; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G01040 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G01040
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionprotein SPEAR1
Genome locationChr2:674006..676358
RNA-Seq ExpressionCSPI02G01040
SyntenyCSPI02G01040
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR040356 - SPEAR family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008458547.1 PREDICTED: protein SPEAR1 [Cucumis melo]2.1e-10096.02Show/hide
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XP_023522169.1 protein SPEAR1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-6874.88Show/hide
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XP_038889470.1 protein SPEAR1-like [Benincasa hispida]1.3e-8486.73Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFV0 SPOROCYTELESS-like EAR-containing protein 18.1e-10698.51Show/hide
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A0A1S3C7M3 protein SPEAR11.0e-10096.02Show/hide
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A0A6J1G472 protein SPEAR1-like9.4e-6271.43Show/hide
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A0A6J1HQB1 protein SPEAR1-like5.0e-6370.59Show/hide
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                    GMGEYERGSFRYGDSQ TTT S+RW+ SNT +ETQHFG+PNM+GHL NP V DSM HKNMNTKYGSDS+GSSSQNSESSET ELDLEL
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A0A6J1KB48 protein SPEAR3-like isoform X12.4e-6575.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6IDB0 Protein SPEAR33.3e-2742.45Show/hide
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Q84X40 Protein SPEAR11.2e-2442.86Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20080.1 unknown protein8.2e-2642.86Show/hide
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AT2G20080.2 unknown protein9.7e-1935.92Show/hide
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AT4G28840.1 unknown protein2.3e-2842.45Show/hide
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           SSS  P  YGFH N M      +YER + RYGDSQ     S  W+PS   LE+QHF +PN + H          +H++      + S+GS  QN E+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAGATGAATAATATTGAAAAGAGGAGAAGTGGGTCGCCGTCGGCGGCTGGGGGGAGGAGAGGGCGGAAAGGAGGTGGCGGAGAGAAACC
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ATGATATGAGAATGCAAACAACAACAACACCTAATTTTTCTTACTCCTCAACTCATGAATCGTCTTCTTCATCTCCTAATTCCTATGGCTTCCATCAAAACTTTATGGGA
ATGGGAGAATATGAAAGAGGAAGCTTTAGATATGGTGATTCTCAACTAACAACAACTTCTTCTTTAAGATGGGACCCAAGTAATACATTTCTGGAGACCCAACATTTTGG
GCAACCAAACATGAGTGGACACCTTTTCAATCCTCATGTACAGGATTCAATGATTCACAAGAACATGAACACGAAATATGGGAGTGATTCAATGGGATCAAGCAGTCAGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTAATTTCTTTTTGGTTTAGTTTTGAATTTTTGGAATTAGAGATATATTCTATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAG
ATGAATAATATTGAAAAGAGGAGAAGTGGGTCGCCGTCGGCGGCTGGGGGGAGGAGAGGGCGGAAAGGAGGTGGCGGAGAGAAACCGAAGCAACCGCAGAGAGGGTTGGG
AGTTGCTCAGTTGGAGAAGATCAGATTGCATGGCGAAATGGGCTGTGCTGCTTATTCTCACTTCTATCCAAATCTCTCCGCCGGAGATGATATGAGAATGCAAACAACAA
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TTAGTCCTATTTGATGAATCATATCCCTCATGTTTTTAGAAATCAATATAGTTTCGAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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