; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G25620 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G25620
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionGlucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
Genome locationChr1:21055647..21058528
RNA-Seq ExpressionCSPI01G25620
SyntenyCSPI01G25620
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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GO:0008422 - beta-glucosidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN66453.2 hypothetical protein Csa_007420 [Cucumis sativus]2.1e-183100Show/hide
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A0A1S3BQE9 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.9e-18597.79Show/hide
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A0A5A7U6N8 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.9e-18597.79Show/hide
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O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 15.9e-1950Show/hide
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Q93V72 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 44.8e-2144.25Show/hide
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 13.8e-1840.62Show/hide
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Q9FZ86 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 34.1e-2048.36Show/hide
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Q9FZD0 Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein1.0e-1840.82Show/hide
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        CV +  A+E+ LQ  +D+ACG GGADC+QIQ +G+CY PNTL+NH   A NSY+QK  S+  +CDF G+A+++ S PST S    SSSS+ TP +  PS 
Subjt:  CVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSS-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMTPSV

Query:  PTQTPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPVGTGMPENGSPPGVFNTDNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISVAAG----LRPFTCFIILTMSFITHRI
           T       T SP T TNP+T +   + +P N         D P SS   T    T + PSSSTS     G    +R  T  ++ T++ +  R+
Subjt:  PTQTPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPVGTGMPENGSPPGVFNTDNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISVAAG----LRPFTCFIILTMSFITHRI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.8e-4745.59Show/hide
Query:  FFFSIMSLLAICSSGRFGGSHLGVEENASSELKWKFPEFGRTTMHDA---TTNFPTTPDTSTPTIITVPSTNPVTITPSSPAATPVSIPLTTPFTVPANS
        F F  +SLL+ CSS                           TT HD     T FPT P T+TPT  T P   PVTITP++PA T   +P  T    P  +
Subjt:  FFFSIMSLLAICSSGRFGGSHLGVEENASSELKWKFPEFGRTTMHDA---TTNFPTTPDTSTPTIITVPSTNPVTITPSSPAATPVSIPLTTPFTVPANS

Query:  PVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGAPVLTPPTNPVP-VSPPATTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGS
        P P+     P +T P   P+TNPVT YP   PSG  PV      PVP V+PP  +N+P + GQSWCVA+ GAS+++LQ ALDYACG   ADCSQ+QQ G+
Subjt:  PVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGAPVLTPPTNPVP-VSPPATTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGS

Query:  CYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMTPSVPTQTPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPVGTGMPENGS
        CY+P +L++HASFAFNSY+QKNPS  SCDFGG+A + N+NPSTGSCIY + SS++TP  MT    T TP+T    TV+   VT+ T   P G G+   G+
Subjt:  CYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMTPSVPTQTPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPVGTGMPENGS

Query:  PPGVFNTDNPA-------SSIGSTTGFGTEIPPSSSTSIS
        PP +FN  NP        SS G   G+G +  P+ +   S
Subjt:  PPGVFNTDNPA-------SSIGSTTGFGTEIPPSSSTSIS

AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein8.7e-2645.57Show/hide
Query:  WCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSS---SSATPASMT
        WC+A++ AS  +LQ ALDYACG GGADC QIQQ  +CY PNT+ +HASFAFNSY+QK+P S SC+FGG+A +T+++PS GSC + SSS   S++ P+ M+
Subjt:  WCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSS---SSATPASMT

Query:  PSVPTQTPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPVGTGMPENGSPPGVFNTDNPASSIGSTTG
        P   +  P++T P  ++  T     +  P G   P  G P    +  +   SI +  G
Subjt:  PSVPTQTPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPVGTGMPENGSPPGVFNTDNPASSIGSTTG

AT1G69295.1 plasmodesmata callose-binding protein 43.4e-2244.25Show/hide
Query:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSS-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMTP
        ++C+ + G +E  LQ A+DYACG  GADC+QIQ +G+CY PNT++NH   A NSY+QK  SS  +CDF G+A  + + PST S     SSSS TP + TP
Subjt:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSS-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMTP

Query:  SVPTQ---TPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPV----GTGMPENGSPPGVFNTDNPASSIGSTTGFGTEIPPSSS
        +  T    TPTT  P T +PTT T PT+ +P      TG P  G+  G+ N++   +S  S+   GT + P+ S
Subjt:  SVPTQ---TPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPV----GTGMPENGSPPGVFNTDNPASSIGSTTGFGTEIPPSSS

