; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G24090 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G24090
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein
Genome locationChr1:19500240..19501218
RNA-Seq ExpressionCSPI01G24090
SyntenyCSPI01G24090
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060028.1 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-11792.74Show/hide
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XP_008457345.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL63 isoform X1 [Cucumis melo]1.4e-11692.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LXP0 RING-type domain-containing protein4.0e-16599.02Show/hide
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A0A1S3C4V4 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X47.0e-11790.23Show/hide
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A0A1S3C6K6 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X17.0e-11792.34Show/hide
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A0A5A7UXS2 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X12.4e-11792.74Show/hide
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A0A5D3BFR6 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X17.0e-11790.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL642.0e-2038.22Show/hide
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                  EC +CLSEFEE + GR LPKC H FH++CID W  S + CP+CR PV
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Q8L9T5 RING-H2 finger protein ATL23.7e-2235.96Show/hide
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                 +EC +CLSEFEE E GR LP C+H FH++CIDMW +SH+ CP+CR       V+    +ES      RE V    S        SSSS   
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        D P
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Q8LF65 RING-H2 finger protein ATL174.2e-1831.55Show/hide
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        ML   I +LL+V+ ++ LH Y   +        RT+   ++   P                 S   GL+PS+I ++P+F +       +A  A  AMEC 
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        +CLSEF++ E GR +P C+H FH+ CIDMW +SH++CP+CR   EP  G      D V     +      N  +  +   DS    S
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Q9LUZ9 RING-H2 finger protein ATL634.2e-3446.99Show/hide
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        +SL+ F + + SYNSN++LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  FF  P H               +RR +VT + ++    L  F D V     +A  + KG
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Query:  LDPSVISAIPLFVYESEEKKCAAAAAAAAMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVD
        LD SVIS+IPLFVYE  E++          ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR PV+    D
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Q9LZJ6 RING-H2 finger protein ATL51.0e-1936.18Show/hide
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        +   EC +CLSEFEE + GR LPKC H FH++CID W  S ++CP+CR PV   + V   + V +    +    +T     S    S+SS+ SSSS  P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-2138.22Show/hide
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        ++ N  IML+++I L + V+ +L  H+YA   F   RH+RR    +   L                SA    + LD +V+  IP+FVY S      EEK+
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                  EC +CLSEFEE + GR LPKC H FH++CID W  S + CP+CR PV
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AT3G16720.1 TOXICOS EN LEVADURA 22.6e-2335.96Show/hide
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                 +EC +CLSEFEE E GR LP C+H FH++CIDMW +SH+ CP+CR       V+    +ES      RE V    S        SSSS   
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Query:  DPP
        D P
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AT3G62690.1 AtL57.1e-2136.18Show/hide
Query:  FSYNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPHPRHHRRTSVTVSYVLAPPRLSRFDSVPFDLGSAPSNSKGLDPSVISAIPLFVYESEEKKCAAAAA
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        +   EC +CLSEFEE + GR LPKC H FH++CID W  S ++CP+CR PV   + V   + V +    +    +T     S    S+SS+ SSSS  P
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AT4G15975.1 RING/U-box superfamily protein1.7e-1931.55Show/hide
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        ML   I +LL+V+ ++ LH Y   +        RT+   ++   P                 S   GL+PS+I ++P+F +       +A  A  AMEC 
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Query:  ICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCR---EPVIGEAVDCSDAVESGEGEIGRETVNEGQSVQFNSDSSSSSS
        +CLSEF++ E GR +P C+H FH++CIDMW +SH++CP+CR   EP  G      D V     +      N  +  +   DS    S
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AT5G58580.1 TOXICOS EN LEVADURA 633.0e-3546.99Show/hide
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        +SL+ F + + SYNSN++LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  FF  P H               +RR +VT + ++    L  F D V     +A  + KG
Subjt:  TSLTQFAQTIFSYNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPHPRH---------------HRRTSVTVSYVLAPPRLSRF-DSVPFDLGSAPSNSKG

Query:  LDPSVISAIPLFVYESEEKKCAAAAAAAAMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVD
        LD SVIS+IPLFVYE  E++          ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR PV+    D
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGCCACCACCGCCGTACCTCTGTCACCGTCTCCTACGTCCTTGCTCCCCCTCGTCTCTCGCGTTTCGATTCCGTTCCCTTTGATTTAGGTTCCGCTCCGTCCAACTCCAA
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ACCATTTTCTCCTACAACAGTAACATCATGCTCGCCGCTCTCATTTCTCTTCTCTTAGTCGTCCTCTTCGTCCTTCTCCTCCACGCTTACGCCAATTGCTTCTTCCCTCA
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CCAAAGGCCTGGATCCGTCTGTTATCTCTGCCATTCCTCTGTTCGTCTACGAATCTGAGGAGAAGAAATGTGCGGCGGCGGCAGCGGCAGCGGCGATGGAGTGCGTGATT
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TTAACTCTGATTCCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCGGTTGACCCACCGCCATTGATGTCGTCGATTGGAGCGTCATTGATTCGAATATTGAGTAGAAACAGATCAGACGGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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