; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G28100 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G28100
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionGATA transcription factor 21
Genome locationChr1:22826299..22828724
RNA-Seq ExpressionCSPI01G28100
SyntenyCSPI01G28100
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK10096.1 GATA transcription factor 21 [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-9691.63Show/hide
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XP_004135818.1 putative GATA transcription factor 22 [Cucumis sativus]6.5e-17699.08Show/hide
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XP_008450852.1 PREDICTED: GATA transcription factor 21 [Cucumis melo]3.2e-15489.74Show/hide
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XP_022967871.1 GATA transcription factor 21-like isoform X1 [Cucurbita maxima]4.5e-8461.47Show/hide
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        WK           E ++ND+  NDSVKW  SSSSSSSKI+ +IN NQTE TL +TI++ RN QDLN    SPSPS  +QTNKR +   L+D GGAIIRTC
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        SDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAE    AANGG   AVV+KTNK +      KPA T+KRK+K+ V          GGGR+KLC E
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        ++KMG RL+EI+S+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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XP_038878562.1 GATA transcription factor 21 [Benincasa hispida]1.4e-13381.66Show/hide
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        DKRE+SSCCENNNN+NT ND VKWSSSSSSSKIKF+INSNQTET  TRTI+SGRN QDLN    +PSPSSF+QTNKRTS T L DGGAIIRTCSDCNTTK
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        TPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAAANG    AVV+K+NK VQHKI TK A     TTLKRK KD VV    GG   GGGRK LCFEEI
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        K+G RLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZE4 GATA-type domain-containing protein3.2e-17699.08Show/hide
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        QRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A1S3BPL1 GATA transcription factor 211.5e-15489.74Show/hide
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        TTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAA NGGAVV+KTNK VQHKITTKPATT      LKRKYKDEVVVV    GGDK GG + KLCF
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        EEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A5D3CI65 GATA transcription factor 211.5e-9691.63Show/hide
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A0A6J1ELP1 GATA transcription factor 21-like1.9e-8060.23Show/hide
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        K           E ++ND+  NDSVKW  SSSSSSSKI+ +IN NQTET  T+TI++ RN QDLN    SPSPS  +QTNKR    TL+D GGAIIRTCS
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        DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAE AA   N  AVV+KTNK +      KPA T+KRK+K+ V                GGGR+KLC
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         E++KMG RLSEISS+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A6J1HT96 GATA transcription factor 21-like isoform X12.2e-8461.47Show/hide
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        MAPPYRDSFPS+HD+L  + SSS   HLFFP  T    SS SS LSF        S+     S+   H E GG MGC NDQ    HE + E ETGL FTI
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Query:  WKQIDKRETSSCCENNNNDNTQNDSVKW--SSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLN---NSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHD-GGAIIRTC
        WK           E ++ND+  NDSVKW  SSSSSSSKI+ +IN NQTE TL +TI++ RN QDLN    SPSPS  +QTNKR +   L+D GGAIIRTC
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Query:  SDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAAANGG---AVVVKTNKVVQHKITTKPATTLKRKYKDEVVVVGGDKK--GGGRKKLCFE
        SDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAE    AANGG   AVV+KTNK +      KPA T+KRK+K+ V          GGGR+KLC E
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        ++KMG RL+EI+S+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5HZ36 GATA transcription factor 212.6e-2633.6Show/hide
Query:  HYSSSHHLFFPILTPQASSSSSSSLSFTALDHSMISD-----------DPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSS
        H+   HH   P  +  +SSS SS  S+     +   D           D L  S  LK +   +   N   S  +H    +ET L+ TI K+    E   
Subjt:  HYSSSHHLFFPILTPQASSSSSSSLSFTALDHSMISD-----------DPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSS

Query:  CCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLNNSPSPSSFEQ------------TNKRTSTT------TLHDGG-----
           + N     +DS KW  S     IK  I +N  +  + +T  +     D       ++F++            T K T+ T      T+++ G     
Subjt:  CCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLNNSPSPSSFEQ------------TNKRTSTT------TLHDGG-----

Query:  AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANGGAVVVKTNKV-VQHKITTKP----------------ATTLKRKYKD-
         +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA AAAA     AV  +  ++ ++ K+  K                 A   K K K+ 
Subjt:  AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANGGAVVVKTNKV-VQHKITTKP----------------ATTLKRKYKD-

Query:  -----EVVVVGGDKK----------GGGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
             E   V GD +               K CF+++ +   +   SS+YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
Subjt:  -----EVVVVGGDKK----------GGGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

Q6YW48 Protein CYTOKININ-RESPONSIVE GATA TRANSCRIPTION FACTOR 11.4e-1933.46Show/hide
Query:  ENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLNNS-PSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGP
        E+NN  +    + KW S               T     R I  G        +   P    Q ++  S   L     ++R CSDCNTTKTPLWRSGP GP
Subjt:  ENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLNNS-PSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGP

Query:  KSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAAANGGAVVVKTNKVVQHKITTKPATTLKR-----------------------------------------KYKDEV
        KSLCNACGIRQRKARRAM    AAAANGGA V     V    +  KPA   ++                                         K +D V
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Query:  VVVGGDKKGGGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSS--YQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH
        +VVGG+              K     +  ++S  +    P+DE  +AA+LLMTLS GL+H
Subjt:  VVVGGDKKGGGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSS--YQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH

Q8LC59 GATA transcription factor 233.1e-1176.92Show/hide
Query:  IRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA
        IR CS+C TTKTP+WR GP GPKSLCNACGIR RK RR+
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Q9FJ10 GATA transcription factor 162.1e-1237.96Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAAANGGAVVVKTNKVVQHKITTKPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKGGGRKKLCFEEI
        +TC+DC T+KTPLWR GP GPKSLCNACGIR RK RR           GG               T+    LK+         GG++K G   K    ++
Subjt:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAAANGGAVVVKTNKVVQHKITTKPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKGGGRKKLCFEEI

Query:  KMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH
         +  R S +    Q++   +E +AA+LLM LSYG ++
Subjt:  KMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH

Q9SZI6 Putative GATA transcription factor 222.1e-2835.96Show/hide
Query:  ISDDPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSSCCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIES
        + D  +++ +E K+        ++DQ +       +ET L+ TI K+ + ++ +   ++   D T  +S+KW     SSK++ M       TT      S
Subjt:  ISDDPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSSCCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIES

Query:  GRNVQDLNNSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANG-GAVVVKTNKVVQHK
          + Q  NN  S S+   + ++      ++   +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA A A A +G    V+K     ++K
Subjt:  GRNVQDLNNSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANG-GAVVVKTNKVVQHK

Query:  ITT----------KPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKG-------GGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        I+               T KR    E   +  D +             + F+++ +   L   SS+YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
Subjt:  ITT----------KPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKG-------GGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G16141.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein1.7e-1245.35Show/hide
Query:  NQTETTLTRTIESGRNVQDLNNSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA
        + TE T T  +ES  +  D++N    SS               GG   +TC DC T++TPLWR GP GPKSLCNACGI+ RK R+A
Subjt:  NQTETTLTRTIESGRNVQDLNNSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA

AT4G26150.1 cytokinin-responsive gata factor 11.5e-2935.96Show/hide
Query:  ISDDPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSSCCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIES
        + D  +++ +E K+        ++DQ +       +ET L+ TI K+ + ++ +   ++   D T  +S+KW     SSK++ M       TT      S
Subjt:  ISDDPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSSCCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIES

Query:  GRNVQDLNNSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANG-GAVVVKTNKVVQHK
          + Q  NN  S S+   + ++      ++   +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA A A A +G    V+K     ++K
Subjt:  GRNVQDLNNSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANG-GAVVVKTNKVVQHK

Query:  ITT----------KPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKG-------GGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        I+               T KR    E   +  D +             + F+++ +   L   SS+YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
Subjt:  ITT----------KPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKG-------GGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

AT5G26930.1 GATA transcription factor 232.2e-1276.92Show/hide
Query:  IRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA
        IR CS+C TTKTP+WR GP GPKSLCNACGIR RK RR+
Subjt:  IRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA

AT5G49300.1 GATA transcription factor 161.5e-1337.96Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAAANGGAVVVKTNKVVQHKITTKPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKGGGRKKLCFEEI
        +TC+DC T+KTPLWR GP GPKSLCNACGIR RK RR           GG               T+    LK+         GG++K G   K    ++
Subjt:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAAAAANGGAVVVKTNKVVQHKITTKPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKGGGRKKLCFEEI

Query:  KMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH
         +  R S +    Q++   +E +AA+LLM LSYG ++
Subjt:  KMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH

AT5G56860.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein1.9e-2733.6Show/hide
Query:  HYSSSHHLFFPILTPQASSSSSSSLSFTALDHSMISD-----------DPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSS
        H+   HH   P  +  +SSS SS  S+     +   D           D L  S  LK +   +   N   S  +H    +ET L+ TI K+    E   
Subjt:  HYSSSHHLFFPILTPQASSSSSSSLSFTALDHSMISD-----------DPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSS

Query:  CCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLNNSPSPSSFEQ------------TNKRTSTT------TLHDGG-----
           + N     +DS KW  S     IK  I +N  +  + +T  +     D       ++F++            T K T+ T      T+++ G     
Subjt:  CCENNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLNNSPSPSSFEQ------------TNKRTSTT------TLHDGG-----

Query:  AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANGGAVVVKTNKV-VQHKITTKP----------------ATTLKRKYKD-
         +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA AAAA     AV  +  ++ ++ K+  K                 A   K K K+ 
Subjt:  AIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAAAAAANGGAVVVKTNKV-VQHKITTKP----------------ATTLKRKYKD-

Query:  -----EVVVVGGDKK----------GGGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
             E   V GD +               K CF+++ +   +   SS+YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
Subjt:  -----EVVVVGGDKK----------GGGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCTCCTTATCGGGACTCGTTTCCCTCCGATCACGACGATCTTGATCTTCACTACTCGTCTTCTCATCACCTCTTTTTCCCTATCCTCACCCCTCAGGCTTCTTC
TTCTTCTTCCTCCTCTCTTTCTTTCACTGCCCTCGATCATTCCATGATCTCCGACGATCCTCTAGCTCGCTCGATAGAGCTCAAACATGAGGGTGGCGGGATTATGGGTT
GTAACAATGATCAAAGTATTGGAAATCATGAAGATCATATGGAAGAAACTGGACTAAGGTTTACAATTTGGAAGCAGATTGATAAGAGAGAAACTTCAAGCTGTTGTGAG
AATAATAACAATGATAATACTCAAAATGATTCGGTGAAGTGGTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCAAGATCAAATTCATGATAAATTCTAACCAAACTGAGACGACTCTCAC
CCGAACAATCGAAAGCGGTCGAAATGTCCAAGATCTCAACAACTCACCGTCACCGTCTTCATTTGAACAAACAAACAAACGAACAAGCACGACGACACTACATGACGGGG
GTGCCATAATCAGAACCTGTTCCGATTGTAACACCACAAAAACTCCCCTTTGGAGAAGCGGCCCTAGAGGTCCTAAGTCACTTTGCAACGCGTGTGGAATCCGACAGAGA
AAAGCAAGACGAGCAATGGCAGAAGCAGCAGCGGCCGCTGCGAACGGTGGGGCTGTAGTTGTAAAGACCAACAAGGTGGTACAACACAAGATAACGACGAAGCCAGCGAC
GACATTGAAGAGAAAATACAAAGACGAGGTCGTGGTAGTCGGTGGCGACAAGAAGGGCGGAGGAAGAAAGAAACTTTGTTTTGAAGAGATAAAAATGGGGGGAAGATTGA
GTGAGATATCTTCATCCTATCAACGAGTTTTCCCACAAGATGAAAGAGAAGCTGCCATTTTGCTCATGACTCTATCTTATGGCCTTCTTCATGGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTTTTTCTCTCCTTTTATAAGTATTTTCACCATTATTACATCTCTTGATTCTTCAACCTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTAACTGATTTTTCTTTGATCATCT
TCTTCTCTTCATTATGGCTCCTCCTTATCGGGACTCGTTTCCCTCCGATCACGACGATCTTGATCTTCACTACTCGTCTTCTCATCACCTCTTTTTCCCTATCCTCACCC
CTCAGGCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTCTTTCTTTCACTGCCCTCGATCATTCCATGATCTCCGACGATCCTCTAGCTCGCTCGATAGAGCTCAAACATGAGGGTGGC
GGGATTATGGGTTGTAACAATGATCAAAGTATTGGAAATCATGAAGATCATATGGAAGAAACTGGACTAAGGTTTACAATTTGGAAGCAGATTGATAAGAGAGAAACTTC
AAGCTGTTGTGAGAATAATAACAATGATAATACTCAAAATGATTCGGTGAAGTGGTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCAAGATCAAATTCATGATAAATTCTAACCAAACTG
AGACGACTCTCACCCGAACAATCGAAAGCGGTCGAAATGTCCAAGATCTCAACAACTCACCGTCACCGTCTTCATTTGAACAAACAAACAAACGAACAAGCACGACGACA
CTACATGACGGGGGTGCCATAATCAGAACCTGTTCCGATTGTAACACCACAAAAACTCCCCTTTGGAGAAGCGGCCCTAGAGGTCCTAAGTCACTTTGCAACGCGTGTGG
AATCCGACAGAGAAAAGCAAGACGAGCAATGGCAGAAGCAGCAGCGGCCGCTGCGAACGGTGGGGCTGTAGTTGTAAAGACCAACAAGGTGGTACAACACAAGATAACGA
CGAAGCCAGCGACGACATTGAAGAGAAAATACAAAGACGAGGTCGTGGTAGTCGGTGGCGACAAGAAGGGCGGAGGAAGAAAGAAACTTTGTTTTGAAGAGATAAAAATG
GGGGGAAGATTGAGTGAGATATCTTCATCCTATCAACGAGTTTTCCCACAAGATGAAAGAGAAGCTGCCATTTTGCTCATGACTCTATCTTATGGCCTTCTTCATGGTTA
ATTAATTAATTTTTAATATTATATATTCTTTTTTATTTTATTGCTCTTTTTCTTTTTCTTTGTGAGTTTGATTTTCTTATTTCTAAATGCTAATGCATTTTGGGGATAAA
AAGTTTTCAAATAATTAGAAAAAAAAAAAAGACCACTGAGGAAAATCATCTTGTATTATTGTACTTATTTATTTTCATCTACATATATATAATTTTAATAATAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPPYRDSFPSDHDDLDLHYSSSHHLFFPILTPQASSSSSSSLSFTALDHSMISDDPLARSIELKHEGGGIMGCNNDQSIGNHEDHMEETGLRFTIWKQIDKRETSSCCE
NNNNDNTQNDSVKWSSSSSSSKIKFMINSNQTETTLTRTIESGRNVQDLNNSPSPSSFEQTNKRTSTTTLHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQR
KARRAMAEAAAAAANGGAVVVKTNKVVQHKITTKPATTLKRKYKDEVVVVGGDKKGGGRKKLCFEEIKMGGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG