; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G33650 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G33650
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionmultisubstrate pseudouridine synthase 7
Genome locationChr1:28619856..28627103
RNA-Seq ExpressionCSPI01G33650
SyntenyCSPI01G33650
Gene Ontology termsGO:0001522 - pseudouridine synthesis (biological process)
GO:0008033 - tRNA processing (biological process)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0009982 - pseudouridine synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001656 - Pseudouridine synthase, TruD
IPR011760 - Pseudouridine synthase, TruD, insertion domain
IPR020103 - Pseudouridine synthase, catalytic domain superfamily
IPR042214 - Pseudouridine synthase, TruD, catalytic domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8637486.1 hypothetical protein CSA_016968 [Cucumis sativus]1.8e-14591.41Show/hide
Query:  MEVPLSNGRFTWSSEGEVISKSLIDRFLVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLK-IRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGE---------
        MEVPLSNGRFTWSSEGEVISKSLIDRFLVSNKWEEAFEKRKAFS SSLSAVMLK +RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG+         
Subjt:  MEVPLSNGRFTWSSEGEVISKSLIDRFLVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLK-IRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGE---------

Query:  ------TNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCK
                 ++ ARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCK
Subjt:  ------TNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCK

Query:  ENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        ENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
Subjt:  ENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

XP_008462716.1 PREDICTED: pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 [Cucumis melo]3.0e-12182.12Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF      +V+N  +      +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKAR+YY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGDANSYDSCHLEE+CKLGLPTER+KLVKAVTA DVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYP NDIAEVYNDLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

XP_008462718.1 PREDICTED: pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X2 [Cucumis melo]3.0e-12182.12Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF      +V+N  +      +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKAR+YY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGDANSYDSCHLEE+CKLGLPTER+KLVKAVTA DVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYP NDIAEVYNDLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

XP_011660284.1 LOW QUALITY PROTEIN: pseudouridylate synthase 7 homolog [Cucumis sativus]3.8e-12483.94Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF      +V+N  +      +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

XP_031745921.1 multisubstrate pseudouridine synthase 7-like, partial [Cucumis sativus]3.8e-12483.94Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF      +V+N  +      +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LY46 TRUD domain-containing protein1.8e-11994.35Show/hide
Query:  KIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAK-----ARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRM
        K RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG+   + +     ARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRM
Subjt:  KIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAK-----ARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRM

Query:  MYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDD
        MYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDD
Subjt:  MYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDD

Query:  VVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATKVLY
        VVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATKVLY
Subjt:  VVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATKVLY

A0A1S3CHJ1 pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X11.5e-12182.12Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF      +V+N  +      +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKAR+YY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGDANSYDSCHLEE+CKLGLPTER+KLVKAVTA DVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYP NDIAEVYNDLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

A0A1S3CI40 pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X21.5e-12182.12Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF      +V+N  +      +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKAR+YY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGDANSYDSCHLEE+CKLGLPTER+KLVKAVTA DVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYP NDIAEVYNDLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

A0A5A7V3D9 Pseudouridylate synthase 7-like protein isoform X12.2e-11779.56Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF      +V+N  +      +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG+   + +AR+YY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRF------LVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGDANSYDSCHLEE+CKLGLPTER+KLVKAVTA DVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYP NDIAEVYNDLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

A0A6J1DY30 pseudouridylate synthase 7 homolog1.2e-11277.74Show/hide
Query:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRFLVSNKW-----EEAFE-KRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY
        G F++  EG ++ + L +RF ++ +      E+A +   +A             RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAV+MILDPREGETN IAKARDYY
Subjt:  GRFTWSSEGEVISKSLIDRFLVSNKW-----EEAFE-KRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYY

Query:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED
        KES+DIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTET AVQ S EYED
Subjt:  KESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYED

Query:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        EDCGD NSYDSCHLEE+CKL LPTER+KLVKAVTA D+LSG FTIDDV+LPLPGSRV+YPTNDIA+VY+DLATK
Subjt:  EDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O74343 Multisubstrate pseudouridine synthase 73.2e-3337.9Show/hide
Query:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPG--NYLQALKAIPRTLRMMYVHS
        RFG+ SV TH +G  LL+ +WKGAV++IL PR   T  + +A D +  + D + +L+ LPR ++AE +IL+   +     +YL A + IPR LR +Y H+
Subjt:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPG--NYLQALKAIPRTLRMMYVHS

