| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004139072.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis sativus] | 6.0e-149 | 99.3 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSP PVRGRSLSRSRSRSKSV RSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_008450302.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis melo] | 1.7e-135 | 92.47 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSP PVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_008450303.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Cucumis melo] | 3.1e-137 | 93.75 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDRPDSR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSP PVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_038879567.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Benincasa hispida] | 1.6e-130 | 90.75 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGR HDRRRSPP RSPRYSRSPAQR RYSRSP PRHAR+RSRSYDYAS PPKQ+AYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
PDSRERSFPRQ+SRGR SRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSP PVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSPR SPRH EEYRSEPNGDRSPSQ
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| XP_038879568.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Benincasa hispida] | 3.0e-132 | 92.01 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR HDRRRSPP RSPRYSRSPAQR RYSRSP PRHAR+RSRSYDYAS PPKQ+AYSRS+SPRDRPDSR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
ERSFPRQ+SRGR SRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSP PVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSPR SPRH EEYRSEPNGDRSPSQ
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LZX6 RRM domain-containing protein | 2.9e-149 | 99.3 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSP PVRGRSLSRSRSRSKSV RSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A1S3BNX5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 | 8.2e-136 | 92.47 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSP PVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A1S3BPL2 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 1.5e-137 | 93.75 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDRPDSR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSP---PRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSP PVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A6J1DH06 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 | 1.1e-121 | 84.69 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
Query: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPR
GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGR+HDRRRSPP RSPRYSRSPA R RYSRSPAPRHARSRSRSYDY S PPKQRA SRS+SPR
Subjt: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPR
Query: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSP + GSRS P RGRS SRS SRSRSPRRSPRHEEEYRS+PNGDRSPSQ
Subjt: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| A0A6J1DIJ4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 2.1e-123 | 85.86 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
Query: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPD
GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSPP RSPRYSRSPA R RYSRSPAPRHARSRSRSYDY S PPKQRA SRS+SPRDR D
Subjt: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPP---RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPD
Query: SRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
SRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSP + GSRS P RGRS SRS SRSRSPRRSPRHEEEYRS+PNGDRSPSQ
Subjt: SRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 4.6e-27 | 42.06 | Show/hide |
Query: TSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDR
TSL VRN++ D R EDLRR FG++G I D+Y+P D+YT PRGF +VQ+ D DA DA H++D + GR++ + FA+ +RK P+ M+A+E
Subjt: TSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDR
Query: RRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYA-------SQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRS-PRLD---GSRSRS
R+ S RY RR R SRS R +RSRS Y+Y S+P + SRS S DR R RSF R +S RS S+S P+ + SRSRS
Subjt: RRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYA-------SQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRS-PRLD---GSRSRS
Query: QSPT--------------QPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRS
S T + GSR R + RS+S+S+S SRSRS+SRS
Subjt: QSPT--------------QPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRS
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 5.8e-30 | 42.69 | Show/hide |
Query: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
R RSY+P SPPR GY P R P+ LL+RNL D RP DLR F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y DAA+A
Subjt: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
Query: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
M+ V+ GRE+ +VFAEENRK P +MR SGR+ D +R+ RSPR R SRSP R +R S+ R D S + R+ SRS PR+
Subjt: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
Query: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKS
+ + R+ RSPR + R P+R R LSRSRSRS S
Subjt: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 4.2e-28 | 39.22 | Show/hide |
Query: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
R Y+P SPP RGYG RGRSP P G GR SLLVRN+ DCRPE+LR PF +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD DA
Subjt: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
Query: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSP
+A+ M+ GRE+TVV A E+RK+P +MR + R R + S RS SRS + R R R P+ +R RSRSY
Subjt: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSP
Query: RDRPDSRERSFPRQESRGRSYSR---SPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSR--SRSRSRSPRRSPR
P R R P + +YSR SP +G+ + + + G G R ++VSR S SRSRS SPR
Subjt: RDRPDSRERSFPRQESRGRSYSR---SPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSR--SRSRSRSPRRSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 2.0e-75 | 62.5 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+ G R DLPTSLLVRNL HDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
Query: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG S R+ DRRRSP PRYSRSP RRGR S RSRSR Y + PP +R SRS+SP+DR +
Subjt: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
E RSYSRSP +GSR RS SP + S S P RS+S ++RS + ++RS+S PR+S R NGDRSPSQ
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 2.9e-82 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GR+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS P RS+SRS RS+S S R+RS SPRRS R Y EP RS S
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.1e-83 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GR+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS P RS+SRS RS+S S R+RS SPRRS R Y EP RS S
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSEPNGDRSPS
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 1.1e-79 | 69.46 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GR+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSRERS
Query: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVR
R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS P +
Subjt: FPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVR
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 2.4e-79 | 61.69 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDPA
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG +PRGFGFVQ++DPA
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDPA
Query: DAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRS
DAADAKHHMDG +LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG G R+ DRRR+PPR YSR SRSP PR RSRSRS DY S PP+ R + RS
Subjt: DAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRS
Query: LSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSE
+SPR+ R + R RSYSRSP DGSR RS +P + SRS P RS+SRS RS+S S R+RS SPRRS R Y E
Subjt: LSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRS-----------PRHEEEYRSE
Query: PNGDRSPS
P RS S
Subjt: PNGDRSPS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.5e-76 | 62.5 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+ G R DLPTSLLVRNL HDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
Query: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG S R+ DRRRSP PRYSRSP RRGR S RSRSR Y + PP +R SRS+SP+DR +
Subjt: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRDRPDSR
Query: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
E RSYSRSP +GSR RS SP + S S P RS+S ++RS + ++RS+S PR+S R NGDRSPSQ
Subjt: ERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSRSPRRSPRHEEEYRSEPNGDRSPSQ
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 4.1e-31 | 42.69 | Show/hide |
Query: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
R RSY+P SPPR GY P R P+ LL+RNL D RP DLR F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y DAA+A
Subjt: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
Query: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
M+ V+ GRE+ +VFAEENRK P +MR SGR+ D +R+ RSPR R SRSP R +R S+ R D S + R+ SRS PR+
Subjt: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRYHDRRRSPPRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHAR-SRSRSYDYASQPPKQRAYSRSLSPRD
Query: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKS
+ + R+ RSPR + R P+R R LSRSRSRS S
Subjt: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPTQPGSRSPIPVRGRSLSRSRSRSKS
|
|
