; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G06050 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G06050
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionOSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B, putative
Genome locationChr2:4578669..4579244
RNA-Seq ExpressionCSPI02G06050
SyntenyCSPI02G06050
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055564.1 putative OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B [Cucumis melo var. makuwa]8.8e-8889.58Show/hide
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KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-6271.35Show/hide
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TYK01355.1 putative OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-8890.1Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]3.4e-6371.58Show/hide
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XP_031737371.1 uncharacterized protein LOC116402243 [Cucumis sativus]1.8e-10198.95Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHA2 Uncharacterized protein3.1e-6299.16Show/hide
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A0A5A7UK88 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B4.3e-8889.58Show/hide
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A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B1.1e-8890.1Show/hide
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361411.8e-6271.05Show/hide
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923751.6e-6371.58Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40475.1 unknown protein7.6e-0548.39Show/hide
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        + +K+I + SS   SS  IYY G A   VPF WET+PGTPK     +   LPPL+PPP+  S
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AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)6.2e-1547.78Show/hide
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        MK       SSI  +S   YY     +GVPF+WE QPGTP +  P++++PPLSPPPA+LSLG+PKP   I++PK+   P +++LR WK +
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B6.2e-1547.78Show/hide
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AT5G01790.1 unknown protein2.2e-0452.17Show/hide
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        S  IYY   A   VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGGAAATTATGTCATTGGGATATGAAGAACAAAGTTATATCAAGAACATCTTCGATTGGTTATTCTTCTCATAGCATTTATTACTCTGGAACAGCTGATCAAGG
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AACCCTACATCGATCAACCAAAATCTCGACCCCTACCTCGGATGAGACTTAGGTTTTGGAAGAAAATCATGAAGAGTAGGGATGGTGGAAAAGCCGCTGCTCAAACAACA
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GTCATCTTCTTCATCTCCGTCATCTTTCCTCGATTCGTTAAATGTTCGAAATATGAGGAAGGTTTCATTTGGAAGGCCTTCAAGTTGGAATAATGCTTGGCAAATTAATA
AAATGCTGGCTTGTTACCATGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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