CuGenDBv2

Gene ID	CSPI01G31190
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Tubulin beta chain
Genome location	Chr1:25710182..25713831
RNA-Seq Expression	CSPI01G31190
Synteny	CSPI01G31190
Gene Ontology terms	GO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process) GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process) GO:0009409 - response to cold (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005874 - microtubule (cellular component) GO:0005525 - GTP binding (molecular function) GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function) GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily IPR023123 - Tubulin, C-terminal IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain IPR017975 - Tubulin, conserved site IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain IPR002453 - Beta tubulin IPR000217 - Tubulin

Homology

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AT5G23860.2 tubulin beta 8

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AT5G62690.1 tubulin beta chain 2

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AT5G62700.1 tubulin beta chain 3

2.8e-252

94.8

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        MREILH+QGGQCGNQIG+KFWEV+C EHGIDPTGRYTG SDLQLER+NVYYNEASCGR+VPRAVLMDLEPGTMDS+R+GPYGQ FRPDNFVFGQSGAGNN
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        WAKGHYTEGAELID+VLDVVRKEAENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRM+LTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECM
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        VLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQ YR+LTVPELTQQMWDSKNMM
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        CAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKS+VCDI P GL MASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTG
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA DEE +YE+EEE
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Sequences

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AGCTTTGGGGACCTCAACCATTTAATTTCTGCTACAATGAGTGGTGTGACATGCTGTCTCAGATTTCCTGGCCAGCTCAACTCCGACCTCAGAAAACTCGCTGTCAATTT
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CATCGGAAACTCAACCTCCATTCAGGAAATGTTCAGGCGTGTAAGTGAGCAGTTCACAGCCATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGAGAAGGAATGG
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GAAGAAATTCCCGAACATGAGTAA

mRNA sequence

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AATTCAACAAAGATTTGACCTTACACCCTTTGATGGCCAAATCCTTACCCTCTCCATCTTACTTCAAAATTCTTATATAAACCACCATCACTCTCACTTCTCAATTCACT
CTCTTCTCTACTCCCAATCACCTGACTTGCCTCTTACTCCACCGCCTGGTTCCGCCCCAACTTCCCCGGGTAAAGATGAGGGAGATTCTCCACGTTCAAGGAGGTCAGTG
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GCAGATGAGTGCATGGTGCTGGACAATGAAGCATTATATGATATTTGCTTCAGGACTCTCAAGTTAACTACTCCTAGCTTTGGGGACCTCAACCATTTAATTTCTGCTAC
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TGAGTGGATTCCAAACAATGTCAAATCCAGCGTTTGTGACATTGCTCCTAAAGGACTTTCCATGGCATCAACCTTCATCGGAAACTCAACCTCCATTCAGGAAATGTTCA
GGCGTGTAAGTGAGCAGTTCACAGCCATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGAGAAGGAATGGACGAAATGGAGTTCACTGAAGCAGAAAGCAACATG
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GTGAGTAATCTATAGTGTATGATGCTGCTGCCTATATATATCTATATATATATGTGGTATTAGTGTTTATTGTGGGCGTTTCCTTTTTTCTCTTCTCACATGTTGTGTCA
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Protein sequence

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ELIDAVLDVVRKEAENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMLLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTP
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INVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIAPKGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADDEEYNYEEE
EEIPEHE

CSPI01G31190 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome