; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G03810 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G03810
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationChr2:2665291..2669348
RNA-Seq ExpressionCSPI02G03810
SyntenyCSPI02G03810
Gene Ontology termsGO:0006397 - mRNA processing (biological process)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR017907 - Zinc finger, RING-type, conserved site
IPR018957 - Zinc finger, C3HC4 RING-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047955.1 RING zinc finger protein-like protein [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-14182.8Show/hide
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XP_004139186.2 uncharacterized protein LOC101211581 [Cucumis sativus]4.6e-16299.64Show/hide
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XP_008454833.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495144 [Cucumis melo]4.3e-15294.95Show/hide
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XP_022150768.1 uncharacterized protein LOC111018833 [Momordica charantia]6.9e-13483.51Show/hide
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          + DAAKPFLSARADRF+ ELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGW++P+VPSVA +EDLGLK VTPYLYIFD DPDDG+
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XP_038889020.1 uncharacterized protein LOC120078783 isoform X1 [Benincasa hispida]2.0e-13383.39Show/hide
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        MS ++MELQSTA +E  T +S SD TNPCPICLG I Q SYLDKCFH FCYNCI+QWTKVVSGK SC LSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH  QRHYVN 
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        + +LDAAKPFLSARADRF+LELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWN+P+VP +A +EDLGLK VTPYLYIF+ DPDD
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLN5 RING-type domain-containing protein2.2e-16299.64Show/hide
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A0A1S3BZL4 uncharacterized protein LOC1034951442.1e-15294.95Show/hide
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A0A5A7U2Q2 RING zinc finger protein-like protein7.5e-14282.8Show/hide
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        MS KSMELQS ASME++T TSTSDYT+PCPICLGPINQSSYLD                        F+              NFCYNCIVQWTKVVSGK
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Query:  RSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHNFQRHYVNPDFQDSFILSKAHRYRLQCYYTEPG-FLNDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEE
        RSC LSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH+FQRHYVNPDFQDSFILSKAH+YRLQCYYTEPG FLNDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEE
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        VTPYLYIFD DPDD
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A0A5D3D454 RING zinc finger protein-like protein2.1e-15294.95Show/hide
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A0A6J1DAB4 uncharacterized protein LOC1110188333.4e-13483.51Show/hide
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        MS  +MELQSTA  EMET +S+ D TNPCPICLG I + SYLDKCFH FCYNCIVQWTKVVSGKRSC LS IKCPLCKTESSSIIHGLDGH FQRHYVN 
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Query:  DFQDSFILSKAHRYRLQCYYTEPGFLNDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHFLGLINSFFRRNEPKYQTETPELKRKRFS
        DFQDSFILSKAH+YRLQCYYTEPGFL DIF+VQRYWKL+KYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHH LGLIN FF RNE KYQTE+PE+K+++FS
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Query:  QTILDAAKPFLSARADRFILELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPIVPSVANEEDLGLKSVTPYLYIFDCDPDDGD
          + DAAKPFLSARADRF+ ELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGW++P+VPSVA +EDLGLK VTPYLYIFD DPDDG+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q80Z37 E3 ubiquitin-protein ligase Topors3.5e-1132.98Show/hide
Query:  CPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH-NFQRHYVNPDFQDSFILSKAHRYRLQCYYT
        CPICL   +  SYLD+C H FC+ C+ +W+K          +  +CPLCK    SI H +    +F+ + + P +  SF   +  R+R +   T
Subjt:  CPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH-NFQRHYVNPDFQDSFILSKAHRYRLQCYYT

Q9E1W2 E3 ubiquitin-protein ligase IE613.7e-0534.94Show/hide
Query:  TSTSD---YTNPCPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH-NFQRHYV
        TSTS     T  C IC+  I+       C H+FC+ CI  WT           +S +CPLC+T  SSI+H +    N++ + V
Subjt:  TSTSD---YTNPCPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH-NFQRHYV

Q9NS56 E3 ubiquitin-protein ligase Topors7.7e-1134.83Show/hide
Query:  CPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH-NFQRHYVNPDFQDSFIL-SKAHRYR
        CPICL   +  SYLD+C H FC+ C+ +W+K          +  +CPLCK    SI H +    +F+ + + P +  SF+   +  RYR
Subjt:  CPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH-NFQRHYVNPDFQDSFIL-SKAHRYR

Q9V8P9 E3 ubiquitin-protein ligase Topors2.8e-0531.25Show/hide
Query:  STASMEMETRTSTSDYTNP-CPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGL
        ++AS   E  T   +   P C ICL    +  + D C H FC+ C+ +W+K+            +CPLCK    +IIH +
Subjt:  STASMEMETRTSTSDYTNP-CPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39100.1 RING/U-box superfamily protein2.8e-0824.06Show/hide
Query:  CPICLGPINQ---SSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSS--IIHGLDGHNFQR--------------HYVNPDFQDSFI--
        CPICL  + +   ++ +  C H +C  CI +W+   S KR+       CPLC T   S  I+       + +              H  NP  +   I  
Subjt:  CPICLGPINQ---SSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSS--IIHGLDGHNFQR--------------HYVNPDFQDSFI--

Query:  --------LSKAHRYRLQCYYTEPGFLND--IFDVQRYWKLQKY-----------------LQANQW--------LEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHF
                 S++     +  +  PG + D  IF  +  W+   Y                 L  N +        +E W++RELQA++ + D  +I+H  
Subjt:  --------LSKAHRYRLQCYYTEPGFLND--IFDVQRYWKLQKY-----------------LQANQW--------LEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHF

Query:  LGLINSFFRRNEPKYQTETPELKRKRFSQTILDAAKPFLSARADRFILELELFLASGLNIEAYDSV
          L      R   +   +T  L     S     + + FLS + D F  EL  F  S L +E YD+V
Subjt:  LGLINSFFRRNEPKYQTETPELKRKRFSQTILDAAKPFLSARADRFILELELFLASGLNIEAYDSV

AT3G05250.1 RING/U-box superfamily protein4.3e-8154.75Show/hide
Query:  SDYTNPCPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHNFQRHYVNPDFQDSFILSKAHRYRLQCYYTE
        SD+ +PCPICLG   + SYLD CFH FC+NCI QW KVVS K S   SS+ CPLCKTE+ SIIH  DG +F+RHY++P+  D F+L+K  RYRLQCYYTE
Subjt:  SDYTNPCPICLGPINQSSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHNFQRHYVNPDFQDSFILSKAHRYRLQCYYTE

Query:  PGFLNDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHFLGLINSFFRRNEPKYQTETPELK---RKRFSQTILDAAKPFLSARADRFI
         GFL D+FDV R+WKLQK+LQ N+ LE WL+RELQAL+QEEDVDI++HH +G++ SF +R + + + ET   +   +++F   + +AA+PF+ AR DRF+
Subjt:  PGFLNDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHFLGLINSFFRRNEPKYQTETPELK---RKRFSQTILDAAKPFLSARADRFI

Query:  LELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPIVPSVANEEDLGLKS------VTPYLYIFDCDPD
         ELELFLA+GLN+EAYD++Y Q L  N       A+EE   ++       VTPYL+IF+ D D
Subjt:  LELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPIVPSVANEEDLGLKS------VTPYLYIFDCDPD

AT3G05670.1 RING/U-box protein1.9e-0437.7Show/hide
Query:  NPCPICLGPINQ---SSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSI
        N C ICL   +       LD C H FC+ CI++W+KV S          +CPLCK    +I
Subjt:  NPCPICLGPINQ---SSYLDKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGGTAAGTCCATGGAATTGCAGAGCACTGCATCAATGGAGATGGAGACAAGAACTTCCACTTCGGACTATACGAACCCTTGCCCGATCTGCCTTGGACCCATAAA
TCAATCTTCCTATCTCGACAAGTGCTTTCATAACTTTTGTTACAATTGCATTGTACAATGGACCAAAGTGGTTTCTGGGAAGCGCTCCTGCACACTTTCCTCCATTAAAT
GTCCTTTATGCAAGACAGAAAGTTCTTCTATAATACATGGATTAGATGGACACAATTTCCAAAGACATTATGTTAATCCGGATTTCCAGGATAGCTTTATCTTATCAAAA
GCTCATAGGTATAGATTACAGTGCTATTATACTGAACCAGGTTTCTTGAATGACATATTTGATGTACAGAGGTATTGGAAGTTACAGAAGTATCTCCAGGCAAACCAGTG
GCTTGAAGTTTGGTTGAAAAGGGAACTTCAAGCTTTGATTCAGGAAGAAGATGTTGACATAATTATGCATCACTTTCTTGGTTTAATTAACTCATTTTTTCGTAGAAATG
AACCTAAGTATCAAACAGAAACTCCTGAACTGAAGAGGAAGAGGTTTAGCCAAACGATTCTTGATGCAGCAAAGCCATTCCTTTCAGCAAGAGCAGATCGATTCATTCTC
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GCACACTTTCCTCCATTAAATGTCCTTTATGCAAGACAGAAAGTTCTTCTATAATACATGGATTAGATGGACACAATTTCCAAAGACATTATGTTAATCCGGATTTCCAG
GATAGCTTTATCTTATCAAAAGCTCATAGGTATAGATTACAGTGCTATTATACTGAACCAGGTTTCTTGAATGACATATTTGATGTACAGAGGTATTGGAAGTTACAGAA
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GCCGAGCGTGGCTAACGAAGAAGATCTTGGACTCAAATCTGTAACTCCATACTTGTATATCTTTGATTGTGACCCTGATGATGGTGATTAAACAAGCTCTTACAAATTGT
TATTGTTTTTGTGAAGGCAAGTCTTGTGTTATCTCCCCACCTTCCAGTATGAGTTTAATTCAAAGTTGGAATCTGTCAAGCTGTCTGGTTTAACTTTTCGTTGTTGAATT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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