; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI01G34560 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI01G34560
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationChr1:29528607..29532130
RNA-Seq ExpressionCSPI01G34560
SyntenyCSPI01G34560
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-14394.53Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLAD F+P+TSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRG+ST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GL+TFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLING VIFFAWL+ARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGY+LVFGVPT+LG+MNLMWF KIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

XP_008459089.1 PREDICTED: transmembrane protein 56-like [Cucumis melo]8.3e-14898.54Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKL+YDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWF KIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

XP_011660315.1 TLC domain-containing protein 4-B [Cucumis sativus]8.9e-150100Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

XP_023543000.1 transmembrane protein 56 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.1e-14394.89Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLAD F+P+TSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRG+ST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GL+TFQSS LSTFILGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLING VIFFAWL+ARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGY+LVFGVPTVLGMMNLMWF KIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]3.5e-14697.81Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLAD FVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLINGIVIFFAWL+ARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWF KIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein4.3e-150100Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like4.0e-14898.54Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKL+YDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWF KIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like4.0e-14898.54Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKL+YDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWF KIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like1.5e-14294.53Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLAD F+P+TSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRG+ST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GL+TFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI++LYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSV SGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLING VIFFAWL+ARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGY+LVFGVPTVLGMMNLMWF KIVKGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

A0A6J1KGK7 transmembrane protein 56-like1.5e-14294.16Show/hide
Query:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MAMSLKTVMAIKSYQSQADALV+NYLLAD  +P+TSVLGG+LACKLVYDLTQ+VSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
        SDQRH GLVTFQSSTLSTF+LGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHH+LSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA
Subjt:  SDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        YLING+VIFFAWL+ARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMH IGYLLVFGVPTVLGMMNLMWF KI KGLMKTISKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B6.9e-1226.01Show/hide
Query:  LTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVV
        L +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST +AI  S +S+Y +++++   +          +S +S FI      YF+ D  +  +    L     ++
Subjt:  LTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVV

Query:  HHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYL---HYDQVIKMHVIGYLLVF
        HHT++ L+  +    G           +EITTP IN+R++L    +K    Y+ING++IF  +++ R+     T + V     HY  +    +I + + F
Subjt:  HHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYL---HYDQVIKMHVIGYLLVF

Query:  GVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMK
          P +  ++NL W   I K + K
Subjt:  GVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMK

Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B4.5e-1123.33Show/hide
Query:  VLGGMLACKLVYD-LTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        V G  +  +L +  ++ ++S+ + + Y  L   +  +WN+R +ST HA+ + +  LY +++ D  ++        +    L    + I+ GY   DL L+
Subjt:  VLGGMLACKLVYD-LTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  VWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI-NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVY-LHYDQ
           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
Subjt:  VWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI-NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVY-LHYDQ

Query:  VIKMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMWFAKIVKGLMKTIS
          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
Subjt:  VIKMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMWFAKIVKGLMKTIS

Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B5.1e-1528.37Show/hide
Query:  LTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFS
        L+  Q++EWN+R +S+FHA+ +    LY + + D  +         +    +    + ++ GY ++DL LI++ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
Subjt:  LTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFS

Query:  GEGQL--YTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAG-MKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHY-DQVIKMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMW
        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ I RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
Subjt:  GEGQL--YTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAG-MKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHY-DQVIKMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMW

Query:  FAKIVKGLMKTISKR
          KI KG  K +  R
Subjt:  FAKIVKGLMKTISKR

Q8CGF5 TLC domain-containing protein 45.1e-1527.91Show/hide
Query:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
Subjt:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYS

Query:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNL
        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + I RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
Subjt:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNL

Query:  MWFAKIVKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
Subjt:  MWFAKIVKGLMKTIS

Q96MV1 TLC domain-containing protein 48.7e-1528.38Show/hide
Query:  FYFKSYLGLTKI----------QRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGME
        FYF SY    K+          +++EWN+R +ST H++ + I  LY   +     D+       +   +L+   + I+ GY ++DL +I+  +  +G   
Subjt:  FYFKSYLGLTKI----------QRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGME

Query:  YVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLIARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYL
        +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + I RI  +L  Y F +     +  I++ V+  L
Subjt:  YVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLIARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYL

Query:  LVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTIS
               VL +MN+MW  KI KG +K IS
Subjt:  LVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTIS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein9.2e-11371.96Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+P+TSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
Subjt:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ

Query:  RHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHH+LSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
Subjt:  RHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI

Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WF KIV+G+ KT++KR
Subjt:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein9.2e-11371.96Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+P+TSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
Subjt:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ

Query:  RHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHH+LSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
Subjt:  RHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI

Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WF KIV+G+ KT++KR
Subjt:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein8.5e-6650.42Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG STFHA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  VWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WL+AR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  VWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISK
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK
Subjt:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISK

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.8e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRH-PG
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+P+TSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRH-PG

Query:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        L  F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WF KIVKGL KT+ KR
Subjt:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.8e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRH-PG
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+P+TSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRH-PG

Query:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        L  F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WF KIVKGL KT+ KR
Subjt:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCATTTTGTCCCATTCACTTCTGT
ACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGGTTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATCTTGGTCTTACAAAAATTCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTTTTCATGCAATCTATATCTCAATCATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATCCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCCTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACACTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTTCTCATTTCAGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGTATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGATACACATTCTATCACGTTTACTTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTTGCAAAGATTGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCATTTTGTCCCATTCACTTCTGT
ACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGGTTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATCTTGGTCTTACAAAAATTCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTTTTCATGCAATCTATATCTCAATCATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATCCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCCTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACACTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTTCTCATTTCAGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGTATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGATACACATTCTATCACGTTTACTTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTTGCAAAGATTGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGACGAGATACGTTTTCTTCCTGTCGATATCTCTTCCCCTTCACCTTCTTGGTCTATT
TCTTAACATCTGCACATGGGTTGAGGAGGGAAAGGAATTTGATGATGGTATGTAGTGTGTTGTAAATGGTTCAAAATAACTTAAAACTTGTTGACATTTAGTCCTTTTCA
TCTTGTCAGATTTGTGTACCAATCCATTTTTTCTGTATAGTTCCTTTTTCTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR