; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G30600 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G30600
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionGamma-tubulin complex component
Genome locationChr1:25097798..25101074
RNA-Seq ExpressionCSPI01G30600
SyntenyCSPI01G30600
Gene Ontology termsGO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
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GO:0051225 - spindle assembly (biological process)
GO:0051321 - meiotic cell cycle (biological process)
GO:0000922 - spindle pole (cellular component)
GO:0000923 - equatorial microtubule organizing center (cellular component)
GO:0000930 - gamma-tubulin complex (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
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GO:0043015 - gamma-tubulin binding (molecular function)
GO:0051011 - microtubule minus-end binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007259 - Gamma-tubulin complex component protein
IPR041470 - Gamma tubulin complex component protein, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035230.1 gamma-tubulin complex component 4-like protein [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-15099.27Show/hide
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A0A0A0LZT6 Gamma-tubulin complex component5.4e-15199.63Show/hide
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A0A1S4E5X5 Gamma-tubulin complex component1.2e-15099.27Show/hide
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A0A5D3DW94 Gamma-tubulin complex component8.0e-15587.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9D4F8 Gamma-tubulin complex component 45.9e-2228.74Show/hide
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          +  +    +Y RA   G+  +L  YR A+L +EQ+ L++    ++ V   LD+F +LFP +  ++ +I+   I G Q+L  ++K    G+P +++ ++
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Q9M350 Gamma-tubulin complex component 49.2e-10870.93Show/hide
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        E SK   E  PSVYRRAIANGI EILS+YRSAVLH+EQKLL+ET PILA VT+GL+KFFVLFPPL+++I EIERDDIRGGQLLN+L+KRCHCGVPEL+TC
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Q9SC88 Gamma-tubulin complex component 4 homolog5.1e-10668.66Show/hide
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              E PSVYRRA+ANGIVEIL++Y S++LH+EQ LLSET+PILA VTQGL+KFF L PPL++LI +IER DIRGG+LLNLLHK+CHCGVPELQTCIQ
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Q9UGJ1 Gamma-tubulin complex component 43.5e-2229.53Show/hide
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        S + +     +Y RA   G+  +L  YR A+L +EQ+ L +    ++ V   LD+F +LFP +  ++ +I+   I G Q+L  ++K    G+P +++ ++
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Q9VKU7 Gamma-tubulin complex component 4 homolog1.8e-1027.47Show/hide
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         L   F L   +  LI EI   ++RG  LL+ LH++C  G  +L+  I+ ++       ++ LA W+++G++ D H EFFI+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53760.1 GAMMA-TUBULIN COMPLEX PROTEIN 46.6e-10970.93Show/hide
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        MLHELLLALLG+TGDLI+DERE   +LGL     D+P+S E TFKLA DISF+EPSERDLI+R+I LGFYYRELDRFA KSRNLSWIRS  +   L  + 
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Query:  ESSKDKIE-NPSVYRRAIANGIVEILSIYRSAVLHVEQKLLSETVPILAIVTQGLDKFFVLFPPLHQLIREIERDDIRGGQLLNLLHKRCHCGVPELQTC
        E SK   E  PSVYRRAIANGI EILS+YRSAVLH+EQKLL+ET PILA VT+GL+KFFVLFPPL+++I EIERDDIRGGQLLN+L+KRCHCGVPEL+TC
Subjt:  ESSKDKIE-NPSVYRRAIANGIVEILSIYRSAVLHVEQKLLSETVPILAIVTQGLDKFFVLFPPLHQLIREIERDDIRGGQLLNLLHKRCHCGVPELQTC

Query:  IQRLLWHGHQVMYNQLASWMVYGLLQDKHGEFFIRRQDDRETNQGSSVQDMSEKLGRLSTDE-SLTDWHLGFHIYLVHSLPRLLPIFTG
        +QRLLW+GHQVMYNQLA+WMVYG+LQD HGEFFI+RQDD + +  SS +++SEKL R S  E SLTDWH GFHI L   LP  +P+  G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATTTCTGGCGAACCCACGTTCAAGCTCGCCTCTGATATTTCCTTTCTTGAACCGAGCGAAAGGGATCTAATTCAGAGGATCATTGTGTTAGGATTTTACTACAGAGAGC
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GTGTACAGGAGGGCCATAGCTAATGGCATTGTAGAGATACTGTCTATTTATAGATCTGCTGTGCTTCATGTGGAGCAGAAACTGTTGTCTGAAACGGTGCCGATTTTGGC
AATAGTCACCCAGGGCCTCGATAAGTTCTTTGTTCTTTTTCCACCTCTGCACCAACTCATTCGTGAGATTGAGCGTGATGATATTCGAGGTGGCCAGCTACTTAATCTTC
TACACAAACGTTGTCACTGTGGCGTGCCTGAATTGCAAACTTGCATTCAAAGGCTCCTTTGGCATGGTCATCAGGTAATGTACAATCAACTAGCATCATGGATGGTTTAT
GGGCTTCTTCAAGATAAGCATGGAGAATTTTTCATCAGAAGGCAAGATGACAGGGAGACTAATCAAGGCTCATCCGTACAAGATATGTCAGAGAAGTTAGGACGCTTGTC
AACTGATGAATCTTTGACTGATTGGCACTTGGGATTTCACATTTATCTGGTACATTCATTGCCACGCCTTCTACCAATATTTACTGGTTTTTTTCCTGGTTAG
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GCCTCTTTTGGTGAACAACCGCCACCAGCTTTGTTTTCTTTTATTTCGACCATTTGGGCATGTTCCAGCAAGTGTTCAAGTCCATTTTGTGGTTATCATAGAGTTCTGTA
ATTCCAAAGAGAGCAAAAATGTTACACGAACTTCTGCTTGCTCTACTGGGTTACACCGGCGATCTGATAATCGATGAAAGAGAGCACTACAATTCCCTAGGGTTAGATAA
CTTACTTGTTGATGCCCCCATTTCTGGCGAACCCACGTTCAAGCTCGCCTCTGATATTTCCTTTCTTGAACCGAGCGAAAGGGATCTAATTCAGAGGATCATTGTGTTAG
GATTTTACTACAGAGAGCTTGATCGTTTTGCTACAAAGTCTAGGAATTTGAGTTGGATTCGTTCAGGTAATGAGTCTTCTTTAGCCAATTCGACGGAGTCGTCTAAAGAT
AAAATCGAAAACCCTAGTGTGTACAGGAGGGCCATAGCTAATGGCATTGTAGAGATACTGTCTATTTATAGATCTGCTGTGCTTCATGTGGAGCAGAAACTGTTGTCTGA
AACGGTGCCGATTTTGGCAATAGTCACCCAGGGCCTCGATAAGTTCTTTGTTCTTTTTCCACCTCTGCACCAACTCATTCGTGAGATTGAGCGTGATGATATTCGAGGTG
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GCATCATGGATGGTTTATGGGCTTCTTCAAGATAAGCATGGAGAATTTTTCATCAGAAGGCAAGATGACAGGGAGACTAATCAAGGCTCATCCGTACAAGATATGTCAGA
GAAGTTAGGACGCTTGTCAACTGATGAATCTTTGACTGATTGGCACTTGGGATTTCACATTTATCTGGTACATTCATTGCCACGCCTTCTACCAATATTTACTGGTTTTT
TTCCTGGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VYRRAIANGIVEILSIYRSAVLHVEQKLLSETVPILAIVTQGLDKFFVLFPPLHQLIREIERDDIRGGQLLNLLHKRCHCGVPELQTCIQRLLWHGHQVMYNQLASWMVY
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