; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G06060 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G06060
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description40S ribosomal protein S8
Genome locationChr2:4583090..4585589
RNA-Seq ExpressionCSPI02G06060
SyntenyCSPI02G06060
Gene Ontology termsGO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001047 - Ribosomal protein S8e
IPR018283 - Ribosomal protein S8e, conserved site
IPR022309 - Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2
IPR042563 - Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055563.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo var. makuwa]4.8e-11498.62Show/hide
Query:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
        ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
Subjt:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI

Query:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
        VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
Subjt:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE

Query:  FYMKKLQRKKGKGAGAA
        FYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  FYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_004148331.1 40S ribosomal protein S8 [Cucumis sativus]5.1e-11699.54Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_008451649.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo]2.5e-11598.63Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]2.6e-11296.35Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]2.0e-11296.35Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS KK+EEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQF SGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJA0 40S ribosomal protein S82.5e-11699.54Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A1S3BRZ4 40S ribosomal protein S81.2e-11598.63Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5A7UI08 40S ribosomal protein S82.3e-11498.62Show/hide
Query:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
        ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
Subjt:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI

Query:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
        VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
Subjt:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE

Query:  FYMKKLQRKKGKGAGAA
        FYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  FYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S81.2e-11598.63Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S81.3e-11296.35Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKR+QDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81361 40S ribosomal protein S84.4e-10286.82Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVK-KEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV+IGRKKKT+A+ K   EEG+A TEE KKSNHV  K+EKR+Q R LD HIEEQF  G+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEGK
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVK-KEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK

Query:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S81.3e-10186.43Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKK  A+ KK+ EG   +A TEE KKSNHV RK+EKR+Q R LD HIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S87.5e-10285.52Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKKT A+ K   EG   +A  EE KKSNHV RK+EKR++ R LDPHIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-15.5e-9781Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  R++ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-25.5e-9783.11Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E R++ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein3.9e-9881Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  R++ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein3.9e-9883.11Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E R++ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTATTTCCCGTGATTCTATGCACAAAAGGCGTGAAACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACCAA
GTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGAGGGGGTAATGTGAAGTGGCGTGCGTTTAGGCTGGATACTGGAAATTACTCTTGGGGTAGTGAGGCCGTGA
CTAGAAAGACCCGTCTTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAACGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTAGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTT
AAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGCGTGGATATTGGCCGGAAGAAGAAGACCTCTGCATCTGTTAAGAAGGAAGAGGAAGGCGATGCTGGCACTGAGGAGGTAAAGAA
GAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCGGCAGGACCGCAAGCTTGACCCACATATTGAAGAACAATTCAGCAGTGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAA
GGCCTGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATCTTGGAGGGCAAAGAGCTCGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACAAACTGAAAGCAAATTAAACCTAACCCTCGCCGCATCAAAACCCTTCTCAGCCCCCTCCATTCTCTCTCTCGACCTTCTCTCGATCGTTCAAGGAATCCTAGACTCG
TCTTTACTCCGAGAGCCCACGTCTTACCAAGATGGGTATTTCCCGTGATTCTATGCACAAAAGGCGTGAAACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGCGAAAGT
ATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACCAAGTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGAGGGGGTAATGTGAAGTGGCGTGCGTTTAGGCTGGATACT
GGAAATTACTCTTGGGGTAGTGAGGCCGTGACTAGAAAGACCCGTCTTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAACGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTAGTGAAGAG
TGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTTAAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGCGTGGATATTGGCCGGAAGAAGAAGACCTCTGCATCTGTTAAGAAGGAAGAGG
AAGGCGATGCTGGCACTGAGGAGGTAAAGAAGAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCGGCAGGACCGCAAGCTTGACCCACATATTGAAGAACAATTCAGC
AGTGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAAGGCCTGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATCTTGGAGGGCAAAGAGCTCGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAG
AAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCTTAAATTTTGGTTATGGTTTCAGCCAGTATTTTCCTGTTCACTCCTTTTCTTATGAAGACAACGAGCTGTTGCAGCTATTTTG
GAACTTTGATTTTGCTGGTAATAGTTTAATTATAGTACCTTTGACCTTTTTTCATGGTAACAACAGTTTGCTTAATTAGCTTGAGTTTAAGTTCAAAATTTTCTAGTCAA
TTTATGTAAGCGGGTTGGTTTGGTTGTTTGATCTAGAATTTATAGAAGTACAAATGGATTATAGAGTGATTTAAACTCACACTGCTTCTTTTAAAACCAATTTCGCTGAA
TTTCTCACTTTATAATTTTTGTTATGTCTCTGAAAGTTCGAAGTTTCCAATTCTTCTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPF
KQWYLQHYGVDIGRKKKTSASVKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRRQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA