; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G02450 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G02450
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationChr2:1703207..1705286
RNA-Seq ExpressionCSPI02G02450
SyntenyCSPI02G02450
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063558.1 putative serine-rich protein C215.13-like protein [Cucumis melo var. makuwa]6.1e-5799.22Show/hide
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XP_031737100.1 uncharacterized protein LOC101209679 [Cucumis sativus]2.1e-57100Show/hide
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XP_038890503.1 uncharacterized protein LOC120080038 [Benincasa hispida]4.2e-5091.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL69 Uncharacterized protein1.0e-57100Show/hide
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A0A1S4E2K6 uncharacterized protein LOC1034964921.1e-5698.44Show/hide
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A0A5A7V7K3 Putative serine-rich protein C215.13-like protein3.0e-5799.22Show/hide
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A0A6J1FCB9 uncharacterized protein LOC1114441076.4e-4482.81Show/hide
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A0A6J1HLP3 uncharacterized protein LOC1114656734.9e-4483.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein1.8e-0654.05Show/hide
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AT1G67910.2 unknown protein1.8e-0654.05Show/hide
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related6.0e-1845.29Show/hide
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        M  TS R  S+  VLRS SPSGRF G       +SSSSAFASSTS+  S  +++FF             RS SP+RVNL+ +  +S  S R+SLD R+ S
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        P N+S+SVS ++    N  + R+      CMCSPTTHPGSFRCSLHK ++     G  S T++G    +S
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related7.0e-1943.29Show/hide
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        +VSS++    +++      ++R CMCSPTTHPGSFRCSLHK ++     G  S T++G    +S
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related7.0e-1943.29Show/hide
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        T+R + ++ LRS SPSGRF G         + SSS FASSTS+  S  +T+FF           RS SP+RVNL  S  ++  S R+S+D R+ SPNRS+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCTACTTTCTCTTCCAGATCCGCCACTTCCTTCTTCTGCAGATCAACTTCCCCCTCGCGTGTGAACCTCCATGGTTCGCCTTCAGTTTCCGTTCCCTCCGTGCGGTTTT
CTCTTGACCGTGCGACCTCTCCGAACAGATCCGTCTCGGTTTCTTCTTCTCGCAGTGGTGGAACTAATCGTGTTGTGCAGAGACAGAGCAGTACGAAGAGGACGTGTATG
TGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGTCTTCATAAAGGGATATCATTGGGGATTCATTCTCTCACCAGCCATGGATGTGGATTCATTCAATCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCAAACTCAACAGCCGAACGCGGCCTTTAAGGCTTTTAGACTACAAAGCTACATTCATCCCCCCGCTCTTCTCCGACGAAAATGGCGGCAACTTCCCGAAGATCAAGCG
CATCAGTTCTTCGATCACTCTCACCGTCCGGAAGATTCTATGGTCACCGGACTTCATCTTCCTCCGCCTTTGCATCCTCTACCTCTACTTTCTCTTCCAGATCCGCCACT
TCCTTCTTCTGCAGATCAACTTCCCCCTCGCGTGTGAACCTCCATGGTTCGCCTTCAGTTTCCGTTCCCTCCGTGCGGTTTTCTCTTGACCGTGCGACCTCTCCGAACAG
ATCCGTCTCGGTTTCTTCTTCTCGCAGTGGTGGAACTAATCGTGTTGTGCAGAGACAGAGCAGTACGAAGAGGACGTGTATGTGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGT
TCCGGTGTAGTCTTCATAAAGGGATATCATTGGGGATTCATTCTCTCACCAGCCATGGATGTGGATTCATTCAATCCTGAGAAAAAGACCCAACTCTGTGCTTCTCTCTT
TTTCGATGAGGAAAAAAGGTGCACACAACCCAAGAGGTCCAAAGGAGATATGATAATAGAAACTTCAAACTGAAGGGTTAACACAAATATTCATCTTCCCCACAAAGTTA
ATACCTTACTAAGGATATGATCATATCTCTCATGGGCTATTATTCAAATTTTGATCGGATCTACTTTACAATGAAAGGACTCAATCATACTAAAGAAGGAGGTGGGGACG
TACCTCCTCGTCAACTACAATCATCTTTATTTGTATTATTGATAAGTTTTTACCTTATAAGTGTGTGGATAAGGCACAACTCAGAATGTGGGACTTTAACACAATGTCAC
ATCAAAATACGAACAATAATGAAACATAAATTATTAGAAATTCCCAATTCACATTACAATTTTAATCTAATTATAAAAATCATTCTGAGGCTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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