; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G01760 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G01760
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDUF4050 family protein
Genome locationChr2:1220544..1223374
RNA-Seq ExpressionCSPI02G01760
SyntenyCSPI02G01760
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025124 - Domain of unknown function DUF4050


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022999179.1 uncharacterized protein LOC111493640 [Cucurbita maxima]1.2e-7282.61Show/hide
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XP_038889429.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X1 [Benincasa hispida]1.2e-8292.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFZ6 Uncharacterized protein3.6e-8898.76Show/hide
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A0A1S3CQL1 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X26.1e-8898.76Show/hide
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A0A1S4E5A2 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X17.5e-8694.64Show/hide
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A0A6J1G589 uncharacterized protein LOC1114508501.4e-7181.99Show/hide
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A0A6J1KGB3 uncharacterized protein LOC1114936405.6e-7382.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15350.1 unknown protein4.1e-2042.86Show/hide
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AT1G15350.2 unknown protein4.1e-2042.86Show/hide
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AT3G15770.1 unknown protein7.8e-1944.09Show/hide
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        R PS+  SEDFW+ +T D++   +      S ISTTN   +  G   + +  ++FVNHG VLW QTR +WVG+     R        L+  +T E LL +
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         K + R IPL EMV FLVE WEEEGLY
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AT5G25360.1 unknown protein1.7e-2642.42Show/hide
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        SW   L   +  C G     P I        G  +  R+   PS+SEDFWSTSTC++D       R  S IS TN+ S       + SN ++FVNHG  L
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        W QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL EMVDFLV+ WE+EGLY
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AT5G25360.2 unknown protein1.7e-2642.42Show/hide
Query:  SWFSVLIDRLLSCLGSIKPAPAI-------SGNNLNSRM---PSMSEDFWSTSTCDLDELLTLQSRQNSFISTTNHNSNHGGVIDNLSNHSDFVNHGFVL
        SW   L   +  C G     P I        G  +  R+   PS+SEDFWSTSTC++D       R  S IS TN+ S       + SN ++FVNHG  L
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Query:  WTQTRLRWVGNCVPAKRTKKNHITGLSWYMTKELLLETRKPYHRRIPLSEMVDFLVEEWEEEGLY
        W QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL EMVDFLV+ WE+EGLY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGACCCGAGAGAGCTGGTTTTCTGTTTTGATCGATCGACTTCTCTCTTGTTTAGGGAGCATTAAACCTGCACCTGCCATCTCTGGAAATAATCTGAACTCTAGGAT
GCCAAGCATGTCAGAAGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTGGATGAGCTGCTTACGCTTCAATCTCGACAGAATTCATTTATCAGCACAACAAACCATAACTCTA
ACCATGGTGGTGTCATTGACAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGTCTTCGGTGGGTCGGAAATTGTGTGCCTGCT
AAACGAACTAAAAAAAATCACATTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAGCCTTACCATCGACGCATACCTTTATCGGAAATGGT
AGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACGGTTTAGGGTTGTTAATATTAACTACTAATTAACGGTACGAAATTACTGATCATCAATTGGATCTGTTAAAACTTTCAATGCAAGTCACAATCACAATAATTTCCTA
TCCAATCCTTCCTTGTTTATCCGATTCTATCAGAAATTAGGGTTTTTGATTCGATTCCCATTTTCCCTTTCGATTTCGGTATGTTTCTGCGTTTTGATGTTTGTAATCTG
ATTTTTCGCCGAATATGGTGACCCGAGAGAGCTGGTTTTCTGTTTTGATCGATCGACTTCTCTCTTGTTTAGGGAGCATTAAACCTGCACCTGCCATCTCTGGAAATAAT
CTGAACTCTAGGATGCCAAGCATGTCAGAAGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTGGATGAGCTGCTTACGCTTCAATCTCGACAGAATTCATTTATCAGCACAAC
AAACCATAACTCTAACCATGGTGGTGTCATTGACAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGTCTTCGGTGGGTCGGAA
ATTGTGTGCCTGCTAAACGAACTAAAAAAAATCACATTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAGCCTTACCATCGACGCATACCT
TTATCGGAAATGGTAGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAAGCCAGTCAATTTAAAAAACAATCACCTTGTGCATACACTATCCTTGTGAC
TTTTTTCTTTCGTGTTTTGGAGTTCAATTCCGTGCCTACCACCTTAACTTGGGATCAGTTCGATACAAGTTTAACATACAAAATGACACCATTGGTTTGCTAACCTTTTC
GATATTGCTACAATGGAGATCTCTAAGGGGAGGGGCCAATTGTGAAGTAACCCAAAATCAAAGATCTTCCAATTGATCGGCGGGCTAAATGGTAAGCCCCCTCCGACCAA
TATACTTTATACATACATATCAAACTTTCTTCATCATTAGTTTAATATATGAAGAAGCATCAACTTTGCAGTGTGTTTGATGCAATGTTGTTGATGACTGACTTGTTGTA
ATTGTAATTAATCTCTCTAAAACAAACTCTTCTTTGTTTGGAATTCCTGATAAAAGTATCGAGATTGATTTTGTGGTGATATTGCTGTCAAATGTGTTGGATGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KRTKKNHITGLSWYMTKELLLETRKPYHRRIPLSEMVDFLVEEWEEEGLYY