ +ER RR+KLN+RL+ALRS+VP I+K+D+ASI+ DAI+Y+ +L ++ + +Q E+    E E G  +   G   +   +      L
Subjt:  YDSSSPDGSAASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEI---YELESGKLKKITGYEFDQDQLP-----L

Query:  LLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEE
           S     +Q    ++   +   +E   + V  +  R   V + C  +     +L E  +SL L++  AN T     +     +E    E
Subjt:  LLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.8e-5247.04Show/hide
Query:  MDIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGS----AASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLH
        M+ +  +Y N +   +F      E DSW +EE FSG  +SSSPDG+    A+SKNV SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNISK+DKAS+IKD+IDY+ +L 
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Query:  DQERRIQAEIYELESGKL---KKITGYEFDQDQLPLL-------LRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLC
        DQE+ ++AEI ELES        +  Y+ +  +  L        +RSK+ K   Y    S   +  PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC
Subjt:  DQERRIQAEIYELESGKL---KKITGYEFDQDQLPLL-------LRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLC

Query:  EVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDCLKIKIETAIAGLNDPH
        +V ESLNL I+T N ++ + RL  T+F++A++EE   ++ KI+ AIA  NDP+
Subjt:  EVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDCLKIKIETAIAGLNDPH

AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.9e-6156.15Show/hide
Query:  DIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGSA---ASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQ
        DI+  +  N +    F+     E DSW LEE  SG YDSSSPDG+A   ASKN+ SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +
Subjt:  DIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGSA---ASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQ

Query:  ERRIQAEIYELESGKLKKIT-GYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKII
        E++++AEI ELES     ++   +FD+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESLNLKI+
Subjt:  ERRIQAEIYELESGKLKKIT-GYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKII

Query:  TANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDCLKIKIETAIAGLNDPHSP
        T+N+T+ SG +  TVFIEA++EE++ L++KIET I   N+  SP
Subjt:  TANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDCLKIKIETAIAGLNDPHSP

AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.7e-5261.66Show/hide
Query:  SWGLEEPFSGDYDSSSPDGSA---ASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKIT-GYEF
        SW LEE  SG YDSSSPDG+A   ASKN+ SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.7e-5261.66Show/hide
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        D+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESLNLKI+T+N+T+ SG +  TVFIE
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.7e-5261.66Show/hide
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        D+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESLNLKI+T+N+T+ SG +  TVFIE
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Sequences Show/hide sequences
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AAGTTTTTGAGTCACTCAACCTCAAGATCATCACTGCCAATATTACTGCTGTTTCTGGAAGGCTTCTGAAAACTGTCTTCATTGAGGCTGAGCAAGAGGAGAGAGATTGC
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CTGAGCAATACTTCAGTTATGATTCTCCTGTTTCAAGAATTTCCCCAATTGAAGTTCTGGATCTTAGTGTAACATACATGGGAGATAGAACAATAGTAGTGAGCATGACC
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TGTCTTCATTGAGGCTGAGCAAGAGGAGAGAGATTGCTTGAAGATTAAAATAGAAACAGCCATTGCAGGTCTTAATGATCCACATAGCCCCATGAGTATCTGAATCTACA
GATGGAAAACACACACAAAAAAAGAGATCGGACGGCTGGAAACTAGTTCTCTCCCTGATCAGAGTGTTCCATTTTGCTCTTTCTTGGGGTTGTCATGTCACATAAAATTG
TTTTCCTTGTTGAGAGAGTTCTCCTTTCAGGGGTTCCGAGATTTTTTTTTTCTTGGTCTAAGCAGATGTCTGTAGGAATGTATTTACACAATGATATTATAGAGTATTCA
CATAATGATGATTTCCCTTTGTCGTGCTTCAGTTTCTATGTACAGAATCTCCTAATAATGCCATTGCACAGCATCAAGATAGCAATATCCAATTTCTTAACATTTTTATG
AAAAGGAAGGGGAAAAAAGGTGAACTTCTCCTATTCGACAAACTGCAATATTGAAATGAATCAATATACTTCAAGAATGAACTGAATACTTGTGGTTTTGACTTGAAATA
CAAAGTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LKKITGYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDC
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