; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G04290 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G04290
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationChr2:3083971..3085068
RNA-Seq ExpressionCSPI02G04290
SyntenyCSPI02G04290
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048028.1 Rapid ALkalinization Factor [Cucumis melo var. makuwa]9.9e-6196.69Show/hide
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KGN60987.2 hypothetical protein Csa_021272 [Cucumis sativus]1.5e-61100Show/hide
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XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]2.1e-5891.74Show/hide
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XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]7.9e-5890.91Show/hide
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XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]9.9e-6195.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein7.9e-64100Show/hide
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A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor4.8e-6196.69Show/hide
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A0A6J1DA82 protein RALF-like 333.9e-5587.6Show/hide
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A0A6J1FH12 protein RALF-like 331.0e-5891.74Show/hide
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A0A6J1HQE4 protein RALF-like 333.8e-5890.91Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 335.0e-3169.7Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor3.6e-2958.97Show/hide
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        P+  ++C  +   F        A  G   +  W+ P +S   CKGSI EC    EEFE DSE NRRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGA
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.4e-2866.32Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 221.5e-2756.03Show/hide
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        N+   + + A + ++ S   +T   G  +    A   +  S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GA
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        QANPYSRGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.5e-3062.07Show/hide
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        T FL    + ++F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
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        ANPYSRGC+ I RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.0e-3162.07Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 194.2e-1755.42Show/hide
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        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+NNVPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGC+ IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 221.1e-2856.03Show/hide
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        N+   + + A + ++ S   +T   G  +    A   +  S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GA
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        QANPYSRGC+ ITRCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 239.7e-3066.32Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 333.6e-3269.7Show/hide
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        TVH   A +  Q S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRN VPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTCTTATCTTCAGCTGTTCCTCAACCACCGTCCACGCCGGTCTAGGGATCCAACA
CAGTCTTGCATGGATTCCTAATCAATCTACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGGGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCAA
CTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTACGAAGGAACAACGTGCCGTGCTCAAGACGTGGTGCATCTTATTACAATTGTCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTACAGC
CGTGGATGCAACGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTTTTGTTATTTCTCCATGACGTTTCCAAAAAAAGGAATCTCATAGAATGGCATATTCGTAATTAAGTAACAAAATAAAGGGCATGTTTATAGACCACGTTCTAAATAA
GTCTTTCAATTCTCCTTCTTCACACTGTGAACTTCAAAAGCAAAGAGACGAAGCACAACCCACCGACGATTCGCCGGAGCCACCGCCGGAGCTGAATAAACTCTCAATTC
TGACTACAATACACTGACAAACGAAGTCAGACAAACTACGACCTTTTTCTTGCATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTT
CTTATCTTCAGCTGTTCCTCAACCACCGTCCACGCCGGTCTAGGGATCCAACACAGTCTTGCATGGATTCCTAATCAATCTACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTT
CGGGGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCAACTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTACGAAGGAACAACGTGCCGTGCTCAAGAC
GTGGTGCATCTTATTACAATTGTCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTACAGCCGTGGATGCAACGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGAGTAATTTGTTTGTACTCTTTG
TTTAATAATCCCTCTCTCCTTTTCAATGTTCATTGATCTTTTTCCCCCCTTTCTTTATCTTTTCTTTGATATGGCTATTGGCTTTGATTGTTATACAAATTGAAAAAGGG
GATATTGATCATATAGTGTCGTTCTTGTTGTTGTAAGTGTTGAAAGTTGTTGTGTGTTAATTAATTATATATCTCTGCTCAATAATTTGGTAGTCTTTTAGTGGCTTGAT
TGTTCATCCTTCTTTCTGTTCCTTTTTCCATGGAAGGGAAAAGGAGGAATCGGCAAAGAAAATGAGGAAGAAAACAGACTGTAATTAGTTGAAATTAGGGAGAATCATGA
GGATGAATTGATTGTTATTTTGAGTATAGTTCTCTCCTAGAAAATCTCAATGATTGTGTTTCGGGTCTTGTTTTTGGGTTTAGATGAACTTCACATGGTCATTTCTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMAGFNSPTFFLICAAVFLIFSCSSTTVHAGLGIQHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNNVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
RGCNAITRCRS