; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G32620 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G32620
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionReverse transcriptase
Genome locationChr1:27479107..27480157
RNA-Seq ExpressionCSPI01G32620
SyntenyCSPI01G32620
Gene Ontology termsGO:0006486 - protein glycosylation (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0097359 - UDP-glucosylation (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0003980 - UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase activity (molecular function)
GO:0004175 - endopeptidase activity (molecular function)
GO:0004518 - nuclease activity (molecular function)
GO:0008236 - serine-type peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001584 - Integrase, catalytic core
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR036397 - Ribonuclease H superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAA7014963.1 unnamed protein product [Microthlaspi erraticum]3.3e-6952.67Show/hide
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        +ICQ+S G S N GLY PLP+P +IW+DL MDFVLGLPRTQ G D + VVVDRF KM HF+ACKKT DA N+A LFFRE+VRLH +PK+I+SDRD KF+S
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        +FW +LW+ F T+L  SST+HPQTDGQ EVTNRTLGN++  + GD+P Q DL L Q EF++N+  + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +S  
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        A  MA  I    E V+  LEA    T  K     DK                L+ E F VGT
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CAA7021913.1 unnamed protein product [Microthlaspi erraticum]1.5e-6954.96Show/hide
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        +ICQ S G S N GLY PLPIP +IW+DL MDFVLGLPRTQ G D + VVVDRF KM HF+AC+KT DA N+A LFFREIVRLH +PKSIVSDRD KF+S
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        +FW +LW+ F TSL  SST+HPQ+DGQ EVTNRTLGN++  + GDKP Q DL L Q EF++N   + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +SA 
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        A  MA  I +  E VR  LEA    T  K     DK                L+ E F VGT
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CAA7028195.1 unnamed protein product [Microthlaspi erraticum]3.3e-6952.67Show/hide
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        +ICQ+S G S N GLY PLP+P +IW+DL MDFVLGLPRTQ G D + VVVDRF KM HF+ACKKT DA N+A LFFRE+VRLH +PK+I+SDRD KF+S
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        +FW +LW+ F T+L  SST+HPQTDGQ EVTNRTLGN++  + GD+P Q DL L Q EF++N+  + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +S  
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        A  MA  I    E V+  LEA    T  K     DK                L+ E F VGT
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XP_040361711.1 uncharacterized protein LOC112168385 [Rosa chinensis]1.5e-6953.05Show/hide
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        + CQ S G S N GLY PLP+P +IW+DL MDFVLGLPRTQ G D + VVVDRF KMVHF+ACKKT DA N+A LFFRE+VRLH +PKSI SDRD KF+S
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        +FW +LW+ F TSL  SST+HPQTDGQ EVTNRTLGN++  + GD+P Q D  L Q EF++N+  + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +S  
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        A  MA  ++ + +EV+  LEA    TN K     DK                L+ E F VGT
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XP_040362965.1 uncharacterized protein LOC121049498 [Rosa chinensis]1.9e-6953.05Show/hide
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        + CQ S G S N GLY PLP+P +IW+DL MDFVLGLPRTQ G D + VVVDRF KMVHF+ACKKT DA N+A LFFRE+VRLH +PKSI SDRD KF+S
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        +FW +LW+ F TSL  SST+HPQTDGQ EVTNRTLGN++  + GD+P Q D  L Q EF++N+  + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +S  
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        A  MA  ++ + +EV+  LEA    TN K     DK                L+ E F VGT
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5B7BER3 Uncharacterized protein2.0e-7261.64Show/hide
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        ICQ++ G + N GLY PLP+P +IW+DL MDF+LGLPRTQ G D + VVVDRF KM HF+ CKKT+DA +VANLFFREIVRLH +PKSI SDRDVKF+S+
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Query:  FWCSLWKRFSTSLLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEIVQTQVPRRTLDVAHLPVPFDLSAEA
        FW +LW++F TSL +SST+HPQTDGQ EVTNRTLGN++    GD+P Q D+ L Q EF++N MTN+ST K+PFEIV T+ P++ LD+A LP     S  A
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Query:  TLMANRIKKIHEEVRQPLE
           A+R   I EEV+Q LE
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A0A6D2HLB5 Reverse transcriptase1.6e-6952.67Show/hide
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        +ICQ+S G S N GLY PLP+P +IW+DL MDFVLGLPRTQ G D + VVVDRF KM HF+ACKKT DA N+A LFFRE+VRLH +PK+I+SDRD KF+S
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        +FW +LW+ F T+L  SST+HPQTDGQ EVTNRTLGN++  + GD+P Q DL L Q EF++N+  + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +S  
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        A  MA  I    E V+  LEA    T  K     DK                L+ E F VGT
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A0A6D2I9U6 Uncharacterized protein7.2e-7054.96Show/hide
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        +ICQ S G S N GLY PLPIP +IW+DL MDFVLGLPRTQ G D + VVVDRF KM HF+AC+KT DA N+A LFFREIVRLH +PKSIVSDRD KF+S
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        +FW +LW+ F TSL  SST+HPQ+DGQ EVTNRTLGN++  + GDKP Q DL L Q EF++N   + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +SA 
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Query:  ATLMANRIKKIHEEVRQPLEASMLPTNLKRTYIVDK--------------PLLKSENFKVGT
        A  MA  I +  E VR  LEA    T  K     DK                L+ E F VGT
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A0A6D2IKM3 Reverse transcriptase1.6e-6952.67Show/hide
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        +FW +LW+ F T+L  SST+HPQTDGQ EVTNRTLGN++  + GD+P Q DL L Q EF++N+  + +T KSPF +V T VP+  +D+  LP    +S  
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Query:  ATLMANRIKKIHEEVRQPLEASMLPTNLKRTYIVDK--------------PLLKSENFKVGT
        A  MA  I    E V+  LEA    T  K     DK                L+ E F VGT
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A0A6N2LVR1 Uncharacterized protein6.3e-7461.36Show/hide
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        CQ+S G + N GLY PLPIP   W+DL MDF+LGLPRTQ G D + VVVDRF KM HF+ACKKT+DA++VANLFF+E+VRLH +PKSI SDRD KF+S+F
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        W +LW+RF T+L FSSTSHPQTDGQ EV NRTLGN++  L G++P Q DL LAQAEF++N+M N+ST K+PF++V  Q P+  LD+  LP    ++  A 
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Query:  LMANRIKKIHEEVRQPLEAS
         MA+R++ I EEVR+ LEAS
Subjt:  LMANRIKKIHEEVRQPLEAS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein1.5e-2431.3Show/hide
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        H CQ +   S N   Y PL PIPP+   W+ L MDF+  LP +  GY+ + VVVDRF KM   + C K+  A   A +F + ++     PK I++D D  
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Query:  FMSYFWCSLWKRFSTSLLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEIVQTQVPRRTLDVAHLPVPFDL
        F S  W     +++  + FS    PQTDGQ E TN+T+  +L  +    P+    +++  + S+NN  + +T  +PFEIV    P   L    LP   D 
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Query:  SAEATLMANRIKKIHEEVRQPLEASMLPTNLKRTYIVDKPLLKSENFKVGTECLPDRSSSNY
        + E     N  + I  +V Q ++  +   N+K     D  + + E F+ G   +  R+ + +
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P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein1.5e-2431.3Show/hide
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        H CQ +   S N   Y PL PIPP+   W+ L MDF+  LP +  GY+ + VVVDRF KM   + C K+  A   A +F + ++     PK I++D D  
Subjt:  HICQSSNGSSSNLGLYCPL-PIPPN--IWKDLFMDFVLGLPRTQCGYDPILVVVDRFRKMVHFLACKKTNDALNVANLFFREIVRLHKIPKSIVSDRDVK

