; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G29580 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G29580
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr1:24016876..24017713
RNA-Seq ExpressionCSPI01G29580
SyntenyCSPI01G29580
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038878738.1 uncharacterized protein LOC120070912 [Benincasa hispida]4.2e-5476.36Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX97 Uncharacterized protein7.2e-8499.39Show/hide
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A0A1S3BRF0 uncharacterized protein LOC1034924583.8e-6987.88Show/hide
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A0A5A7UQ57 Uncharacterized protein3.1e-5587.05Show/hide
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A0A5D3DU40 Uncharacterized protein3.8e-6987.88Show/hide
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A0A6J1F625 uncharacterized protein LOC111441161 isoform X21.1e-3463.4Show/hide
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        +  LEWS+ARK MIE+QA AEL+SLQLL+PNRFEYLKLELKSFI LLQSQ     E  F QPNT + ++R  SPS+  PD+QESSSCRKRRK+ EG    
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           NGL++E+A  E E+  K GR +DRVDVVLERA VCL KI+RFK AL S+A
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G36960.1 unknown protein2.2e-0835.86Show/hide
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        S + +  + E A  EL+ LQ  YPNRF YLK +L+SFI  L+   +H  P+           SPSS    TQESS+C  ++K  + +   +N  +     
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Query:  VAEYEYESESKMG-----RGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMAL
             +++ +KMG     + K+RV++VLERA +CL KIR  K +L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGAATTCCCAAGAGTGAAGAACCATAACGAGACATACACGGAGAAAATCTCAAGCTTAGAATGGAGCAAAGCAAGGAAGACGATGATCGAAGAACAAGCAAATGC
CGAATTACAATCTCTCCAACTTCTCTACCCCAATCGTTTCGAATACCTAAAGCTCGAACTCAAATCCTTCATCCATCTCCTTCAATCCCAACCCGAACATCCTTTTCCTC
AGCCAAACACTAACTTAACCTCCAACCGCTCGCCGTCGCCGTCCTCTTTCGGTCCTGATACACAAGAGTCGAGTAGTTGTAGGAAGAGGAGGAAGGTGGCGGAAGGAAGA
AACAATGGAAGGAATGGATTACAGAAAGAGGTTGCTGAATATGAATATGAATCTGAATCGAAGATGGGACGGGGGAAGGATAGAGTGGATGTAGTTCTGGAAAGAGCGGC
CGTTTGTCTTTGCAAGATTCGACGGTTCAAAATGGCGCTGTTTTCCTCCGCGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTGCAAAAAGACCCCACAAACTTTCCGTCTTCTTCTTTCCCTTTCTGACCTTCCACTTCTTTCATTTCCATGGCAGAATTCCCAAGAGTGAAGAACCATAACGAGACAT
ACACGGAGAAAATCTCAAGCTTAGAATGGAGCAAAGCAAGGAAGACGATGATCGAAGAACAAGCAAATGCCGAATTACAATCTCTCCAACTTCTCTACCCCAATCGTTTC
GAATACCTAAAGCTCGAACTCAAATCCTTCATCCATCTCCTTCAATCCCAACCCGAACATCCTTTTCCTCAGCCAAACACTAACTTAACCTCCAACCGCTCGCCGTCGCC
GTCCTCTTTCGGTCCTGATACACAAGAGTCGAGTAGTTGTAGGAAGAGGAGGAAGGTGGCGGAAGGAAGAAACAATGGAAGGAATGGATTACAGAAAGAGGTTGCTGAAT
ATGAATATGAATCTGAATCGAAGATGGGACGGGGGAAGGATAGAGTGGATGTAGTTCTGGAAAGAGCGGCCGTTTGTCTTTGCAAGATTCGACGGTTCAAAATGGCGCTG
TTTTCCTCCGCGGGTTGAAGACGGTGCTCCGTCGTCTTGACGCCTCAAAGGTGCCGATCCGATCTTTCTCTTTCTCATGCAATGACATTGCCTCTCACGTGTGAGAACGT
TGAAATTTGGTGGGGGACGGGTGAATGTTCTATTTTGGTCCGATTTTGCGGTTGATGAAAAAGAAAATAAAAAATATCACTTTTGCATCTATTTTACCTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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