; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G07220 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G07220
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationChr2:6062224..6064060
RNA-Seq ExpressionCSPI02G07220
SyntenyCSPI02G07220
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001267647.1 photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic [Cucumis sativus]5.6e-115100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHJ8 PSI subunit V2.7e-115100Show/hide
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A0A1S3B555 PSI subunit V7.9e-11599.08Show/hide
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V3.7e-11296.77Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V1.4e-11195.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic4.0e-7970.18Show/hide
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P51222 Photosystem I reaction center subunit XI3.0e-3450Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic2.8e-11799.54Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.7e-9076.71Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic8.2e-9378.54Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12800.1 photosystem I subunit l5.8e-9478.54Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACTGCAACCTCTCCCATTGCCAGCCAGCTCAGTTCCAGCTTCGCTTCATCCAACACGAGAGCTTTGATCTCTCCTAAAGGCCTCTCCGCTTCGCCCCTCCGACG
CATCCCTACAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCGACTTTCCAAGTGATTCAGCCGATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGA
CTCCAGTAACCTCAAGCCCACTGATAGCATGGTATCTTTCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTGAGGGGAATAGAAGTGGGCCTGGCTCACGGT
TTCTTTCTGGTTGGTCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCAGGCTCGCTGGCTGCTGGGGGTCTCATTGTCATTTTGAGCGTCTG
CTTGACAATGTATGGTGTTGCATCATTCAATGAAGGAGAGCCATCTACCGCACCATCATTGACTTTGACTGGCCGGAAGAAGACCCCTGATCCTCTCCAAACAGCCGATG
GGTGGGCAAAATTCTCAGGCGGGTTTTTCTTCGGTGGTATCTCCGGTGTGATCTGGGCATACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTCCCTTACTACGTCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCAACCCCTGTCCATTTACCAAATAGGGGGAGAGGGCCAAATCTAAATCTTTTCAAGTTCCAAATCCATATGGTTCATCTTAAGAGAGAAGAGATCCAAATCCAAATC
TTTGAAGCTCACATGGGCTATAGCCCATTCTCATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGCCAAATCCAAATCTCTGACTTTCTCATGAGAGAGAAAGAAATGGATA
AGGGATAAGGTTACGTGGCAAGTTCTATCCAATGAGAAGAGAAAGGTTTGATCAACCACAGCCTCCCACAAATTTCCATGGCCAGTGACAACCAACAACAAGAACTTAAA
CTAACCCCCAAAACCAAATCTAAAAATCTCACCTCAATCTTCTTCTCTGCCACTGATCCTTCCACAAGCCAAAGGCAGCAGAAGCAAAAGCAGCAGCCATGGCCACTGCA
ACCTCTCCCATTGCCAGCCAGCTCAGTTCCAGCTTCGCTTCATCCAACACGAGAGCTTTGATCTCTCCTAAAGGCCTCTCCGCTTCGCCCCTCCGACGCATCCCTACAAG
AACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCGACTTTCCAAGTGATTCAGCCGATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGACTCCAGTAACCT
CAAGCCCACTGATAGCATGGTATCTTTCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTGAGGGGAATAGAAGTGGGCCTGGCTCACGGTTTCTTTCTGGTT
GGTCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCAGGCTCGCTGGCTGCTGGGGGTCTCATTGTCATTTTGAGCGTCTGCTTGACAATGTA
TGGTGTTGCATCATTCAATGAAGGAGAGCCATCTACCGCACCATCATTGACTTTGACTGGCCGGAAGAAGACCCCTGATCCTCTCCAAACAGCCGATGGGTGGGCAAAAT
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TTTCTACAATGCAACTTCCATGTCTGTATTATGGAAACATAAAATTGTATATTTTCTGCCAAACCTCTTTGTTAGATCCTTTGTGATTGCATATCGATTTCCTTTTTGGA
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