Query:  FMSYFWCSLWKRFSTSLLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEIVQTQVPRRTLDVAHLPVPFDL
        F S  W     +++  + FS    PQTDGQ E TN+T+  +L  +    P+    +++  + S+NN  + +T  +PFEIV    P   L    LP   D 
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Query:  SAEATLMANRIKKIHEEVRQPLEASMLPTNLKRTYIVDKPLLKSENFKVGTECLPDRSSSNY
        + E     N  + I  +V Q ++  +   N+K     D  + + E F+ G   +  R+ + +
Subjt:  SAEATLMANRIKKIHEEVRQPLEASMLPTNLKRTYIVDKPLLKSENFKVGTECLPDRSSSNY

Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein2.0e-2944.17Show/hide
Query:  GLYCPLPIPPNIWKDLFMDFVLGLPRTQCGYDPILVVVDRFRKMVHFLACKKTNDALNVANLFFREIVRLHKIPKSIVSDRDVKFMSYFWCSLWKRFSTS
        GL  PLPI    W D+ MDFV GLP T    + ILVVVDRF K  HF+A +KT DA  + +L FR I   H  P++I SDRDV+  +  +  L KR    
Subjt:  GLYCPLPIPPNIWKDLFMDFVLGLPRTQCGYDPILVVVDRFRKMVHFLACKKTNDALNVANLFFREIVRLHKIPKSIVSDRDVKFMSYFWCSLWKRFSTS

Query:  LLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEI
           SS +HPQTDGQ E T +TL  +L            + L Q EF +N+   ++  KSPFEI
Subjt:  LLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEI

Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein9.2e-3044.17Show/hide
Query:  GLYCPLPIPPNIWKDLFMDFVLGLPRTQCGYDPILVVVDRFRKMVHFLACKKTNDALNVANLFFREIVRLHKIPKSIVSDRDVKFMSYFWCSLWKRFSTS
        GL  PLPI    W D+ MDFV GLP T    + ILVVVDRF K  HF+A +KT DA  + +L FR I   H  P++I SDRDV+  +  +  L KR    
Subjt:  GLYCPLPIPPNIWKDLFMDFVLGLPRTQCGYDPILVVVDRFRKMVHFLACKKTNDALNVANLFFREIVRLHKIPKSIVSDRDVKFMSYFWCSLWKRFSTS

Query:  LLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEI
           SS +HPQTDGQ E T +TL  +L            + L Q EF +N+   ++  KSPFEI
Subjt:  LLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEI

Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein1.5e-2431.3Show/hide
Query:  HICQSSNGSSSNLGLYCPL-PIPPN--IWKDLFMDFVLGLPRTQCGYDPILVVVDRFRKMVHFLACKKTNDALNVANLFFREIVRLHKIPKSIVSDRDVK
        H CQ +   S N   Y PL PIPP+   W+ L MDF+  LP +  GY+ + VVVDRF KM   + C K+  A   A +F + ++     PK I++D D  
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Query:  FMSYFWCSLWKRFSTSLLFSSTSHPQTDGQIEVTNRTLGNILHYLGGDKPHQGDLNLAQAEFSFNNMTNQSTYKSPFEIVQTQVPRRTLDVAHLPVPFDL
        F S  W     +++  + FS    PQTDGQ E TN+T+  +L  +    P+    +++  + S+NN  + +T  +PFEIV    P   L    LP   D 
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Query:  SAEATLMANRIKKIHEEVRQPLEASMLPTNLKRTYIVDKPLLKSENFKVGTECLPDRSSSNY
        + E     N  + I  +V Q ++  +   N+K     D  + + E F+ G   +  R+ + +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTCATATATGCCAAAGCTCTAATGGATCTAGTTCAAACCTGGGCCTTTATTGTCCACTACCTATTCCCCCTAACATTTGGAAAGACCTCTTTATGGATTTTGTTCT
TGGCTTACCTAGAACCCAATGTGGTTATGATCCTATTTTGGTAGTCGTTGATCGATTTAGGAAAATGGTGCACTTTTTAGCTTGTAAAAAGACTAATGATGCTTTGAATG
TTGCTAATCTTTTTTTTAGGGAAATTGTTCGCTTACACAAGATACCTAAGAGCATTGTTTCGGATCGGGATGTCAAATTCATGAGCTACTTTTGGTGCTCCCTATGGAAA
AGATTCAGCACTAGCCTCCTATTTAGCTCTACCAGCCACCCCCAAACAGACGGCCAAATTGAAGTGACCAACCGAACACTTGGCAACATCCTTCACTACCTAGGTGGAGA
CAAACCCCACCAAGGAGATCTCAACCTTGCTCAAGCAGAATTTTCCTTCAACAACATGACCAACCAATCCACATACAAATCCCCTTTTGAAATTGTCCAGACCCAAGTCC
CTCGCCGCACTCTTGATGTTGCACACTTGCCTGTTCCTTTTGATCTTAGTGCTGAAGCAACTCTCATGGCTAACCGAATCAAAAAAATCCATGAAGAAGTCCGCCAACCC
TTAGAAGCTTCCATGCTTCCTACAAACTTAAAGCGGACATACATTGTAGACAAACCACTTTTGAAGTCAGAGAACTTCAAAGTTGGGACCGAATGCCTACCAGATAGATC
TTCCTCCAACTATGAAGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAAATAACTCCTTATGCATCGCACACACTTCCCTTCGAGAATCCCTTCTAAAAGAAGCTCATAGTAGTGGTTTGTCCGGCCACTCTGGTAGAGACAAAACCTTCACCC
TATTCACTCAAAAATTCTTTTGGCCACAACTAAAGAAAGATATTGCTAATTTTGTTAAAAGATGCTTCATATATGCCAAAGCTCTAATGGATCTAGTTCAAACCTGGGCC
TTTATTGTCCACTACCTATTCCCCCTAACATTTGGAAAGACCTCTTTATGGATTTTGTTCTTGGCTTACCTAGAACCCAATGTGGTTATGATCCTATTTTGGTAGTCGTT
GATCGATTTAGGAAAATGGTGCACTTTTTAGCTTGTAAAAAGACTAATGATGCTTTGAATGTTGCTAATCTTTTTTTTAGGGAAATTGTTCGCTTACACAAGATACCTAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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