Query:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL
        YQSY+WN  AS R++  G D+ VVGDLVY     TE+  +       D +  D        LE+     LP       + +   +V   NF+I D+VLPL
Subjt:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL

Query:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDL
        PG  V+YP N+  ++Y  +
Subjt:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDL

Q08647 Multisubstrate pseudouridine synthase 78.2e-2937Show/hide
Query:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCL----KKCPGNYLQ-----ALKAIPRTL
        RFG+ S+ TH +G  LL   WK A  +IL  ++    +  +AR  + E+ D    LKQ+PR  +AE A+L  L    K+  G Y +     A+  IPR L
Subjt:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCL----KKCPGNYLQ-----ALKAIPRTL

Query:  RMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTI
        R MYVH+YQSY+WN  AS R++ +G+ K+VVGDLV      +   +  + E++ DED  +A    +                   KAVT  D+ S  +T+
Subjt:  RMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTI

Query:  DDVVLPLPGSRVLYPTN-DIAEVYNDL
        +DVVLP PG  VLYP+N ++ ++Y D+
Subjt:  DDVVLPLPGSRVLYPTN-DIAEVYNDL

Q08DI8 Pseudouridylate synthase 7 homolog8.8e-2333.94Show/hide
Query:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG-ETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKC-PGNYLQALKAIPRTLRMMYVHS
        RFG+ +VPT+ VG ++L+  W   +++IL PR G E   + K R+ + +S D    L++LP     E  +L+ L K    N + A   IPR  R+MY+HS
Subjt:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG-ETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKC-PGNYLQALKAIPRTLRMMYVHS

Query:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL
        YQSY+WN+  S R+ +YG+ K V GDLV   +  T T        + +ED  D N                                  N++I DVV+PL
Subjt:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL

Query:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDLAT
        PG  V+YP + I+E Y ++ T
Subjt:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDLAT

Q91VU7 Pseudouridylate synthase 7 homolog7.4e-2232.88Show/hide
Query:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG-ETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKC-PGNYLQALKAIPRTLRMMYVHS
        RFG+ +VPT+ VG ++L+  W   +++IL PR G E   + K R+ + ++ D    LK+LP     E  +L+ L +    N + A   IPR  R+MY+HS
Subjt:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG-ETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKC-PGNYLQALKAIPRTLRMMYVHS

Query:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL
        YQSY+WN   S R+++YG+ + V GDLV   +  T T        Y +ED  D                                    N++I DVV+PL
Subjt:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL

Query:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDL
        PG  V+YP + I+E Y ++
Subjt:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDL

Q96PZ0 Pseudouridylate synthase 7 homolog8.8e-2333.94Show/hide
Query:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG-ETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKC-PGNYLQALKAIPRTLRMMYVHS
        RFG+ +VPT+ VG ++L+  W   +++IL PR G E   + K R+ + ++ D    L++LP     E  +L+ L K    N + A   IPR  R+MY+HS
Subjt:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREG-ETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKC-PGNYLQALKAIPRTLRMMYVHS

Query:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL
        YQSY+WN+  S R++ YG+ K V GDLV   +  T T        Y +ED  D N                                  N++I DVV+PL
Subjt:  YQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPL

Query:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDLAT
        PG  V+YP + I E Y ++ T
Subjt:  PGSRVLYPTNDIAEVYNDLAT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G04820.1 Pseudouridine synthase family protein2.9e-7461.82Show/hide
Query:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQ
        RFGSGSVPTH VGA+LL+GEWK AV+MILDPRE E + +  AR+YYKE+ DIDGTL+QLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALK IPRTLRMMYVHSYQ
Subjt:  RFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYYKESDDIDGTLKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQ

Query:  SYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPG
        SYLWN+AAS+RV+ YG  +VV+GDLV  K +  +      + E+ +       + D   +++   + LP ER  LVK V+  D+ +G ++  D+VLPLPG
Subjt:  SYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCKLGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPG

Query:  SRVLYPTNDIAEVYNDLATK
        SRV+YP+NDIAE+Y+DLA K
Subjt:  SRVLYPTNDIAEVYNDLATK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTCCTCTTTCAAACGGCCGATTCACTTGGTCAAGTGAAGGAGAAGTAATCTCTAAATCTCTTATTGACAGATTTCTGGTTTCTAACAAGTGGGAGGAAGCTTT
TGAGAAGAGGAAGGCATTCAGTATCTCCTCTTTGAGTGCAGTTATGCTCAAAATTCGTTTTGGCAGTGGTTCTGTACCGACTCATCTTGTTGGAGCTTCACTTCTTAGAG
GAGAGTGGAAGGGTGCTGTCAATATGATTCTTGATCCAAGAGAAGGGGAAACCAATGAAATTGCAAAGGCAAGAGACTACTACAAGGAAAGTGATGATATTGATGGAACG
TTGAAGCAATTACCTCGATATTTAGTGGCTGAAAGAGCAATACTACAATGTTTGAAGAAATGTCCTGGGAACTATTTGCAGGCTCTTAAAGCTATACCTAGAACTTTGAG
AATGATGTACGTGCATAGTTACCAAAGCTATTTATGGAATCATGCAGCAAGTATGAGAGTGCAAAAATACGGGATTGACAAAGTGGTTGTTGGAGACTTGGTATACTGTA
AAGAAAACCACACTGAAACAGCTGCAGTGCAAAATTCTGAAGAATATGAAGACGAGGACTGTGGCGATGCTAATTCATACGACTCTTGTCATTTAGAAGAAGTGTGCAAG
CTTGGTCTTCCAACTGAAAGACATAAGCTAGTGAAGGCTGTTACTGCTGGAGATGTCCTCAGTGGAAACTTTACTATTGATGATGTTGTTCTTCCTTTGCCTGGATCAAG
AGTACTCTATCCCACAAATGATATTGCTGAAGTGTATAACGATTTAGCGACTAAGGTCCTTTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGTTCCTCTTTCAAACGGCCGATTCACTTGGTCAAGTGAAGGAGAAGTAATCTCTAAATCTCTTATTGACAGATTTCTGGTTTCTAACAAGTGGGAGGAAGCTTT
TGAGAAGAGGAAGGCATTCAGTATCTCCTCTTTGAGTGCAGTTATGCTCAAAATTCGTTTTGGCAGTGGTTCTGTACCGACTCATCTTGTTGGAGCTTCACTTCTTAGAG
GAGAGTGGAAGGGTGCTGTCAATATGATTCTTGATCCAAGAGAAGGGGAAACCAATGAAATTGCAAAGGCAAGAGACTACTACAAGGAAAGTGATGATATTGATGGAACG
TTGAAGCAATTACCTCGATATTTAGTGGCTGAAAGAGCAATACTACAATGTTTGAAGAAATGTCCTGGGAACTATTTGCAGGCTCTTAAAGCTATACCTAGAACTTTGAG
AATGATGTACGTGCATAGTTACCAAAGCTATTTATGGAATCATGCAGCAAGTATGAGAGTGCAAAAATACGGGATTGACAAAGTGGTTGTTGGAGACTTGGTATACTGTA
AAGAAAACCACACTGAAACAGCTGCAGTGCAAAATTCTGAAGAATATGAAGACGAGGACTGTGGCGATGCTAATTCATACGACTCTTGTCATTTAGAAGAAGTGTGCAAG
CTTGGTCTTCCAACTGAAAGACATAAGCTAGTGAAGGCTGTTACTGCTGGAGATGTCCTCAGTGGAAACTTTACTATTGATGATGTTGTTCTTCCTTTGCCTGGATCAAG
AGTACTCTATCCCACAAATGATATTGCTGAAGTGTATAACGATTTAGCGACTAAGGTCCTTTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEVPLSNGRFTWSSEGEVISKSLIDRFLVSNKWEEAFEKRKAFSISSLSAVMLKIRFGSGSVPTHLVGASLLRGEWKGAVNMILDPREGETNEIAKARDYYKESDDIDGT
LKQLPRYLVAERAILQCLKKCPGNYLQALKAIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASMRVQKYGIDKVVVGDLVYCKENHTETAAVQNSEEYEDEDCGDANSYDSCHLEEVCK
LGLPTERHKLVKAVTAGDVLSGNFTIDDVVLPLPGSRVLYPTNDIAEVYNDLATKVLY