; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G21100 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G21100
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionprotein TIFY 5A-like
Genome locationChr1:16615714..16616435
RNA-Seq ExpressionCSPI01G21100
SyntenyCSPI01G21100
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0031347 - regulation of defense response (biological process)
GO:2000022 - regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR018467 - CO/COL/TOC1, conserved site
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7019513.1 Protein TIFY 5A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.8e-2666.67Show/hide
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XP_004149668.1 protein TIFY 5A [Cucumis sativus]3.5e-5396.75Show/hide
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XP_008444384.1 PREDICTED: protein TIFY 5A-like [Cucumis melo]1.8e-4182.93Show/hide
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XP_022927150.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita moschata]2.4e-2565.04Show/hide
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XP_023520316.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-2666.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX13 Uncharacterized protein1.7e-5396.75Show/hide
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A0A1S3BA64 protein TIFY 5A-like8.7e-4282.93Show/hide
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A0A6J1CG02 protein TIFY 5A-like3.2e-1247.66Show/hide
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A0A6J1EN30 protein TIFY 5A-like1.1e-2565.04Show/hide
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A0A6J1KQP6 protein TIFY 5A-like5.8e-2262.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LBM2 Protein TIFY 5A4.1e-0437.4Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30135.1 jasmonate-zim-domain protein 82.9e-0537.4Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCCCCTCTCCAACTTCAACTTGGAACTTTGTCTCTCTCCTCCCTCTTCATCTCCTTCCACCACCACTTCCACCACCACTTCCACCCTTCCCCTCGCCTCCAATTC
AACTTCCCAACCCAACCATATCACTCCTATCGGACTCTTCACACCTGATCTTACCGAGATCCAGGCAAAGGCAATAATAGTACAAGCCACGAGACAAATGGAGGCCGAGA
GATCAAGATGGAGGACGTGTCGAATTAGTTCATCGGCAGAAAGAGTATTGATGACGAACGGGGAAGCTAGCCCCTCCTTGAGGAGATCATTGCAGAGGTTTTTACAAAAG
AGAAAGCTTCGCATTCAAACACTTTCACCCTACGCTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTCATCCCAATATGGAGCCCCTCTCCAACTTCAACTTGGAACTTTGTCTCTCTCCTCCCTCTTCATCTCCTTCCACCACCACTTCCACCACCACTTCCACCCTTCCCCT
CGCCTCCAATTCAACTTCCCAACCCAACCATATCACTCCTATCGGACTCTTCACACCTGATCTTACCGAGATCCAGGCAAAGGCAATAATAGTACAAGCCACGAGACAAA
TGGAGGCCGAGAGATCAAGATGGAGGACGTGTCGAATTAGTTCATCGGCAGAAAGAGTATTGATGACGAACGGGGAAGCTAGCCCCTCCTTGAGGAGATCATTGCAGAGG
TTTTTACAAAAGAGAAAGCTTCGCATTCAAACACTTTCACCCTACGCTCACTAACTTTCCAAATTTTTGGAATAATCGGTGCCTTCTTCATTCTCTCTTCTCTCTTGTCA
TTTTTCTTCTTTTCCTAGCTAGGAGCTAAGTCTGTGTTTTTGGGTGGTACGTTTTGTATTTGTGCATACTTGGAGCTTATTAATTTTCCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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