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.2e-2843.62Show/hide
Query:  TTPFTVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGAPVLTPPTNPVPVSPPATTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADC
        T   T P      +T P+A         P T P T  P     A  +       P++ P++ +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACG GGADC
Subjt:  TTPFTVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGAPVLTPPTNPVPVSPPATTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADC

Query:  SQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMT-----------PSVPTQTP
        S+IQ+ G+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP  +SC+F G+A+  +++PS GSC +PS+S+S +  ++T           PS PT  P
Subjt:  SQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMT-----------PSVPTQTP

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein8.7e-2646Show/hide
Query:  TTPFTVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGAPVLTPPTNPVPVSPPATTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADC
        T   T P      +T P+A         P T P T  P     A  +       P++ P++ +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACG GGADC
Subjt:  TTPFTVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGAPVLTPPTNPVPVSPPATTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADC

Query:  SQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPS
        S+IQ+ G+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP  +SC+F G+A+  +++PS
Subjt:  SQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCAAACAGCTTCCAAATGCTTCTTTTTTTCCATTATGTCTCTCCTTGCCATCTGCTCGTCTGGTAGATTTGGTGGGTCGCATTTGGGAGTGGAAGAAAATGCTTC
CTCGGAGTTGAAGTGGAAGTTCCCTGAATTTGGTCGGACTACAATGCACGACGCCACAACAAATTTTCCTACAACCCCGGACACCTCCACACCGACAATCATCACCGTTC
CCTCGACCAACCCTGTCACTATCACTCCGTCGAGCCCTGCTGCCACGCCGGTGTCCATTCCTTTAACGACACCATTCACAGTTCCGGCTAACTCTCCGGTGCCGCTCACG
AATCCGGTTGCGCCGCCGGTTACAGTTCCCGGAGCACAGCCCATAACGAACCCTGTCACGACGTATCCAGCTCCGTCAGGTGGCGCTCCAGTGTTGACACCCCCCACAAA
CCCAGTTCCGGTATCCCCTCCGGCGACAACAAACGCACCGGTAATTCCAGGACAAAGCTGGTGTGTAGCCAGGTCCGGCGCTTCGGAGATGGCTCTCCAGTCGGCGTTGG
ATTACGCTTGTGGCACTGGAGGGGCTGACTGTTCTCAAATCCAGCAAAGTGGAAGCTGTTACAACCCAAATACACTTGAAAACCACGCATCTTTTGCATTCAATAGCTAT
TTTCAGAAGAATCCTTCTTCTACAAGCTGTGACTTTGGAGGATCTGCAATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCTTGTATTTACCCATCATCATCTTCCTCTGC
AACGCCGGCATCCATGACGCCGTCGGTTCCAACGCAGACACCGACAACAACAGCGCCGATCACAGTCTCACCAACTACAGTTACAAATCCAACAACTTCTTCACCAGTGG
GGACCGGCATGCCAGAAAATGGAAGTCCTCCTGGTGTATTTAACACAGACAATCCAGCTTCGAGCATAGGCAGCACAACGGGGTTTGGAACTGAGATTCCTCCAAGCTCA
AGCACCTCAATATCCGTAGCGGCTGGATTGAGACCCTTTACTTGCTTCATCATTCTCACCATGTCCTTCATCACTCATAGAATAATCACTCTGGACTGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCTTTGAGGTTATTTATCTTTTGAAAAAAGATGGAAAAAGCAAAAAAGTATGGATGGCTGGTTCCCTTTTTTCTACTGCATCAGAGCCAACATTTCCAATATCATCCTT
GCTCATAAAGTAACCATTTTTTCCCTTTCTTTTATCAATAATCTATTTCTTTCTTTTATATTGCAGCCGTAAGCATTTGCAACTTGGTCATCTGTCTACTTTTCTAACCT
TTACCTTCTTCCTTTTCCCTCTCCCCTCCTTTCCCTTTTTTTTCTCTCTCTTTCACTTTGCATGTTTCGCCCTTAAACCCTTTCCTTTTACACCATTTCCCCTGTCTGGT
TTCGTGTTTTTAAAAGCAATGCCTAAATTAAACCGATCCCATTAAGAATCCAGTTGGGTCTCTTCATTTGTCCCCAGAAGAGAACTATAACCTCTCACCATTAAAATGGC
CCAAACAGCTTCCAAATGCTTCTTTTTTTCCATTATGTCTCTCCTTGCCATCTGCTCGTCTGGTAGATTTGGTGGGTCGCATTTGGGAGTGGAAGAAAATGCTTCCTCGG
AGTTGAAGTGGAAGTTCCCTGAATTTGGTCGGACTACAATGCACGACGCCACAACAAATTTTCCTACAACCCCGGACACCTCCACACCGACAATCATCACCGTTCCCTCG
ACCAACCCTGTCACTATCACTCCGTCGAGCCCTGCTGCCACGCCGGTGTCCATTCCTTTAACGACACCATTCACAGTTCCGGCTAACTCTCCGGTGCCGCTCACGAATCC
GGTTGCGCCGCCGGTTACAGTTCCCGGAGCACAGCCCATAACGAACCCTGTCACGACGTATCCAGCTCCGTCAGGTGGCGCTCCAGTGTTGACACCCCCCACAAACCCAG
TTCCGGTATCCCCTCCGGCGACAACAAACGCACCGGTAATTCCAGGACAAAGCTGGTGTGTAGCCAGGTCCGGCGCTTCGGAGATGGCTCTCCAGTCGGCGTTGGATTAC
GCTTGTGGCACTGGAGGGGCTGACTGTTCTCAAATCCAGCAAAGTGGAAGCTGTTACAACCCAAATACACTTGAAAACCACGCATCTTTTGCATTCAATAGCTATTTTCA
GAAGAATCCTTCTTCTACAAGCTGTGACTTTGGAGGATCTGCAATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCTTGTATTTACCCATCATCATCTTCCTCTGCAACGC
CGGCATCCATGACGCCGTCGGTTCCAACGCAGACACCGACAACAACAGCGCCGATCACAGTCTCACCAACTACAGTTACAAATCCAACAACTTCTTCACCAGTGGGGACC
GGCATGCCAGAAAATGGAAGTCCTCCTGGTGTATTTAACACAGACAATCCAGCTTCGAGCATAGGCAGCACAACGGGGTTTGGAACTGAGATTCCTCCAAGCTCAAGCAC
CTCAATATCCGTAGCGGCTGGATTGAGACCCTTTACTTGCTTCATCATTCTCACCATGTCCTTCATCACTCATAGAATAATCACTCTGGACTGGTGATGAAATGAAATCA
CTAACTTCTTCTCCTTCTACTGTACATGAAAAGGCCCTCGTTATTCATAGCTTCAGAATCGTCGCCCAGTTCCACCATTAGTGCAATTTTTGGAGGAGAAAAAGGAACCA
GAGGTGAGTTTGAGTTTGGAAGGATAAACCACTGCCACTGCCCTGCTTGAGCTTTTGTTTGTGTAAAGATCAAAGATAGGGATGTATTAGTATTAGCTACTTCCAATTTG
AGACTCTGTAATATAATATAATGTTTGTTAGATTTTGGGATTTGTATTGCTGTTGATCACAGTTTATTAAGATTAAAATTTTAGTTAGAAGAAACAGAGACACATAGCTG
GACTTGGAAGTACTTCTGTTCCTATGTTTAAGTCTTGAATGTTTTGTATGGTTTAATGATTAATTTATTGTTTATTTACGTATGACTTGGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQTASKCFFFSIMSLLAICSSGRFGGSHLGVEENASSELKWKFPEFGRTTMHDATTNFPTTPDTSTPTIITVPSTNPVTITPSSPAATPVSIPLTTPFTVPANSPVPLT
NPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGAPVLTPPTNPVPVSPPATTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGTGGADCSQIQQSGSCYNPNTLENHASFAFNSY
FQKNPSSTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPSSSSSATPASMTPSVPTQTPTTTAPITVSPTTVTNPTTSSPVGTGMPENGSPPGVFNTDNPASSIGSTTGFGTEIPPSS
STSISVAAGLRPFTCFIILTMSFITHRIITLDW