; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G02820 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G02820
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionHistone H1-like
Genome locationChr2:1952675..1953977
RNA-Seq ExpressionCSPI02G02820
SyntenyCSPI02G02820
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063593.1 histone H1-like [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-10092.45Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPA   AAVAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAKTK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK K  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.7e-9086.42Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPKAVA  KPK  AKSK VAKPK    AK K
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK KPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_004139246.1 histone H1 [Cucumis sativus]1.3e-11098.48Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
        HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK   AAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA

Query:  EKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKKVAPK KPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_008456174.1 PREDICTED: histone H1-like [Cucumis melo]1.0e-9992.08Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPA   AAVAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAK KPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAKTK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK K  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata]1.3e-8986.04Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPKAVA  KPK+ AKSK VAKPK    AK K
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK KPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLA4 H15 domain-containing protein1.2e-9690.11Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
        HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK   AAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA

Query:  EKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKKVAPK KPAAKAA                      KVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A1S3C278 histone H1-like5.1e-10092.08Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPA   AAVAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAK KPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAKTK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK K  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A5D3D4H1 Histone H1-like6.0e-10192.45Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPA   AAVAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA---AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAKTK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK K  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1G2W2 histone H1-like6.2e-9086.04Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPKAVA  KPK+ AKSK VAKPK    AK K
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK KPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1KEC3 histone H1-like1.3e-8784.53Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  A VA P ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKTA KPKPK VA  KPK  AKSK V KPK    AK K
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTA--AKTK

Query:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAEKVKKVAPK KPAAK AKVAKTLSR SPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H11.1e-3050.39Show/hide
Query:  VAQPAENDSKAKKAAASKASKAK--KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVK
        + +P   + +  KA   K  KAK  KP  A K R+  +HP + +MI +AIVSLKE+ GSSQYAI KF EEK KQLP+NF+KLLL +LKK VA+ KL+KVK
Subjt:  VAQPAENDSKAKKAAASKASKAK--KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVK

Query:  NSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS-KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KTVAKPKT-AAKTKAAEKVKKVAPKL
         S+KL +A             AKKP  +K KA   K AA AKS KAK AAKPK KAV KPK  + AK+      K  AKPKT AAKTK      K   K 
Subjt:  NSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS-KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KTVAKPKT-AAKTKAAEKVKKVAPKL

Query:  KPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
        K   K AKVAKT  +T+PGK+ A   K  AKKV  K  K K+VKSP +KV  ++
Subjt:  KPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK

P23444 Histone H13.3e-3253.05Show/hide
Query:  ADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLK
        A  V  + AP    A  A  D+ A  AA + A+KAKK +  KK R+SPTH P+ +M+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK +LP NFRKLL V LK
Subjt:  ADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLK

Query:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVK
        KLVA  KL KVKNSYKL SA     K  AAP   KKP     K  + K  A AK KAKT AK KP    KP  KPK V K KT AKPK  AK  A  K K
Subjt:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVK

Query:  KVAPKLKPAAK---AAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
            K KP AK    AK AKT ++ +PGK+ APA KA    +KK  T   P RK  +RK KK
Subjt:  KVAPKLKPAAK---AAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P26569 Histone H1.21.8e-3350.74Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTK--
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K  V +K K      AAVA +KAK AA    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAAK K  
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTK--

Query:  ---AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
           A  K K VA K K   + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  ---AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P37218 Histone H19.0e-3850.89Show/hide
Query:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE
        + +  AA      E +  AK   A K +KAKKP+  +K  ++PTHPP+ +MI +AIV+LKERTGSSQ+AITKF EEK K LPSNF+KLLL  LKK VA+E
Subjt:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE

Query:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTA-KKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVK-----
        KLVKVKNSYKLPS     +K AAA V A KKP ++K K A+  KAAV K KAK AAK KP A AKP  K K  AK+K  AK K AAK K   K K     
Subjt:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTA-KKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVK-----

Query:  -------------------KVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAP-ATKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
                            V P LK     AKVAKT +RT+P ++AAP AT AKK   KK   K VKSPA+K   ++ +K
Subjt:  -------------------KVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAP-ATKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK

Q9M5W4 Histone H12.7e-3456Show/hide
Query:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAK---KAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPT--HPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLK
        ++D P +A   P   + K+K   KAAA K  K KK    AKK +S  T  HP F +MIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHKQLPSNFRKLLL HLK
Subjt:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAK---KAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPT--HPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLK

Query:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKV
        KLVA+ KLVKVKNS+KLPSAR     AA AP  AKKP   K K A+  K       AK  AKPK K  AK   KT A +KTVAK   AAK KA     K 
Subjt:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKV

Query:  APKLKP-AAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARK
        A K K  AAK AKVAKT +  SPGK+       K V  KK KTVKSPA K
Subjt:  APKLKP-AAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein2.7e-2948.11Show/hide
Query:  SDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE
        +DAP    A   +  +K +K    K  K KK  + A K R+  +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP  FRKLLL++LK+LVA+ 
Subjt:  SDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE

Query:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTKAAEKVKKVAPK
        KLVKVK S+KLPSA    AKA++    A+K   +K K A++   AV K+K K AA  K K     KPKT A  K  AK K       T AA K K V  K
Subjt:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTKAAEKVKKVAPK

Query:  LKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK
         K  A+ AK AKT   TSP K+A  ATK        KK   K   KPKTVKSPA++  +R VKK
Subjt:  LKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G18050.1 histone H1-33.1e-0937.5Show/hide
Query:  KKPSGAKKAR--SSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVT
        KK   AKK R   + THPP+ QMI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +        +T
Subjt:  KKPSGAKKAR--SSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVT

Query:  AKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA
         ++   +K K    +   + K    ++ +PK K V+  K +   K K   +PK+   +   +K  K +
Subjt:  AKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA

AT2G18050.2 histone H1-37.9e-0535.62Show/hide
Query:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS
        MI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +        +T ++   +K K    +   + K 
Subjt:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS

Query:  KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA
           ++ +PK K V+  K +   K K   +PK+   +   +K  K +
Subjt:  KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.3e-3450.74Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTK--
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K  V +K K      AAVA +KAK AA    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAAK K  
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTK--

Query:  ---AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
           A  K K VA K K   + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  ---AAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein2.2e-2347.74Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEK
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K  V +K KA+  + +       K AA  K  AV K  P   AKS  V  P   A T+ A+K
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCCGCCGCTGATTCCGTCATCATCTCCGATGCTCCCGCTGCAGCGGTGGCCCAGCCAGCTGAGAACGACTCCAAGGCTAAGAAAGCTGCGGCATCGAAAGCATC
GAAGGCTAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCTAGATCTTCTCCGACTCACCCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCGTTTCTCTGAAGGAGAGAACCGGCT
CGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCACTGAAGAGAAACACAAACAATTGCCTTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTTGTTCATCTCAAAAAACTTGTCGCCGCTGAAAAA
CTCGTTAAGGTTAAGAACTCCTATAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTATTCAAGCAAAAGCCGCAGCAGCACCAGTCACCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAAACTCAAAGC
AGCAAGCATCAAGAAAGCCGCCGTTGCCAAATCGAAAGCCAAAACTGCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTTGCTAAATCCAAGA
CCGTCGCGAAACCAAAAACCGCCGCGAAGACGAAGGCAGCTGAGAAGGTTAAGAAGGTTGCTCCGAAGCTTAAACCAGCAGCCAAGGCAGCGAAAGTAGCGAAAACACTG
TCGCGAACTTCGCCAGGAAAGAGAGCCGCACCGGCGACAAAGGCGAAGAAAGTAGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGTCCAGGCAAGGAA
AGTCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCGAATTTTCTCTCTCTAAAATATTTTCCTCTCCCTCTCTTCTAATCGATTCCATTTCCAATAATGTCTTCCGCCGCTGATTCCGTCATCATCTCCGATGCTCCCGCTG
CAGCGGTGGCCCAGCCAGCTGAGAACGACTCCAAGGCTAAGAAAGCTGCGGCATCGAAAGCATCGAAGGCTAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCTAGATCTTCTCCG
ACTCACCCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCGTTTCTCTGAAGGAGAGAACCGGCTCGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCACTGAAGAGAAACACAAACA
ATTGCCTTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTTGTTCATCTCAAAAAACTTGTCGCCGCTGAAAAACTCGTTAAGGTTAAGAACTCCTATAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTA
TTCAAGCAAAAGCCGCAGCAGCACCAGTCACCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAAACTCAAAGCAGCAAGCATCAAGAAAGCCGCCGTTGCCAAATCGAAAGCCAAAACT
GCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTTGCTAAATCCAAGACCGTCGCGAAACCAAAAACCGCCGCGAAGACGAAGGCAGCTGAGAA
GGTTAAGAAGGTTGCTCCGAAGCTTAAACCAGCAGCCAAGGCAGCGAAAGTAGCGAAAACACTGTCGCGAACTTCGCCAGGAAAGAGAGCCGCACCGGCGACAAAGGCGA
AGAAAGTAGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGTCCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGAATTATGTGTTTAGGGTTTTTGATTAATTTCTAG
GGTTTTCTTATTAATAGTACGTAGCGATGTAAATTAGGGATATGATATGAGAGATGCAACCGTTCGTTGTTATACAATATTTTTATCAAATTTTAGTTTGGTAAATTCTC
AATGGTCTAACTTCAAATCAGTCTTTTCTTTTGAATGAATTGAATGATCATCTCTTTGCTTCTGGTTTATCGTTAAAGCTTTTTGAGTTTTGCTTCAATGGCGGATTTCC
CGTAATTTAAAGCGTCGTTTTGGTCGTTTATGTACATAAAACGCAAATTTCATAATCAGAACAGTTCACGTGCGTTGCACGCGATTTCGAACCCACGTCGGCACC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEK
LVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVAPKLKPAAKAAKVAKTL
SRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK