CuGenDBv2

Gene ID	CSPI01G22470
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	40S ribosomal protein S15a
Genome location	Chr1:18037915..18039823
RNA-Seq Expression	CSPI01G22470
Synteny	CSPI01G22470
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0042788 - polysomal ribosome (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000630 - Ribosomal protein S8 IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAE9451430.1 hypothetical protein C3L33_16699, partial [Rhododendron williamsianum]

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KAF7133456.1 hypothetical protein RHSIM_Rhsim09G0164200 [Rhododendron simsii]

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KAF7148267.1 hypothetical protein RHSIM_Rhsim03G0129000 [Rhododendron simsii]

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KAG5557696.1 hypothetical protein RHGRI_007820 [Rhododendron griersonianum]

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XP_004144630.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucumis sativus]

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A0A0A0KZP3 Uncharacterized protein

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A0A1S3CPB7 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A5A7SSH5 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6A4L076 Uncharacterized protein (Fragment)

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Q9SBL9 Wrp15a

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SwissProt top hits

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O80646 40S ribosomal protein S15a-3

3.7e-64

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P42798 40S ribosomal protein S15a-1

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Q00332 40S ribosomal protein S15a

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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a

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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-4

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AT1G07770.1 ribosomal protein S15A

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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A

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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein

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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D

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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTGAGAGTTAGTGTTTTGAACGATGCTCTTAAGAGCATGTACAATGCAGAGAAGAGGGGGAAACGACAGGTCATGATCAGGCCGTCTTCTAAAGTCATCATCAAGTT
TCTTCTGGTTATGCAGAAGCACGGTTATATTGGTGAATTTGAGTTTGTCGATGATCATAGATCTGGAAAAATTGTTGTTGAACTCAACGGCAGGCTGAACAAATGTGGGG
TTATTAGTCCTCGTTTTGATGTGGGTGTTAAGGAAATTGAAGGTTGGACTGCTAGGTTGCTCCCTTCCAGACAGTTTGGATTCATTGTGCTGACAACATCTGCTGGAATT
ATGGATCACGAAGAAGCAAGAAGGAAGAATGTTGGAGGCAAAGTTCTTGGTTTCTTCTACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CGCCCATTCTTTGAAGCCGACGCCTCCATCTTCCATTCAGAAATCCATTGAAGTTTTAATTTGGAAGGATGGTGAGAGTTAGTGTTTTGAACGATGCTCTTAAGAGCATG
TACAATGCAGAGAAGAGGGGGAAACGACAGGTCATGATCAGGCCGTCTTCTAAAGTCATCATCAAGTTTCTTCTGGTTATGCAGAAGCACGGTTATATTGGTGAATTTGA
GTTTGTCGATGATCATAGATCTGGAAAAATTGTTGTTGAACTCAACGGCAGGCTGAACAAATGTGGGGTTATTAGTCCTCGTTTTGATGTGGGTGTTAAGGAAATTGAAG
GTTGGACTGCTAGGTTGCTCCCTTCCAGACAGTTTGGATTCATTGTGCTGACAACATCTGCTGGAATTATGGATCACGAAGAAGCAAGAAGGAAGAATGTTGGAGGCAAA
GTTCTTGGTTTCTTCTACTGAACATGGTTTTGAGCATCCATTATGGAGTTTTGACAGAGCTTTCAAATAGTACTACATTTTCTCTCGGTAAAGAAAGATCCTTATCCTGT
ATTGATGATTAGATTTTGTGTTGCCAGTTTCTCATTTCTTAAGTTAATTCCAAGGAAAATTCTATTGTTTTCGTGAAGACGTTTTGGTTCTTTTAATTATATTGGAAGAG
AACTAGTGCTTTTTAATTTCTTGCTACACCTACTCTCCCAACTCTGTTTTCTGTCACTTGTGTTTTCAAGTTCAATAATAGTTATCTGAGAGACACCCGGAGCAGCAGCC
CTTTTTAAAGCTTTACTCAAACTTGTAGAAATGTTATAATTTGGAGTCTTAGACTTGCACAGTTGTTTTAGAAATTAGACTGCAATGGATAAAAATTGAGCCCTAAAGCT
TGAACCGAACAATTGTCACAATTTCTACCTTGTACAAGTTTTAGGGTTTAATTTTAATACTAGTATAGGTTTGAGGTGCTTTAGGGATGGTCTTTTGCAAGTTGACATAT
TTGTTCCATTGTGAATGATCTATGATGGTTACCTGAGTCGGAAAGTCTGCTAGTGGACCTTTTGGGTCAGTTTGCATTGAATTTCTATGCTGCCTTGTAATGTTGATTCA
AACATACTCGGGATGATAGATCATTGTAATCACATTTCGG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLLVMQKHGYIGEFEFVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLTTSAGI
MDHEEARRKNVGGKVLGFFY

CSPI01G22470 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome