; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G29110 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G29110
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1-like
Genome locationChr1:23592012..23596599
RNA-Seq ExpressionCSPI01G29110
SyntenyCSPI01G29110
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588115.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.9e-14798.88Show/hide
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XP_022967890.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita maxima]1.5e-14698.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein7.9e-149100Show/hide
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A0A1S3BPW8 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X21.8e-14899.63Show/hide
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A0A6J1D0R2 transcription factor Pur-alpha 17.4e-14798.13Show/hide
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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like7.4e-14798.5Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like7.4e-14798.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A2.2e-1528.68Show/hide
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        Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G+S      A + ++ +   LP Q   E  + LA L DD G     G   G +   G      
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                     G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q6PHK6 Transcriptional activator protein Pur-beta1.2e-1628.15Show/hide
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        K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  S    F D    +I          PE                + S+ L  + + +Y D+
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         EN+RGRFL++        R T+    G     G      +     +A +   LP Q   E  + LA L DD G           GP             
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        A    G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +P     +F      + E  K+
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Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B3.4e-1629.12Show/hide
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        K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE                    + S+ L  + + +
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        Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G+S        + ++ +   LP Q   E  + LA L DD G     G    SG +        
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                 G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q96QR8 Transcriptional activator protein Pur-beta5.5e-1428.24Show/hide
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        K L +++K FY D+K+N +GR+LKI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE               + S+ L  + + +Y D+ 
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        EN+RGRFL++ + +V+R         G     G            ++ +   LP Q   E  + LA L DD G      AG   G     GP   L    
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                  G L     I  D KRFFFD+G N  G FLR+SEV  + R++I +P     +F
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Q9SKZ1 Transcription factor Pur-alpha 17.4e-12081.2Show/hide
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        IVPAGS+ DEGW+AFRNILAEI+EAS LF++PNQ + S+  E L    DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFF
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Query:  FDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR
        FDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPLSGLKQF+E++GHFVEITKD+IEGMTG NVRTVDPPQR
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32080.1 purin-rich alpha 15.3e-12181.2Show/hide
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AT2G32080.2 purin-rich alpha 12.1e-12281.51Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGTTTTACTTTGACATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATTGTTCCTGCCGGAAGCAACCGG
GATGAGGGATGGTCTGCATTTAGAAACATCTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAACGTCTCGCCGG
ACTTTCGGATGATGTAGGAGCAGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAATCTGGGCCAACCTCTGACTTGAATGTAGATAGACAAGTAGACTTGTCAGCTCAAGATGAAA
TGGGGAATCTGGGTGTTTCAAAGGTTATCCGAGCTGATCAAAAGAGATTCTTTTTCGATCTTGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTTGAGGATTTCTGAGGTTGCAGGG
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GAATGTCCGAACTGTGGATCCACCTCAGAGATGA
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AAACATCGGCTACAAGGTCAACGATCATTGTTCCTTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAAGTTTTTAGCAAG
GAATTGCAGCTGGACACAAAGGTGTTTTACTTTGACATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTAT
TGTTCCTGCCGGAAGCAACCGGGATGAGGGATGGTCTGCATTTAGAAACATCTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTG
AACATTCAGAACGTCTCGCCGGACTTTCGGATGATGTAGGAGCAGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAATCTGGGCCAACCTCTGACTTGAATGTAGATAGACAAGTA
GACTTGTCAGCTCAAGATGAAATGGGGAATCTGGGTGTTTCAAAGGTTATCCGAGCTGATCAAAAGAGATTCTTTTTCGATCTTGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTT
GAGGATTTCTGAGGTTGCAGGGGCAGATCGTTCTTCAATCATTCTCCCATTGTCAGGTCTTAAGCAGTTCTATGAAATAGTAGGACATTTTGTGGAGATCACCAAAGACA
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ACACGCACGCAGGTGTTCAAGTAGGGTTCAAATTTGTGGTCAGTGTGGTTGTTTGATATTTTCCTGTCTTGATTTTCTAGTTCAAGTCTGAATAATCCATCCTGCTAGAG
ATTAGCAGAGGGTATGGAAAATGCTTGAGAAGCTTAATTATTCTTCTTCCATGAATAACAAGATATAAAAAGATAGAGGGGAAAGAGAGATATGGCTTGTAATTGTCACT
TTATAATAATGGTGAGTTCAGGTGTGTTTTGTTCATTTCATTTCCTGTAGTTACTAACGATTTTCACTTCCATTTCCAGCCTTTCTGCTTTCATCCCAATAATTATTTTT
GGATTGAGTTCAACAATTTATGGAGATGAAACTTCGAACCACTTACCTTTCGTATGGGTATGTATGTCTTATTTAGTTATGTTAGTAAAGTGTTTGTCATTGATTGTATG
AGTTGTTGAAATTGTGATGGTATATCTATTTTGGTTGCAAGTTGAAGAGTGTTTTCACAATATATATTGGTTATATATTCACAAATATTTGCTTCTTTAGATGAAGCTGC
TACCATGCACAAGTCTCCCTCAAAAATAAAAAAAAGAGATACAAGATGTTGTACTAGATCGAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DEGWSAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAG
ADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR