; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G20770 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G20770
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HOX18-like
Genome locationChr1:16388705..16390469
RNA-Seq ExpressionCSPI01G20770
SyntenyCSPI01G20770
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150745.1 homeobox-leucine zipper protein HOX18 [Cucumis sativus]1.6e-140100Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGS
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGS
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGS

Query:  IRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF
        IRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF
Subjt:  IRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF

Query:  LKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPPQ
        LKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPPQ
Subjt:  LKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPPQ

XP_008453538.1 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HOX18-like [Cucumis melo]3.3e-13394.46Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYD-HHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQ QQQQ+SFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDE NSSEEDDDHHLMKRIRS+NNIVNYD HHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYD-HHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSD YINN+DIVN+TNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP------AVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTP      AVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP------AVDANSPPQ

XP_022134791.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Momordica charantia]2.6e-6665.25Show/hide
Query:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQ--QQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGSIRR
        +DEICNI  L LGLGFG++YVPKK   N   +    LSFTLIPKEE       N+EI   EA+SS    DH  +KRIRS+NN        QD       R
Subjt:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQ--QQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGSIRR

Query:  LSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKK
         SS   IN S                     ERKKLRLSKEQS LLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKK
Subjt:  LSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKK

Query:  CCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSP
        CCERLNEENRRLKKE+ ELRSLK+GASQLYIQLPKAATLTICPSC+K+TR  A  A +P
Subjt:  CCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSP

XP_022931479.1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like [Cucurbita moschata]3.0e-6260.37Show/hide
Query:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSF
        +D++CNI   LSLG GFG +YVPKK+QK      N +    LSFTL+PK+EL I             NSS                              
Subjt:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSF

Query:  GSIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
                           TTN       S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  GSIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDA----NSPP
        CEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPA +A    NSPP
Subjt:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDA----NSPP

XP_038879995.1 homeobox-leucine zipper protein HOX17-like [Benincasa hispida]8.4e-10582.42Show/hide
Query:  HEDEICNISWLSLGLGFG-DQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNN----NMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFG
        H+DE+CNISWLSLGLGFG DQYVPKK+QK      QLSFTLIPKEEL I NNN    NMEIDD+EANSSEED  HHLMKR RS+NNIVNYDH  QDSSFG
Subjt:  HEDEICNISWLSLGLGFG-DQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNN----NMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDHYINNSDIVN--TTNHNYKGISSSG-SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEV
           R SSDH+ + S   N  TTNHN+KGISSSG SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKL+TTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEV
Subjt:  SIRRLSSDHYINNSDIVN--TTNHNYKGISSSG-SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEV

Query:  DCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-----PAVDANSPPQ
        DCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+EL+SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT      A+DANSPPQ
Subjt:  DCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT-----PAVDANSPPQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M012 Homeobox domain-containing protein7.8e-141100Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGS
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGS
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGS

Query:  IRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF
        IRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF
Subjt:  IRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF

Query:  LKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPPQ
        LKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPPQ
Subjt:  LKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPPQ

A0A1S3BWH2 homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.6e-13394.46Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYD-HHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQ QQQQ+SFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDE NSSEEDDDHHLMKRIRS+NNIVNYD HHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYD-HHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSD YINN+DIVN+TNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP------AVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTP      AVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP------AVDANSPPQ

A0A5A7USQ4 Homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.6e-13394.46Show/hide
Query:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYD-HHRQDSSFG
        MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQ QQQQ+SFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDE NSSEEDDDHHLMKRIRS+NNIVNYD HHRQDSSFG
Subjt:  MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYD-HHRQDSSFG

Query:  SIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
        SIRRLSSD YINN+DIVN+TNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE
Subjt:  SIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE

Query:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP------AVDANSPPQ
        FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTP      AVDANSPPQ
Subjt:  FLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP------AVDANSPPQ

A0A6J1BYS3 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.3e-6665.25Show/hide
Query:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQ--QQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGSIRR
        +DEICNI  L LGLGFG++YVPKK   N   +    LSFTLIPKEE       N+EI   EA+SS    DH  +KRIRS+NN        QD       R
Subjt:  EDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQ--QQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGSIRR

Query:  LSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKK
         SS   IN S                     ERKKLRLSKEQS LLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKK
Subjt:  LSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKK

Query:  CCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSP
        CCERLNEENRRLKKE+ ELRSLK+GASQLYIQLPKAATLTICPSC+K+TR  A  A +P
Subjt:  CCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSP

A0A6J1EUD1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like1.5e-6260.37Show/hide
Query:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSF
        +D++CNI   LSLG GFG +YVPKK+QK      N +    LSFTL+PK+EL I             NSS                              
Subjt:  EDEICNIS-WLSLGLGFGDQYVPKKIQK------NQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSF

Query:  GSIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
                           TTN       S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  GSIRRLSSDHYINNSDIVNTTNHNYKGISSSGSEL-RERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDA----NSPP
        CEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPA +A    NSPP
Subjt:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDA----NSPP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YW03 Homeobox-leucine zipper protein HOX279.8e-4070.31Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSKEQS  LEESFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL KEL ELR+LK  A   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP
        LP A TL++CPSC+++   PA  + S P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP

P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT35.7e-4063.24Show/hide
Query:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKL
        S   +   RKKLRLSKEQ+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE++ELR+LKL
Subjt:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKL

Query:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP
         +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T +  + +PP
Subjt:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP

P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT221.7e-3973.28Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

Q01I23 Homeobox-leucine zipper protein HOX173.7e-3968.91Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+QS +LE+SF+ H TLNP QK  LAQQL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCE L EENRRL+KE+ ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRT
        +    TLT+CPSC++++ T
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRT

Q6YPD0 Homeobox-leucine zipper protein HOX279.8e-4070.31Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSKEQS  LEESFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL KEL ELR+LK  A   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP
        LP A TL++CPSC+++   PA  + S P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 41.7e-3964.57Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE++ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSP
        +    TLT+CPSC++++ + A    +P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSP

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 34.1e-4163.24Show/hide
Query:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKL
        S   +   RKKLRLSKEQ+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE++ELR+LKL
Subjt:  SSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKL

Query:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP
         +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T +  + +PP
Subjt:  GASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPP

AT4G16780.1 homeobox protein 24.5e-4062.59Show/hide
Query:  NTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLK
        +T     +GIS        RKKLRLSK+QS +LEE+FK H+TLNP QKQALA+QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL++CCE L EENRRL+
Subjt:  NTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLK

Query:  KELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP
        KE+ ELR+LKL + Q Y+ +    TLT+CPSC+ ++  P
Subjt:  KELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.2e-4073.28Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana1.0e-3968.25Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+QS  LE+SFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL+KE+ ELR+LK  ++  Y+Q
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANS
        LP A TLT+CPSC+++  + A  + S
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGATCATCATGAAGATGAAATTTGCAATATCAGTTGGCTTAGCCTTGGTTTGGGATTTGGTGATCAATATGTCCCAAAGAAGATTCAAAAAAATCAACAGCAACA
ACAACAACTCTCTTTCACTCTCATTCCTAAAGAAGAATTGGAAATTACCAACAACAACAATATGGAAATTGATGATGATGAAGCTAATTCAAGTGAAGAAGATGATGATC
ATCATTTAATGAAGAGGATTAGAAGCAGTAATAATATTGTTAATTACGATCATCATCGTCAAGATTCTTCCTTTGGATCAATTAGAAGATTATCATCAGATCATTACATC
AACAACAGCGATATTGTTAATACTACTAATCATAATTATAAAGGGATTAGTAGCAGTGGATCAGAATTAAGGGAGAGGAAAAAACTTAGGCTTTCTAAAGAACAATCCAC
TTTGTTGGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACATTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCAAAACTCGACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAA
ACAGACGTGCAAGGACGAAACTGAAACAAACAGAAGTGGACTGTGAGTTCTTGAAGAAATGCTGTGAAAGATTAAACGAAGAAAATCGAAGGTTGAAGAAAGAATTAAAC
GAATTAAGATCGCTTAAACTTGGAGCTTCACAATTGTATATTCAGCTGCCTAAGGCCGCGACGCTCACTATTTGCCCTTCATGCGACAAAATTACGAGGACGCCCGCCGT
CGACGCCAATTCTCCGCCACAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACTCACAAACCTCAATAATTAACTGATTATTATTCCAACTTGAAACCTCTCTCATTCTCTCCCTCTTTACCAATTTTTCTTCTGTCTTAAAATCCCCCACTTTTCCCC
TTTCTCTTTGTCTCCACAAGATTACTGCCATGGAAGATCATCATGAAGATGAAATTTGCAATATCAGTTGGCTTAGCCTTGGTTTGGGATTTGGTGATCAATATGTCCCA
AAGAAGATTCAAAAAAATCAACAGCAACAACAACAACTCTCTTTCACTCTCATTCCTAAAGAAGAATTGGAAATTACCAACAACAACAATATGGAAATTGATGATGATGA
AGCTAATTCAAGTGAAGAAGATGATGATCATCATTTAATGAAGAGGATTAGAAGCAGTAATAATATTGTTAATTACGATCATCATCGTCAAGATTCTTCCTTTGGATCAA
TTAGAAGATTATCATCAGATCATTACATCAACAACAGCGATATTGTTAATACTACTAATCATAATTATAAAGGGATTAGTAGCAGTGGATCAGAATTAAGGGAGAGGAAA
AAACTTAGGCTTTCTAAAGAACAATCCACTTTGTTGGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACATTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCAA
AACTCGACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAACTGAAACAAACAGAAGTGGACTGTGAGTTCTTGAAGAAATGCTGTGAAAGATTAAACGAAG
AAAATCGAAGGTTGAAGAAAGAATTAAACGAATTAAGATCGCTTAAACTTGGAGCTTCACAATTGTATATTCAGCTGCCTAAGGCCGCGACGCTCACTATTTGCCCTTCA
TGCGACAAAATTACGAGGACGCCCGCCGTCGACGCCAATTCTCCGCCACAATAATTTAATATAATGCTCTCTTTTCTTTTTTCTTTTTCCGGCTGTGTGTTCTTAGTACA
GCAAAGAAAGAATAATTCAATTCAAATAATAACATACAGCCTTTTTTAGATTATCATTTATGAATCATCTCAAAATTTTATATTCTTGAAAAAAATCAGACCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDHHEDEICNISWLSLGLGFGDQYVPKKIQKNQQQQQQLSFTLIPKEELEITNNNNMEIDDDEANSSEEDDDHHLMKRIRSSNNIVNYDHHRQDSSFGSIRRLSSDHYI
NNSDIVNTTNHNYKGISSSGSELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELN
ELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAVDANSPPQ