CuGenDBv2

Gene ID	CSPI01G25590
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	ATP citrate synthase
Genome location	Chr1:21035718..21042121
RNA-Seq Expression	CSPI01G25590
Synteny	CSPI01G25590
Gene Ontology terms	GO:0000166 - nucleotide binding (molecular function) GO:0003878 - ATP citrate synthase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain

Homology

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KAA0050962.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]

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A0A1S3BNS4 ATP citrate synthase

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A0A5A7U535 ATP citrate synthase

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A0A5D3CJ91 ATP citrate synthase

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A0A6J1HYY6 ATP citrate synthase

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O22718 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2

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80.61

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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+NQ TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCEISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC ISFSECGGI+IEENWDKVKTI +PT    T E CAPL+ATLPLEI+G++ DFI  +F +F+DLDF+FLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+G+PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFP+PFGRV+SSTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GL+KMR+LG+E+GVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 3

2.5e-223

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK RLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGC ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVLSSTE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGL++MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIM
        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 3

1.3e-222

89.13

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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRLA IDL I SAQV +STDF EL N EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK+RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG  ISFSECGGIEIEENWDKVKT+FLPTEK  T +ACAPLIATLPLE+R KIGDFI GV++VFQDLDFSFLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNI+FPLPFGRVLS +ESF+H LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKESKLKAARM+IYVRRGGPNYQTGL+KMR LG ELGVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAI+CIM+ A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2

2.2e-227

91.25

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK+RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG  ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGL+KMR LG ELGVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA

Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 1

2.7e-209

85.85

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK+RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG  ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFL TEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFK-KWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELG
        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFK  + KWGNIEFPLPFGRVLSSTE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGG                 EL 
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFK-KWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELG

Query:  NYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPL
        NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGL+KMR LG ELGVP+
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Query:  EVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        EV+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
Subjt:  EVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-3

1.8e-224

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK RLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGC ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVLSSTE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGL++MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIM
        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIM

AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-1

1.9e-205

80.85

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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV+S TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GL+KMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-1

1.9e-205

80.85

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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCEISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV+S TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GL+KMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-1

1.9e-205

80.85

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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV+S TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GL+KMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-2

4.9e-206

80.61

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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+G+PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFP+PFGRV+SSTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLSSTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GL+KMR+LG+E+GVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLSKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTAGGAAGAAGATCAGGGAGTATGACTCTAAGAGGCTTCTCAAGGAGCATCTCAAACGCCTCGCTAATATCGACCTCCAGATCTGCTCTGCTCAGGTAAATCAATC
AACCGACTTCGCTGAGCTGACAAACAACGAACCATGGCTGTCATCTACCAGGTTAGTAGTGAAACCAGACATGTTATTTGGGAAACGTGGAAAGAGTGGCTTGGTAGCTT
TGAATTTGGATCTAGCTCAAGTTGCTGAGTTTGTGAAGCAACGCCTTGGAGTGCAGGTTGAGATGGGTGGTTGCAAGGCTCCAATTACAACATTCATTGTGGAGCCATTT
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CAAGACGATTTTCCTTCCAACTGAAAAACCTTTTACACTTGAGGCATGTGCTCCGTTAATAGCTACACTTCCTCTGGAGATTCGAGGAAAGATTGGTGACTTCATAATGG
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CSPI01G25590 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome